Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_001867.3
Sequence Length
629 nt
GC Content
0.4070
CUUUUCAGUCCUUGCGCACCGGGGAACAAGGUCGUGAAAAAAAAGGUCUUGGUGAGGUGCCGCCAUUUCAUCUGUCCUCAUUCUCUGCGCCUUUCGCAGAGCUUCCAGCAGCGGUAUGUUGGGCCAGAGCAUCCGGAGGUUCACAACCUCUGUGGUCCGUAGGAGCCACUAUGAGGAGGGCCCUGGGAAGAAUUUGCCAUUUUCAGUGGAAAACAAGUGGUCGUUACUAGCUAAGAUGUGUUUGUACUUUGGAUCUGCAUUUGCUACACCCUUCCUUGUAGUAAGACACCAACUGCUUAAAACAUAAGGAUGUUUCAGUUCCUCCAUUUAACAGAUAUGAAGAGCAUUUUAAGAGGUGCAGCCUCUGGAAGUGGAUCAAACUAGAACUCAUAUGCCAUACUAGAUAUGUUUGUCAAUAAACUUAUGACGUGAAUGCUUAAUGCCUCUUUUUUGAAAUAGGGAAUGUAAUAAUUGGCCAUUUGCCUACUUUAUUAUUUGGGUAACAUUCCAGUAUUACUCUCUGUGAUUUAGCUUAUUUAAUGGUGUUAAACUGAGGUUAUAUUAAAUUUUUGAUUCCCAGGUCAGGAUUUUGUUGGUAAUUUAUAUAAUAAAAGGGAAAUACAAAUCGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-161.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -174.31
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.11
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((.(((((..(......)..))))).).))))))..(((((((((((((((((....))))))))((.(((((((.(((((((.....)))))))...((((((......))))))((....))....(((((((...)))))))(((((((...))).)))).))))))).)).(((((((((((((((....(((((((....((((.....((((((..((((((...((((((((....((((.......((((((((........))))))))......(((((....((((((....)))))))))))..))))....))))))))......((((((.((((((...)))))).))))))..(((((..(((...(((..((..(((...(((.(((((....))))).)))...)))...))...)))..)))..))))).(((((((..((((((.((((....(((((((..(....)..)))))))....)))))))))))))))))...))))))....))))))))))..)))))))......)))))))....)))))))).)))))))))......................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((((((.(((((..(....,.)..))))).}.))))}}...{.((((((((,{((((..{{|||||,,,((.(((((((.(((((((.....))))))},,,((((((......))))))|,...,))....(((((((...)))))))(((((((...}),,)))).))))))).)){((((((((,,,,,,..,.|||||}},}).....}}}}}}|,}|||}}.|}}}}}}},|(((({(,..,{{{,..,,,.,((((((((........)))))))}|..{,{((({(....((((((....))))))}))),{{{{,,{{{{{||,||||{{,{,,((((({.((((((...)))))).))))))..{{,,,..,||..,||||,{{{{{..,,{(((.{{{{({{,.,|....}})}}}},,...||.....)}.}},..,,,}}.(((((((..(((((,,((((....(((((((..,....}..)))))))....)))))))))))))))))...,,})),},}}))}})}))))))).,))))......,|||,||{{{{||}}},))))))))}))}}|}}}}..,,,.,.,,,,,,}}}}},,.,}},,,,...
Back