Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001861.6

Sequence Length

763 nt

GC Content

0.5269

CUCUUCCGGUCGCGGGACACCGGGUGUAGAGGGCGGUCGCGGCGGGCAGUGGCGGCAGAAUGUUGGCUACCAGGGUAUUUAGCCUAGUUGGCAAGCGAGCAAUUUCCACCUCUGUGUGUGUACGAGCUCAUGAAAGUGUUGUGAAGAGCGAAGACUUUUCGCUCCCAGCUUAUAUGGAUCGGCGUGACCACCCCUUGCCGGAGGUGGCCCAUGUCAAGCACCUGUCUGCCAGCCAGAAGGCAUUGAAGGAGAAGGAGAAGGCCUCCUGGAGCAGCCUCUCCAUGGAUGAGAAAGUCGAGUUGUAUCGCAUUAAGUUCAAGGAGAGCUUUGCUGAGAUGAACAGGGGCUCGAACGAGUGGAAGACGGUUGUGGGCGGUGCCAUGUUCUUCAUCGGUUUCACCGCGCUCGUUAUCAUGUGGCAGAAGCACUAUGUGUACGGCCCCCUCCCGCAAAGCUUUGACAAAGAGUGGGUGGCCAAGCAGACCAAGAGGAUGCUGGACAUGAAGGUGAACCCCAUCCAGGGCUUAGCCUCCAAGUGGGACUACGAAAAGAACGAGUGGAAGAAGUGAGAGAUGCUGGCCUGCGCCUGCACCUGCGCCUGGCUCUGUCACCGCCAUGCAACUCCAUGCCUAUUUACUGGAAACCUGUUAUGCCAAACAGUUGUACCACUGCUAAUAAAUGACCAGUUUACCUGAAACCCUUUGUGAUCAGUUCUUUAAUGAUACCUAAAUGAAAGCUAAUUAAAACAAUAGGUUUCUCCCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-249.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -263.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 267.79

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((.((((((....)))((((.((.(((.((((((((((.((((.((.((.(((.((((.(((.(((((((.....))))...)))..))).)))).))))).)).)))).)))...(((..(((((.((((...((((((((......)))))))).....)))).))))).))).))))))).)))))))))((((((((((((((((.(((((((((((((..((((.(((((.(((..((((.(((((.....)))))..(((((.((((((.(((((...((.(.(((......)))).))..))))).))))))..)))))..........(((((....((((.((.....)).))))(.(((((((((((.....))).))...)))))).).(((...((((((.......))).)))...))))))))))))..))).))))).((.....))...))))...))))))....))).)))).)))))...((((.....))))..)))))..))))))..(((....)))........))).))))))).((((.(((.(((((...((((........)))))))))))).)))).(.((((......)))).)........((((((..(((((......((((......)))).......)))))..)))).)).((((((..(((((((.((((.((((.(........).)))))))).)))...))))..))))))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{(((((,({{(((,..,})}((({.((.(((.((((((({((,((((.((.((.(((.((((.(((.(((((((.....)))}...)))..))).)))).))))).)).)))).|}}...(((,{(((((.,{{{.,||||,.(((((((,...}))))))){||}}}}.}}))}.})).))))))).)))}||||}((((({((((((((((.(((((((((((((,.(((,..,|||.{{{..{{{{.(((((.....)))))..(((((,((((((.(((((...{..(.(((......)))}.))..))))).))))))..,}))),.,..,,.,,(({((,{,.((((.((.....)).)))){.{{{{{{||{||,,,.,)}),)}|..})))))})}|||,..{{{{||||....}},},}))}),,}))))}))))).,))}.|||||.....,},))}}})))},..))))))....))).)))).)))))}..(({{...,{|||}..|))|}..))))}}..|||}}.,|,|........}}}|)))}}},.((({.(({.(((((,..((((..,,....)))))))))})).)))).|}||{{,..,,,)}))},......}}|||{{|||((({,....,,||{|,,,.,,)))).......,}))),.)}}}.,}.((((((..(((({({.(((({((({.,......,.,,,))}}))).)))...))))..))))))......