Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001657.4

Sequence Length

1234 nt

GC Content

0.4530

AGACGUUCGCACACCUGGGUGCCAGCGCCCCAGAGGUCCCGGGACAGCCCGAGGCGCCGCGCCCGCCGCCCCGAGCUCCCCAAGCCUUCGAGAGCGGCGCACACUCCCGGUCUCCACUCGCUCUUCCAACACCCGCUCGUUUUGGCGGCAGCUCGUGUCCCAGAGACCGAGUUGCCCCAGAGACCGAGACGCCGCCGCUGCGAAGGACCAAUGAGAGCCCCGCUGCUACCGCCGGCGCCGGUGGUGCUGUCGCUCUUGAUACUCGGCUCAGGCCAUUAUGCUGCUGGAUUGGACCUCAAUGACACCUACUCUGGGAAGCGUGAACCAUUUUCUGGGGACCACAGUGCUGAUGGAUUUGAGGUUACCUCAAGAAGUGAGAUGUCUUCAGGGAGUGAGAUUUCCCCUGUGAGUGAAAUGCCUUCUAGUAGUGAACCGUCCUCGGGAGCCGACUAUGACUACUCAGAAGAGUAUGAUAACGAACCACAAAUACCUGGCUAUAUUGUCGAUGAUUCAGUCAGAGUUGAACAGGUAGUUAAGCCCCCCCAAAACAAGACGGAAAGUGAAAAUACUUCAGAUAAACCCAAAAGAAAGAAAAAGGGAGGCAAAAAUGGAAAAAAUAGAAGAAACAGAAAGAAGAAAAAUCCAUGUAAUGCAGAAUUUCAAAAUUUCUGCAUUCACGGAGAAUGCAAAUAUAUAGAGCACCUGGAAGCAGUAACAUGCAAAUGUCAGCAAGAAUAUUUCGGUGAACGGUGUGGGGAAAAGUCCAUGAAAACUCACAGCAUGAUUGACAGUAGUUUAUCAAAAAUUGCAUUAGCAGCCAUAGCUGCCUUUAUGUCUGCUGUGAUCCUCACAGCUGUUGCUGUUAUUACAGUCCAGCUUAGAAGACAAUACGUCAGGAAAUAUGAAGGAGAAGCUGAGGAACGAAAGAAACUUCGACAAGAGAAUGGAAAUGUACAUGCUAUAGCAUAACUGAAGAUAAAAUUACAGGAUAUCACAUUGGAGUCACUGCCAAGUCAUAGCCAUAAAUGAUGAGUCGGUCCUCUUUCCAGUGGAUCAUAAGACAAUGGACCCUUUUUGUUAUGAUGGUUUUAAACUUUCAAUUGUCACUUUUUAUGCUAUUUCUGUAUAUAAAGGUGCACGAAGGUAAAAAGUAUUUUUUCAAGUUGUAAAUAAUUUAUUUAAUAUUUAAUGGAAGUGUAUUUAUUUUACAGCUCAUUAAACUUUUUUAACCAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-352.20 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -374.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 293.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((..(((((.((....)))))))..))...(.(((((((((.(((((((((...((.((...(.(((((.....((((((..(((((((.....((.(((((((.....((.............))......(((.(((((((((.(((.....)))))))))))))))))))))).))...))))))).))))))......).)))).).)).))...)).)))))))..))).)))))).)((((((.....(.((((((((((((.((.((((...(((.((((((((.(((((.((...)).)).)))...)))....))))).))))))))))))))).)))))).)....)))))).)))).))))))...((.(((((...((((..(((((.....(((((((((((((((....(((..((((...))))..))))))))).))))).))))..((((..(((......((((((((..(((......)))..)))))).))......))).)))).((((((((..........)).(((((....))))).........................))).)))......................................(((.((.(((((((((.........))))))))))).)))...(((...........)))((((....((((...((((...(((.((((.(.(((((((.((....(.((((((................)))))).).((((.(((....))).))))....((((....))))((.(((((.((((((((((((.((((.((.((..(((((..(((((....))))).)))))..)).))...)))).)))...)))))))))...))))).))..((((......))))........)).))))))).).))))))))))).))))............))))...)))))..))))))))).))((((...((((((..((((((((..((((((((((((...)))....))))....)))))...)))))))).))))))....))))....((((((((((((((((.......))))).))))))).)))).((((((((((.........(((((((((.(((.(((((............))))).)))...)))))))))......)))))))..)))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{(.((((..(((((((({(,...}))))}.(((((((.(.(((((((((.((((((({(...((.((...(.((((,,...,((((((..(((((((,....((.(((((((.....{,.......,.....,,..}}..(((.(((((((((.(((.....)))))))))))))))))))))).)).,.))))))).)))))).,....}.)))).,.)).))...})}}))))))..))).)))))).),,..,....{{(((...{|{.....,}|}}}})}...))))))).,{{...(({,...}))}.,,})),..((((((((({{,..|,.,..((((((((.{,{(((({...})))},{{{{,,,,....)))).(((((......)))))((((((((...(((((((((((((((....(((..((((...))))..))))))))).))))).))))..,,{{..{((,,....((((((((..(((,....,}}}..}))))).)),...,,})).}}}}.((({(((,..........||.,,,(({,...,,))),.......,,..............))).)))....,{,,,.............................|||,|(.(((((((((.........)))))))))}).}}}...,,{...........}||||||...{||,...,.|||..,,||,.}|,.,....}))}}}))..},,}||||({,....))).,....))))))))..((((.(((....))).))))....,}.)))))))).((.(((((.((((((((({({{((((.{{.{(..(((((..(((((....))))).)))))..)}.)),..}}}).)))...}))))))))...))))).))..((((......)))).,.)))))))))..(((((((.(..(((((((((..{,,({{{,.....{{((({.((,,..|||,}}}.}}}..{(((.,.{(((({..{((({(({..(((((,,{|{{|.||)}}.,,,,,)}.,..)))))...}))))))).))))))....)))}....)))))..,,.)))))))))..))))))))..)))))..)))),||(((((((..,,.....((((((((({((,.(((({..,,,...,},.)))}).}.)})})))))))))....)})))))))...,,...