Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001770.6
Sequence Length
1918 nt
GC Content
0.5954
AAGCUGGGUGCCCCGGAGAGUCUGACCACCAUGCCACCUCCUCGCCUCCUCUUCUUCCUCCUCUUCCUCACCCCCAUGGAAGUCAGGCCCGAGGAACCUCUAGUGGUGAAGGUGGAAGAGGGAGAUAACGCUGUGCUGCAGUGCCUCAAGGGGACCUCAGAUGGCCCCACUCAGCAGCUGACCUGGUCUCGGGAGUCCCCGCUUAAACCCUUCUUAAAACUCAGCCUGGGGCUGCCAGGCCUGGGAAUCCACAUGAGGCCCCUGGCCAUCUGGCUUUUCAUCUUCAACGUCUCUCAACAGAUGGGGGGCUUCUACCUGUGCCAGCCGGGGCCCCCCUCUGAGAAGGCCUGGCAGCCUGGCUGGACAGUCAAUGUGGAGGGCAGCGGGGAGCUGUUCCGGUGGAAUGUUUCGGACCUAGGUGGCCUGGGCUGUGGCCUGAAGAACAGGUCCUCAGAGGGCCCCAGCUCCCCUUCCGGGAAGCUCAUGAGCCCCAAGCUGUAUGUGUGGGCCAAAGACCGCCCUGAGAUCUGGGAGGGAGAGCCUCCGUGUCUCCCACCGAGGGACAGCCUGAACCAGAGCCUCAGCCAGGACCUCACCAUGGCCCCUGGCUCCACACUCUGGCUGUCCUGUGGGGUACCCCCUGACUCUGUGUCCAGGGGCCCCCUCUCCUGGACCCAUGUGCACCCCAAGGGGCCUAAGUCAUUGCUGAGCCUAGAGCUGAAGGACGAUCGCCCGGCCAGAGAUAUGUGGGUAAUGGAGACGGGUCUGUUGUUGCCCCGGGCCACAGCUCAAGACGCUGGAAAGUAUUAUUGUCACCGUGGCAACCUGACCAUGUCAUUCCACCUGGAGAUCACUGCUCGGCCAGUACUAUGGCACUGGCUGCUGAGGACUGGUGGCUGGAAGGUCUCAGCUGUGACUUUGGCUUAUCUGAUCUUCUGCCUGUGUUCCCUUGUGGGCAUUCUUCAUCUUCAAAGAGCCCUGGUCCUGAGGAGGAAAAGAAAGCGAAUGACUGACCCCACCAGGAGAUUCUUCAAAGUGACGCCUCCCCCAGGAAGCGGGCCCCAGAACCAGUACGGGAACGUGCUGUCUCUCCCCACACCCACCUCAGGCCUCGGACGCGCCCAGCGUUGGGCCGCAGGCCUGGGGGGCACUGCCCCGUCUUAUGGAAACCCGAGCAGCGACGUCCAGGCGGAUGGAGCCUUGGGGUCCCGGAGCCCGCCGGGAGUGGGCCCAGAAGAAGAGGAAGGGGAGGGCUAUGAGGAACCUGACAGUGAGGAGGACUCCGAGUUCUAUGAGAACGACUCCAACCUUGGGCAGGACCAGCUCUCCCAGGAUGGCAGCGGCUACGAGAACCCUGAGGAUGAGCCCCUGGGUCCUGAGGAUGAAGACUCCUUCUCCAACGCUGAGUCUUAUGAGAACGAGGAUGAAGAGCUGACCCAGCCGGUCGCCAGGACAAUGGACUUCCUGAGCCCUCAUGGGUCAGCCUGGGACCCCAGCCGGGAAGCAACCUCCCUGGGGUCCCAGUCCUAUGAGGAUAUGAGAGGAAUCCUGUAUGCAGCCCCCCAGCUCCGCUCCAUUCGGGGCCAGCCUGGACCCAAUCAUGAGGAAGAUGCAGACUCUUAUGAGAACAUGGAUAAUCCCGAUGGGCCAGACCCAGCCUGGGGAGGAGGGGGCCGCAUGGGCACCUGGAGCACCAGGUGAUCCUCAGGUGGCCAGCCUGGAUCUCCUCAAGUCCCCAAGAUUCACACCUGACUCUGAAAUCUGAAGACCUCGAGCAGAUGAUGCCAACCUCUGGAGCAAUGUUGCUUAGGAUGUGUGCAUGUGUGUAAGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUGUAUACAUGCCAGUGACACUUCCAGUCCCCUUUGUAUUCCUUAAAUAAACUCAAUGAGCUCUUCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-817.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -849.40
Frequency: 0.0000
Diversity: 361.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..((((...((((...))))..))))..))..(((((((((.(((((....((((((((((((((.......(((......(((((((((((.((((..(((((..(((.(((((.(((((....((......)).(((((((((((((((..(((..(((((((((((((((((..((((....))))....((((((....((((((.....((((((((..(((((((((((((((((((.(((...((((((...)))).))))).)))))............(((((...((.((((((((((...(((...)))..))))))))))))))))))))))))))))))))))))...)))......)))))).))))))((((.((((((((((((((....((...(((((.(((((((((((((((((.......((((((...))))))...((((((((((((((...((((.(.((((((.((.....)).)))).........))).)))).)))))))))).))))(((.(((.....))).)))((((((((.((....(((((...((((((......)).))))....))))).....)).))))))))...((((...((((((((.....)).)))))).))))(((((...(((((((((.........((((....(((...(((........))).....)))....)))).........)))))))))...))))).((((........))))))))))))))))))..(((.(((.