Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001823.5
Sequence Length
1420 nt
GC Content
0.6408
GUUCGCCUGCGUCGCUCCGGGAGCUGCCGACGGACGGAGCGCCCCCGCCCCCGCCCGGCCGCCCGCCCGCCGCCGCCAUGCCCUUCUCCAACAGCCACAACGCACUGAAGCUGCGCUUCCCGGCCGAGGACGAGUUCCCCGACCUGAGCGCCCACAACAACCACAUGGCCAAGGUGCUGACCCCCGAGCUGUACGCGGAGCUGCGCGCCAAGAGCACGCCGAGCGGCUUCACGCUGGACGACGUCAUCCAGACAGGCGUGGACAACCCGGGCCACCCGUACAUCAUGACCGUGGGCUGCGUGGCGGGCGACGAGGAGUCCUACGAAGUGUUCAAGGAUCUCUUCGACCCCAUCAUCGAGGACCGGCACGGCGGCUACAAGCCCAGCGAUGAGCACAAGACCGACCUCAACCCCGACAACCUGCAGGGCGGCGACGACCUGGACCCCAACUACGUGCUGAGCUCGCGGGUGCGCACGGGCCGCAGCAUCCGUGGCUUCUGCCUCCCCCCGCACUGCAGCCGCGGGGAGCGCCGCGCCAUCGAGAAGCUCGCGGUGGAAGCCCUGUCCAGCCUGGACGGCGACCUGGCGGGCCGAUACUACGCGCUCAAGAGCAUGACGGAGGCGGAGCAGCAGCAGCUCAUCGACGACCACUUCCUCUUCGACAAGCCCGUGUCGCCCCUGCUGCUGGCCUCGGGCAUGGCCCGCGACUGGCCCGACGCCCGCGGUAUCUGGCACAAUGACAAUAAGACCUUCCUGGUGUGGGUCAACGAGGAGGACCACCUGCGGGUCAUCUCCAUGCAGAAGGGGGGCAACAUGAAGGAGGUGUUCACCCGCUUCUGCACCGGCCUCACCCAGAUUGAAACUCUCUUCAAGUCUAAGGACUAUGAGUUCAUGUGGAACCCUCACCUGGGCUACAUCCUCACCUGCCCAUCCAACCUGGGCACCGGGCUGCGGGCAGGUGUGCAUAUCAAGCUGCCCAACCUGGGCAAGCAUGAGAAGUUCUCGGAGGUGCUUAAGCGGCUGCGACUUCAGAAGCGAGGCACAGGCGGUGUGGACACGGCUGCGGUGGGCGGGGUCUUCGACGUCUCCAACGCUGACCGCCUGGGCUUCUCAGAGGUGGAGCUGGUGCAGAUGGUGGUGGACGGAGUGAAGCUGCUCAUCGAGAUGGAGCAGCGGCUGGAGCAGGGCCAGGCCAUCGACGACCUCAUGCCUGCCCAGAAAUGAAGCCCGGCCCACACCCGACACCAGCCCUGCUGCUUCCUAACUUAUUGCCUGGGCAGUGCCCACCAUGCACCCCUGAUGUUCGCCGUCUGGCGAGCCCUUAGCCUUGCUGUAGAGACUUCCGUCACCCUUGGUAGAGUUUAUUUUUUUGAUGGCUAAGAUACUGCUGAUGCUGAAAUAAACUAGGGUUUUGGCCUGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-586.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -612.57
Frequency: 0.0000
Diversity: 371.88
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((...((.((((...)))).)).(((((((((((...((((((((((((..(((((.(((((((((...(((.(((..((((....(((((.(......(((..(((.(((((((.((.((.(((.....))).)).))(((((((.............(((((...((((((..((((((.((((((.(((((((((((.(((....((((.((((((.((((..(((((......(((.....))).(((.(((.....))).)))...............(((((((((.(((((.(((.(.(((((((((((..(((...))).)))).))))))).)))).))).)).)).))..))))).((((...)))))))))..)))).................(((..((...))..)))((((.(((...(((...)))....))))))).))))).).)))).....))))))))).)))))(((....)))...........)))))))).))))))))))..)))))......((((((.(.((..(((..(((((...))))))))..))).)))))).........)))))))..........))))))).)))..)))..(((..((((.((........)).))))..)))..((((((....((((((.(((.((((((..(........)..)))))).))).))))))..))))))........((((((((((((((.(((((((.....((((((((.......))))..)))).((((((((.(((..(((((.......)))))..))).))))))))..)))).)))))))..((((......))))((((....))))(((((((((.((((.....)))).)))))).))).(.(((((((((...((.(((((...))))).)).))))))))).)........((((((((...))))).)))..((((...)))))))))).)))).).))))).......))))))).)))...))))).))))...))))))))).)))))))).)))))..((((((((.(((((......((((((.(((((((((((...((((((..(((((((((.(((.(((..(((((((.........)))))))((((((.((.((((.((((.((.((.....)))))))))))).........))))))))..))))))...)))((((.((................))..)))).....)))))))))))).......)))))).))))).))))))))))).))).....))))).))))))(((((......((((((((((......(((.........)))......)))))))))))))))...))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,..(((.(,(,.((((...)))).||,(((((((((((.,.((((((((((((..(((((.(((((((((...(((.(((.,((((....(((({.{...{{.,||..|||{((((({,.((,((,(({,....}}}.)).)){|{({((,............,||{{...((|{|({{(((,{({(((((.((((((((((((.(((....(({({(((,((((({{(((((((({.,..,,|.}}}}),,.(((.(((.....))).)))...,|,.....,,}.,}}}}||||}|{|||}(((.(.(((((((((((..({,...}}}.)))).))))))).)))).,,..,|,||.,||{|}}||||{{{...,}})},})}.}}}))....,.,,}.,}}}...{{,..,..,,||{.||}((((,{((...(((...)))....))))))).))))),)})))).,...))))))))).))))))((,,{{(({{{{,{{{{{...,,,,,,)}))))|||||},.},,{(((....((((((.(.((..(((..(((({...})))))))..))).)))))))))}.....)))))},..........)))))))}))}.,},)}}|||}.,,,..,,.....{((((((((....{{{({((({(((..((((((.(((.((((((..(........)..)))))).))).))))))...)))}}...,......{.(((.....))).|}})),..})))))))}......,.})))),.},}}.((((((((.(((..(((((.......)))))..))).))))))))..)))).,,,|}||,,{(({.,,,..}}}}{{||...,)})}.,}}}}}|{|((({..(((......)))))})}}.{.(((((((((...((.(((((...))))).)).))))))))).}....{{{.((((((({...})))),,)).})}{{,|,,,}||}||}|||....)})}))},,,,,,,)))}))).)))...))))).))))...))))))))).)))))))),)))))..((((({{(.(({{{..,,..((((((.(((((((((((,,.((((((..((((((((,.(((.(((..(((((((.........)))))))((((((.((.(((,,((({,((.({.....)))))))))))).........))))))))..)))))).,,))}(({(,({,||.............))..}))),},}})))))))))))).......)))))).))))).))))))}}})).}}),....))))).))))))(((((......((((((((((.....{(((.........))),.....)))))))))))))))...)))..}}.
Back