Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_001976.5

Sequence Length

1495 nt

GC Content

0.5652

GACACUGUCCCAGCUGCCACCUAGACUCGGAGCUCCAUCCAAACCUCCAGCGAAGACAUCCCAGGUCGGGUGAAUCUUCCAGCCCUGGGGGUGGAGGUAGUAAAGGCCAUGGCCAUGCAGAAAAUCUUUGCCCGGGAAAUCUUGGACUCCAGGGGCAACCCCACGGUGGAGGUGGACCUGCACACGGCCAAGGGCCGAUUCCGAGCAGCUGUGCCCAGUGGGGCUUCCACGGGUAUCUAUGAGGCUCUGGAACUAAGAGACGGAGACAAAGGCCGCUACCUGGGGAAAGGAGUCCUGAAGGCUGUGGAGAACAUCAACAAUACUCUGGGCCCUGCUCUGCUGCAAAAGAAACUAAGCGUUGUGGAUCAAGAAAAAGUUGACAAAUUUAUGAUUGAGCUAGAUGGGACCGAGAAUAAGUCCAAGUUUGGGGCCAAUGCCAUCCUGGGCGUGUCCUUGGCCGUGUGUAAGGCGGGAGCAGCUGAGAAGGGGGUCCCCCUGUACCGCCACAUCGCAGAUCUCGCUGGGAACCCUGACCUCAUACUCCCAGUGCCAGCCUUCAAUGUGAUCAACGGGGGCUCCCAUGCUGGAAACAAGCUGGCCAUGCAGGAGUUCAUGAUUCUGCCUGUGGGAGCCAGCUCCUUCAAGGAAGCCAUGCGCAUUGGCGCCGAGGUCUACCACCACCUCAAGGGGGUCAUCAAGGCCAAGUAUGGGAAGGAUGCCACCAAUGUGGGUGAUGAAGGUGGCUUCGCACCCAACAUCCUGGAGAACAAUGAGGCCCUGGAGCUGCUGAAGACGGCCAUCCAGGCGGCUGGUUACCCAGACAAGGUGGUGAUCGGCAUGGAUGUGGCAGCAUCUGAGUUCUAUCGCAAUGGGAAGUACGAUCUUGACUUCAAGUCGCCUGAUGAUCCCGCACGGCACAUCACUGGGGAGAAGCUCGGAGAGCUGUAUAAGAGCUUUAUCAAGAACUAUCCUGUGGUCUCCAUCGAAGACCCCUUUGACCAGGAUGACUGGGCCACUUGGACCUCCUUCCUCUCGGGGGUGAACAUCCAGAUUGUGGGGGAUGACUUGACAGUCACCAACCCCAAGAGGAUUGCCCAGGCCGUUGAGAAGAAGGCCUGCAACUGUCUGCUGCUGAAGGUCAACCAGAUCGGCUCGGUGACCGAAUCGAUCCAGGCGUGCAAACUGGCUCAGUCUAAUGGCUGGGGGGUGAUGGUGAGCCACCGCUCUGGGGAGACUGAGGACACAUUCAUUGCUGACCUUGUGGUGGGGCUCUGCACAGGACAGAUCAAGACUGGCGCCCCCUGCCGCUCGGAGCGUCUGGCCAAAUACAACCAACUCAUGAGGAUCGAGGAGGCUCUUGGGGACAAGGCAAUCUUUGCUGGACGCAAGUUCCGUAACCCGAAGGCCAAGUGAGAAGCUGGAGGCUCCAGGACUCCACUGGACAGACCCAGGUCUUCCAGACCUGCUUCCUGAAAUAAACACUGGUGCCAACCAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-568.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -598.36

Frequency: 0.0000

Diversity: 294.20

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

....(((((((((((((..((.......(((......)))..(((((((.((...((.(((((((.(.((........)).).)))))))))((((........(((....)))..(((((.....)))))(((((....))))).)))).((((...)))).)).))))))).(.(((((((((((((((((((...((((((((..(.((((((.((((.....))))))))))....)..)))).))))...((((..(..((......((((..(((.((((......))))..)))..))))......))..)....)))).((((((((..((((.............))))..)))).((((..(.(((((....))))).)..)))).((((((.((((.........))))..)))))))))).(((((......))))))))))))))))))))).))))))..)))))))...(((((((((.(((((...((((((((.((.....((((((((....((....))...))))))))...((((.((.(((..((..((((((((.((.((..(((.....(((((((..(((((((.........)).)))))..).)))))))))..)).)).))))..((((....)))).(((((........)))))..((.((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....)))))))))).))))))))))..))).))))))((((((...((((....))))..))))))..(((((((((((.......).)))))))))).)))))))))).(((...((((((((((((((.((..(((((((.((((....)))))))(((.(...((((.((.(((......(((((......)))))((((((.......))))))...............((((((.(((((....(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..(((((((((..(((((.........((((((.(((.....))).))))))....))))).))))))..((.(((((.((((((........)).)))).)))))..))....((....)).((((((.((((...)))).)))))).))).)).)))..))))))))))...)))).)))))))))))).)).)))).))).))))))...).)))..........))))..)))))))))))))))))))))))).........((.(((((.....))))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.((.((..((((.(..((..((((...))))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).))))))).))))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

....(((((((((((((..((.......(({...,,.|||..(((((((.((...,,.{((((((.,{((.......,)).}.)))))))}||({(,.......(((....)))..(((((.....)))))(((((....))))).}))),((((...)))).)).))))))),|.(((((((((((((((((((.,.((((((((..(.((((((.((((,...,)))))))))}....}..)))).))))...,{{{.,({,(,......((((..(((.((((......))))..}))..))))......}}..,....)))),((((((((,,,,,,,,...........,,||{{.{((.((((..,.(((((....))))).}..)))).)}}|}|,((((.........)))).,}},,)))))).(((((......))))))))))))))))))))),,)).))..)))))))....(((((,(((({,((.....(((((.(.((....((((((((....{{....}}...))))))))..,,.)).).)))))....)))))))))))).{(((((........},.))).))}(((((((.(((,{(((((((((((((((..{.((..(((((..(((.,((((....)))).,.))}....((((((((...{(,((.((((....(((....)))....)))))).)).(((((((((.(((((....))))))))))},))).((((.(...(((.((.(((((((...((((....))))..)))))).).)).))).)))))...)))))))).(((((((((((((((((((.((((((((((.((.(,,{,,(((({.({....||}}}}).,)}|}|{{({((..{({....))..)}))}.})}))))}})))))))..)))))...{(..{{{....,}}..}}.((((.,(((((((.{({...(((((((.(.(((....((((((((((.(((.((..{{,((((((.,((({(......,{,{{{{{|,|{(,.,,,||}.}})))),,}.,)))).)))))),{({.,(((((.{{.....,,.))))))}},..{{{{{,....,..||,,..||.((((((.((((...)))).)))))),))),)).))}..))))))))))...)))).)))))))..|{{{(,,,}}}})})),},))))))),)))))))))))),})))))))))).)).}.)))))).)))))).))))))).((.(((({.....})))).))(((((.((((((.............(((((..((.(((.({.((..((((.(..(,.{((({...})))))..).))))..))....)))))...))..)))))..)))))).))))).)))))))...))))))...(((((((...))))))).................((((....)))).