Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001672.3
Sequence Length
653 nt
GC Content
0.6018
AGCAAAUCUCUACAGCUGCAAGGUGAAAAAGGAAGUUCCUUGGCCUGGGCUCUUUGCGGGAAAGCAUGCCUCCUGGGAUGGAUGUCACCCGCUUACUCCUGGCCACCCUGCUGGUCUUCCUCUGCUUCUUCACUGCCAACAGCCACCUGCCACCUGAGGAGAAGCUCCGAGAUGACAGGAGCCUGAGAAGCAACUCCUCUGUGAACCUACUGGAUGUCCCUUCUGUCUCUAUUGUGGCGCUGAACAAGAAAUCCAAACAGAUCGGCAGAAAAGCAGCAGAAAAGAAAAGAUCUUCUAAGAAGGAGGCUUCGAUGAAGAAAGUGGUGCGGCCCCGGACCCCCCUAUCUGCGCCCUGCGUGGCCACCCGCAACAGCUGCAAGCCGCCGGCACCCGCCUGCUGCGACCCGUGCGCCUCCUGCCAGUGCCGCUUCUUCCGCAGCGCCUGCUCCUGCCGCGUGCUCAGCCUCAACUGCUGAGCGCCCCCACUCCCGGCCGCGAGCAGGCAGGGCUUCGGGGACGCGGGGCGCUUCUCGGGCGGGUGAUCCCUAACAGGGCGGCUUCCCAGGGCUGCAGGCGGGCGGAGGUUCCAGGAGAUGGGACUUCAGGGAGACCUGGCUUGGGCUAAAAUCGAAAUACAAUAUAUAUAGGCUGCU

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-258.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -268.69
Frequency: 0.0000
Diversity: 94.08
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
............(((((.....(((...(((((...)))))((((.(((......(((((....(((.((....)).))).......)))))....))).)))).(((.(((((((((((((((((.(((..(((((..((((.....(((((....(((((.(((((.........)))))...(((((..(((((...(((....))).))).))..))))).)))))...)))))))))........(((......))).)))))..))).))))))..........(((((...((((....))))...)))))....(((.((....)).)))((((..(((((((((((.(.((((.((((((.....)))..(((...)))(((((((((..(((.(((((((.(((((((((.((((.((.......)).)))).((((((.((((.(((((((((.......))))))))).........)))).).))))))))))))....)).).)))))).)))....)))))))))...........))).)))).).)))))).))))).))).)(((((((((.....))))))))).)))))))).)))..))).................))).....)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
............(((((.....{{,...{((((...))))}((((.(((......(((((...,(((.((,,..}},)}).,},}..)))))..,.})).)))),(((.(((((((((((((((((.(((..(((((..((((.....(((((....(((((.(((((.........)))))...(((((..(((((...({{....})}.))).))..))))).)))))...)))))))))........{((......))).)))))..))).)))))}..........(((((...((((....))))...)))))..,.(((.((....)).))){{((,.(((((((((((.(.(({{.{{{{{....,,||,,{((({{{{{((((((((((..(((.((({(((,(((({.(((..,((.((.......)).))(((((((((.((((.(((((((((.......))))))))).........)))).).))))))))..)))...)))).)))))),)))....))))))))))..,,......,))})))),,.)))))).))))).))).}(((((((((.....))))))))),)))))))).)))..)))...................,.....)))))..
Back