((......)).))).)))))).))))).))....))))))))).)))....)).)))).((((......))))...))))))))))...))).))))((((((((..(((((......))))).....))))))))..))).))))))))).))))))))))).))))).....((.((..((((....))))..))...)).........))).))))))))).))))))........((.(((....))).)))))))..(((..(((((((....)))))))..))).(((((.(((.((((((((((..(.((.(((((....))))))))))))))))))(((...((.(((......(((..((((((..((..(((((....)))))..)))))))).)))))).))..)))))).))))).)))......))))))))))))))....)))))........)))))))))..(((..(((((((((((.....((((....))))(((((((.(((((((((((.((((....)))).......)))).))).)))).....))))))).(((.((((....))))))).........)))))).)))))..))).((((((((((((.....))))(((((((.........))))).))(((((((((.....((((((((((((..(((......)))..)))))))))))).))))))))).(((..(((((((.(...((((.((((((...(((((((((....)))))....((((.((((.((..(.(((..((.((..(((....)))....)).))..))))))))))))))..(((...)))))))..)))))).))))((((((((((....))))))).)))((((((.....))))))((((.(((..(((....(((((((..........)).)))))...)))...))).)))).((((..((.(((.(((((....))))).))).))..))))...((.((((((...((.(((((((((....)))))))))))...)))))).)).........).)))))))..))).........))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((..((((...((((...})))..))))..))..(((((((((.(((((....((((((((((((((..{,,..,||...,{{(((((((({.,(({...,.|||(..(((({..{.((((((....((,,,...))||((((((((((((((..(((..((((((((((((((((({.((((,,,.|}}},{{(((((((....((((((.....{{((((((..((((((((((((((((({{.({{...{{(({{...||||.},})),)}}}}............((({..,(((.((((((((((...(((...)))..)))))))))))))))))))))))))))))))))))),..|}}...,}.)))))).)))))))|{|,,{{({(((((((((....((...(((((.(((((((((((((((((...{{((((((((...})))}}...(((((((((((((|..,({((,(.((((,,.((.....)).})))|,.......))}})))).)))))))))).)))),,,.{{{,,|{{|{|...(((((((((.((....(((((...((((((......)).))))....))))).....)).)))))))))}}||||.,,((((((((.....))},))))).||||(((((...(((((((((.........((((....(((...(((........))).....)))....)))).........)))))))))...))))).))),.,,,}.}},,,,))))))))))))))..(((.(({.,{......}).))}.)}}))).))))).))....))))))))).)))},.,}..}},,.((((......))))..,))))))))))...))).))))((((((((..(((((......))))).....))))))))..))).))))))))).)))))}|{{{....,...,}},((((...(((((.(((((..........((((..(((.......))),.,}))).,,....,....)))))..)))))...))))....,,..(((((((....))))))),,)))))),.},,)))))||||||||}}|.{({(((({....)))))))},))))))}(((((...))))).,,....{{{..((((((..((..(((((....)))))..)))))))).}|}|((.{{{{{|,,,,.)))))))).......))))))))))))))....)))))........)))))))))..(((..(((((((((({.,...{(((....}))}(((((((,(((((((((((.,{,,..{{,,,.}}.....)))).))).))))...,.))))))).(((.((((....)))))))........})))))),}))))..))).((((((((((((({...||,,(((((((.........))))).))||,,,||||}},|.((((((((((((..(((......)))..)))))))))))).}}},||||}.(((..(((((({.{...((((.((((((,..(((((((((....)))))....((((.((({,((..(.(((..((.((..(((....)))....)).))..)))))))))))))).{({,...}))))}),.)))))).))))((((((((((....))))))).))){(((((.....))))))((((.(((.,(((..,.{((((((..........))}}}))),..))}.}.))).)))).((((,.((.(((.{((((....))))).))).)),.)))),..{(.((((((...((.(((((((((....)))))))))))...)))))).)).........}.)))))))..))}..}}},...))))))))...
Back