Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001844.5
Sequence Length
5059 nt
GC Content
0.6227
GCAGAGCGCUGCUGGGCUGCCGGGUCUCCCGCUUCCCCCUCCUGCUCCAAGGGCCUCCUGCAUGAGGGCGCGGUAGAGACCCGGACCCGCGCCGUGCUCCUGCCGUUUCGCUGCGCUCCGCCCGGGCCCGGCUCAGCCAGGCCCCGCGGUGAGCCAUGAUUCGCCUCGGGGCUCCCCAGACGCUGGUGCUGCUGACGCUGCUCGUCGCCGCUGUCCUUCGGUGUCAGGGCCAGGAUGUCCAGGAGGCUGGCAGCUGUGUGCAGGAUGGGCAGAGGUAUAAUGAUAAGGAUGUGUGGAAGCCGGAGCCCUGCCGGAUCUGUGUCUGUGACACUGGGACUGUCCUCUGCGACGACAUAAUCUGUGAAGACGUGAAAGACUGCCUCAGCCCUGAGAUCCCCUUCGGAGAGUGCUGCCCCAUCUGCCCAACUGACCUCGCCACUGCCAGUGGGCAACCAGGACCAAAGGGACAGAAAGGAGAACCUGGAGACAUCAAGGAUAUUGUAGGACCCAAAGGACCUCCUGGGCCUCAGGGACCUGCAGGGGAACAAGGACCCAGAGGGGAUCGUGGUGACAAAGGUGAAAAAGGUGCCCCUGGACCUCGUGGCAGAGAUGGAGAACCUGGGACCCCUGGAAAUCCUGGCCCCCCUGGUCCUCCCGGCCCCCCUGGUCCCCCUGGUCUUGGUGGAAACUUUGCUGCCCAGAUGGCUGGAGGAUUUGAUGAAAAGGCUGGUGGCGCCCAGUUGGGAGUAAUGCAAGGACCAAUGGGCCCCAUGGGACCUCGAGGACCUCCAGGCCCUGCAGGUGCUCCUGGGCCUCAAGGAUUUCAAGGCAAUCCUGGUGAACCUGGUGAACCUGGUGUCUCUGGUCCCAUGGGUCCCCGUGGUCCUCCUGGUCCCCCUGGAAAGCCUGGUGAUGAUGGUGAAGCUGGAAAACCUGGAAAAGCUGGUGAAAGGGGUCCGCCUGGUCCUCAGGGUGCUCGUGGUUUCCCAGGAACCCCAGGCCUUCCUGGUGUCAAAGGUCACAGAGGUUAUCCAGGCCUGGACGGUGCUAAGGGAGAGGCGGGUGCUCCUGGUGUGAAGGGUGAGAGUGGUUCCCCGGGUGAGAACGGAUCUCCGGGCCCAAUGGGUCCUCGUGGCCUGCCUGGUGAAAGAGGACGGACUGGCCCUGCUGGCGCUGCGGGUGCCCGAGGCAACGAUGGUCAGCCAGGCCCCGCAGGGCCUCCGGGUCCUGUCGGUCCUGCUGGUGGUCCUGGCUUCCCUGGUGCUCCUGGAGCCAAGGGUGAAGCCGGCCCCACUGGUGCCCGUGGUCCUGAAGGUGCUCAAGGUCCUCGCGGUGAACCUGGUACUCCUGGGUCCCCUGGGCCUGCUGGUGCCUCCGGUAACCCUGGAACAGAUGGAAUUCCUGGAGCCAAAGGAUCUGCUGGUGCUCCUGGCAUUGCUGGUGCUCCUGGCUUCCCUGGGCCACGGGGCCCUCCUGGCCCUCAAGGUGCAACUGGUCCUCUGGGCCCGAAAGGUCAGACGGGUGAACCUGGUAUUGCUGGCUUCAAAGGUGAACAAGGCCCCAAGGGAGAACCUGGCCCUGCUGGCCCCCAGGGAGCCCCUGGACCCGCUGGUGAAGAAGGCAAGAGAGGUGCCCGUGGAGAGCCUGGUGGCGUUGGGCCCAUCGGUCCCCCUGGAGAAAGAGGUGCUCCCGGCAACCGCGGUUUCCCAGGUCAAGAUGGUCUGGCAGGUCCCAAGGGAGCCCCUGGAGAGCGAGGGCCCAGUGGUCUUGCUGGCCCCAAGGGAGCCAACGGUGACCCUGGCCGUCCUGGAGAACCUGGCCUUCCUGGAGCCCGGGGUCUCACUGGCCGCCCUGGUGAUGCUGGUCCUCAAGGCAAAGUUGGCCCUUCUGGAGCCCCUGGUGAAGAUGGUCGUCCUGGACCUCCAGGUCCUCAGGGGGCUCGUGGGCAGCCUGGUGUCAUGGGUUUCCCUGGCCCCAAAGGUGCCAACGGUGAGCCUGGCAAAGCUGGUGAGAAGGGACUGCCUGGUGCUCCUGGUCUGAGGGGUCUUCCUGGCAAAGAUGGUGAGACAGGUGCUGCAGGACCCCCUGGCCCUGCUGGACCUGCUGGUGAACGAGGCGAGCAGGGUGCUCCUGGGCCAUCUGGGUUCCAGGGACUUCCUGGCCCUCCUGGUCCCCCAGGUGAAGGUGGAAAACCAGGUGACCAGGGUGUUCCCGGUGAAGCUGGAGCCCCUGGCCUCGUGGGUCCCAGGGGUGAACGAGGUUUCCCAGGUGAACGUGGCUCUCCCGGUGCCCAGGGCCUCCAGGGUCCCCGUGGCCUCCCCGGCACUCCUGGCACUGAUGGUCCCAAAGGUGCAUCUGGCCCAGCAGGCCCCCCUGGGGCUCAGGGCCCUCCAGGUCUUCAGGGAAUGCCUGGCGAGAGGGGAGCAGCUGGUAUCGCUGGGCCCAAAGGCGACAGGGGUGACGUUGGUGAGAAAGGCCCUGAGGGAGCCCCUGGAAAGGAUGGUGGACGAGGCCUGACAGGUCCCAUUGGCCCCCCUGGCCCAGCUGGUGCUAAUGGCGAGAAGGGAGAAGUUGGACCUCCUGGUCCUGCAGGAAGUGCUGGUGCUCGUGGCGCUCCGGGUGAACGUGGAGAGACUGGGCCCCCCGGACCAGCGGGAUUUGCUGGGCCUCCUGGUGCUGAUGGCCAGCCUGGGGCCAAGGGUGAGCAAGGAGAGGCCGGCCAGAAAGGCGAUGCUGGUGCCCCUGGUCCUCAGGGCCCCUCUGGAGCACCUGGGCCUCAGGGUCCUACUGGAGUGACUGGUCCUAAAGGAGCCCGAGGUGCCCAAGGCCCCCCGGGAGCCACUGGAUUCCCUGGAGCUGCUGGCCGCGUUGGACCCCCAGGCUCCAAUGGCAACCCUGGACCCCCUGGUCCCCCUGGUCCUUCUGGAAAAGAUGGUCCCAAAGGUGCUCGAGGAGACAGCGGCCCCCCUGGCCGAGCUGGUGAACCCGGCCUCCAAGGUCCUGCUGGACCCCCUGGCGAGAAGGGAGAGCCUGGAGAUGACGGUCCCUCUGGUGCCGAAGGUCCACCAGGUCCCCAGGGUCUGGCUGGUCAGAGAGGCAUCGUCGGUCUGCCUGGGCAACGUGGUGAGAGAGGAUUCCCUGGCUUGCCUGGCCCGUCGGGUGAGCCCGGCAAGCAGGGUGCUCCUGGAGCAUCUGGAGACAGAGGUCCUCCUGGCCCCGUGGGUCCUCCUGGCCUGACGGGUCCUGCAGGUGAACCUGGACGAGAGGGAAGCCCCGGUGCUGAUGGCCCCCCUGGCAGAGAUGGCGCUGCUGGAGUCAAGGGUGAUCGUGGUGAGACUGGUGCUGUGGGAGCUCCUGGAGCCCCUGGGCCCCCUGGCUCCCCUGGCCCCGCUGGUCCAACUGGCAAGCAAGGAGACAGAGGAGAAGCUGGUGCACAAGGCCCCAUGGGACCCUCAGGACCAGCUGGAGCCCGGGGAAUCCAGGGUCCUCAAGGCCCCAGAGGUGACAAAGGAGAGGCUGGAGAGCCUGGCGAGAGAGGCCUGAAGGGACACCGUGGCUUCACUGGUCUGCAGGGUCUGCCCGGCCCUCCUGGUCCUUCUGGAGACCAAGGUGCUUCUGGUCCUGCUGGUCCUUCUGGCCCUAGAGGUCCUCCUGGCCCCGUCGGUCCCUCUGGCAAAGAUGGUGCUAAUGGAAUCCCUGGCCCCAUUGGGCCUCCUGGUCCCCGUGGACGAUCAGGCGAAACCGGCCCUGCUGGUCCUCCUGGAAAUCCUGGACCCCCUGGUCCUCCAGGUCCCCCUGGCCCUGGCAUCGACAUGUCCGCCUUUGCUGGCUUAGGCCCGAGAGAGAAGGGCCCCGACCCCCUGCAGUACAUGCGGGCCGACCAGGCAGCCGGUGGCCUGAGACAGCAUGACGCCGAGGUGGAUGCCACACUCAAGUCCCUCAACAACCAGAUUGAGAGCAUCCGCAGCCCCGAGGGCUCCCGCAAGAACCCUGCUCGCACCUGCAGAGACCUGAAACUCUGCCACCCUGAGUGGAAGAGUGGAGACUACUGGAUUGACCCCAACCAAGGCUGCACCUUGGACGCCAUGAAGGUUUUCUGCAACAUGGAGACUGGCGAGACUUGCGUCUACCCCAAUCCAGCAAACGUUCCCAAGAAGAACUGGUGGAGCAGCAAGAGCAAGGAGAAGAAACACAUCUGGUUUGGAGAAACCAUCAAUGGUGGCUUCCAUUUCAGCUAUGGAGAUGACAAUCUGGCUCCCAACACUGCCAACGUCCAGAUGACCUUCCUACGCCUGCUGUCCACGGAAGGCUCCCAGAACAUCACCUACCACUGCAAGAACAGCAUUGCCUAUCUGGACGAAGCAGCUGGCAACCUCAAGAAGGCCCUGCUCAUCCAGGGCUCCAAUGACGUGGAGAUCCGGGCAGAGGGCAAUAGCAGGUUCACGUACACUGCCCUGAAGGAUGGCUGCACGAAACAUACCGGUAAGUGGGGCAAGACUGUUAUCGAGUACCGGUCACAGAAGACCUCACGCCUCCCCAUCAUUGACAUUGCACCCAUGGACAUAGGAGGGCCCGAGCAGGAAUUCGGUGUGGACAUAGGGCCGGUCUGCUUCUUGUAAAAACCUGAACCCAGAAACAACACAAUCCGUUGCAAACCCAAAGGACCCAAGUACUUUCCAAUCUCAGUCACUCUAGGACUCUGCACUGAAUGGCUGACCUGACCUGAUGUCCAUUCAUCCCACCCUCUCACAGUUCGGACUUUUCUCCCCUCUCUUUCUAAGAGACCUGAACUGGGCAGACUGCAAAAUAAAAUCUCGGUGUUCUAUUUAUUUAUUGUCUUCCUGUAAGACCUUCGGGUCAAGGCAGAGGCAGGAAACUAACUGGUGUGAGUCAAAUGCCCCCUGAGUGACUGCCCCCAGCCCAGGCCAGAAGACCUCCCUUCAGGUGCCGGGCGCAGGAACUGUGUGUGUCCUACACAAUGGUGCUAUUCUGUGUCAAACACCUCUGUAUUUUUUAAAACAUCAAUUGAUAUUAAAAAUGAAAAGAUUAUUGGAAAGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2259.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2338.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 1050.26
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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