Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001769.4
Sequence Length
1225 nt
GC Content
0.4506
AGCCGCCUGCAUCUGUAUCCAGCGCCAGGUCCCGCCAGUCCCAGCUGCGCGCGCCCCCCAGUCCCGCACCCGUUCGGCCCAGGCUAAGUUAGCCCUCACCAUGCCGGUCAAAGGAGGCACCAAGUGCAUCAAAUACCUGCUGUUCGGAUUUAACUUCAUCUUCUGGCUUGCCGGGAUUGCUGUCCUUGCCAUUGGACUAUGGCUCCGAUUCGACUCUCAGACCAAGAGCAUCUUCGAGCAAGAAACUAAUAAUAAUAAUUCCAGCUUCUACACAGGAGUCUAUAUUCUGAUCGGAGCCGGCGCCCUCAUGAUGCUGGUGGGCUUCCUGGGCUGCUGCGGGGCUGUGCAGGAGUCCCAGUGCAUGCUGGGACUGUUCUUCGGCUUCCUCUUGGUGAUAUUCGCCAUUGAAAUAGCUGCGGCCAUCUGGGGAUAUUCCCACAAGGAUGAGGUGAUUAAGGAAGUCCAGGAGUUUUACAAGGACACCUACAACAAGCUGAAAACCAAGGAUGAGCCCCAGCGGGAAACGCUGAAAGCCAUCCACUAUGCGUUGAACUGCUGUGGUUUGGCUGGGGGCGUGGAACAGUUUAUCUCAGACAUCUGCCCCAAGAAGGACGUACUCGAAACCUUCACCGUGAAGUCCUGUCCUGAUGCCAUCAAAGAGGUCUUCGACAAUAAAUUCCACAUCAUCGGCGCAGUGGGCAUCGGCAUUGCCGUGGUCAUGAUAUUUGGCAUGAUCUUCAGUAUGAUCUUGUGCUGUGCUAUCCGCAGGAACCGCGAGAUGGUCUAGAGUCAGCUUACAUCCCUGAGCAGGAAAGUUUACCCAUGAAGAUUGGUGGGAUUUUUUGUUUGUUUGUUUUGUUUUGUUUGUUGUUUGUUGUUUGUUUUUUUGCCACUAAUUUUAGUAUUCAUUCUGCAUUGCUAGAUAAAAGCUGAAGUUACUUUAUGUUUGUCUUUUAAUGCUUCAUUCAAUAUUGACAUUUGUAGUUGAGCGGGGGGUUUGGUUUGCUUUGGUUUAUAUUUUUUCAGUUGUUUGUUUUUGCUUGUUAUAUUAAGCAGAAAUCCUGCAAUGAAAGGUACUAUAUUUGCUAGACUCUAGACAAGAUAUUGUACAUAAAAGAAUUUUUUUGUCUUUAAAUAGAUACAAAUGUCUAUCAACUUUAAUCAAGUUGUAACUUAUAUUGAAGACAAUUUGAUACAUAAUAAAAAAUUAUGACAAUGUCCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-378.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -400.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 287.44
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((((((((....((((((.(((((((((((((((((((((.((..(((((((((((......(((((((((.......(((((..((((.((..((((..((.(((.((....(((.......((.((...(((((.............)))))...)).))...))).((((........))))...((((((((((.((((((.......))))....(((......)))...................((((((....))))))......)).)))))))))))).)))))..))))))))))))))).))))))))).)))))))))).)..)).))....))))).))))))))))......((((...((.((((((...))))))..))...))))))))..))))))))))))........))))))))))..........(((((((......((((((.((..(((((((((...((((..(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......))).))))..))))).(((((..(((...((((.....)))).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.(..((((...)))).).))).))))(((((.(((((((((...(((......(((((...((((...)))).(((((((........)))))))(((((.((.(((((((((((((.....)))))....)))))))).)))).)))((.(((((......)))))..)).......)))))...)))..))))))))).))))).))))))))).....))))...)))))))))..)).))))))..((((....)))).........((((((..((((((..(((((((...))))).))))))))..)))))).............((((((((((..(((((.((((..........)))).)))))....((((((.((((..(((((((((((......)))))))))))...))))))))))((((.(((((((((((...)))).).)))))).))))(((((((....)))))))...........))))))))))...........((((((((((..(((......))))))))))))).((((((.....))))))......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((.(((((((((((....((((((.((((((((((((((((((({,,((,.(((((((((((...,..(((((((((.......(((((..((((.((..((((..{(,(((.((....(((,{..,..({,({.|,{{(((.............}||||...}),))}},}},.((((........))))...((((((((((.((((((.......})))..,,{{{......}}}..............,,...{{{{{{....})))))......}}.)))))))))))).))))),.))))))))))))))).))))))))),)))))))))).)..)).))....))))).))))))))))......((((...((.((((((...))))))..))...))))))))..))))))))))))........))))))))))..........{((((((.....,(((((({({..(((((((((..,((((.,(((((((((..(((((.....)))))..(((((.((((...(((......})),))))..))))).((((({.(({...({{{.....}}}).))))))))..(((((.((....))...))))).....((((.(((.{..((((...)))).}.))).)))){((((.{((((((((,.,{((,,|,,,(((((,,.((((...)))),{((((((........))))))|{({((.((.(((((((({({((,....})))}....)))))))).)))).))}||.(((({......}))}).,|,.......))}}),..))}..))))))))).))))).))))))))}}}}},))))}}})),))))}),})).,,,|||{,((((,,.{(((((({......((((((..((((({{,{{{((({...,)))}.})))))))..)))))).......}))))))}.||,.|}|}}||,}}}|((((((((((......{(({....,,{((((({,((((..(((((((((((......)))))))))))...))))))))))}|)))}.,...))))))))))||{{{{({,|{{,|.,.....|.,,,..)))))))}....{((((({....)))))))........((((((((((..(({......))))))))))))).((((((.....))))))..,,..))))))}
Back