Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002212.4
Sequence Length
1069 nt
GC Content
0.5734
AGUCCAAGGUACAGUCGCCGCGUGCGGAGCUUGUUACUGGUUACUUGGCCUCAUGGCGGUCCGAGCUUCGUUCGAGAACAACUGUGAGAUCGGCUGCUUUGCCAAGCUCACCAACACCUACUGUCUGGUAGCGAUCGGAGGCUCAGAGAACUUCUACAGUGUGUUCGAGGGCGAGCUCUCCGAUACCAUCCCCGUGGUGCACGCGUCUAUCGCCGGCUGCCGCAUCAUCGGGCGCAUGUGUGUGGGGAACAGGCACGGUCUCCUGGUACCCAACAAUACCACCGACCAGGAGCUGCAACACAUUCGCAACAGCCUCCCAGACACAGUGCAGAUUAGGCGGGUGGAGGAGCGGCUCUCAGCCUUGGGCAAUGUCACCACCUGCAAUGACUACGUGGCCUUGGUCCACCCAGACUUGGACAGGGAGACAGAAGAAAUUCUGGCAGAUGUGCUCAAGGUGGAAGUCUUCAGACAGACAGUGGCCGACCAGGUGCUAGUAGGAAGCUACUGUGUCUUCAGCAAUCAGGGAGGGCUGGUGCAUCCCAAGACUUCAAUUGAAGACCAGGAUGAGCUGUCCUCUCUUCUUCAAGUCCCCCUUGUGGCGGGGACUGUGAACCGAGGCAGUGAGGUGAUUGCUGCUGGGAUGGUGGUGAAUGACUGGUGUGCCUUCUGUGGCCUGGACACAACCAGCACAGAGCUGUCAGUGGUGGAGAGUGUCUUCAAGCUGAAUGAAGCCCAGCCUAGCACCAUUGCCACCAGCAUGCGGGAUUCCCUCAUUGACAGCCUCACCUGAGUCACCUUCCAAGUUGUUCCAUGGGCUCCUGGCUCUGGACUGUGGCCAACCUUCUCCACAUUCCGCCCAAUCUGUACCGGAUGCUGGCAGGGAGGUGGCAGAGAGCUCACUGGGACUGAGGGGCUGGGCACCCAACCCUUUUCCACCUGUGCUUAUCGCCUGGAUCUAUCAUUACUGCAAAAACCUGCUCUGUUGUGCUGGCUGGCAGGCCCUGUGGCUGCUGGCUGAGGGUUCUGCUGUCCUGUGCCACCCCAUUAAAGUGCAGUUCCCUCCGGGCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-417.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -436.51
Frequency: 0.0000
Diversity: 324.56
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((..(((......)))((((((.(((((((.....(((...((((.(((((((..((((((((...))))).).))..))))))).))))..)))....)))))))(((((((.....))).))))....(((((((((((...(..(((..(((...)))..)))..))))).)))))))(((((....))))))))))).......((((((.((((((.....((((((.(((((.((.....)).)))))))((((((((.................))))))))((((....((..((((((((((((((...(((((((((((((.((((((((((((((.((((..((((((((((((.((((.((((.............))))(((((.((((........)))))))))...(((((....)))))...)))))))))))))(((((((((......))))...((..((((((((((((((((....)))))).))...........(((((((((.(((.(((((.....((((....))))....))))).))))))))))))..(((((((((((((...)).))))))).))))..((((((((((((.((.(.((((..(..(((((((((.....(((((((((......)))..((((((..(((.(((.((....)).))).)))...))))))....((((.........))))...))))))))))))))).)..)))).).)))))))))....)))))))))).))).)))))))......((((.(((((...)))))))))))).))))...)))))))))...))))).)))))))))....)).))...)))))).(((.((((((.((...(((..((((((.(((....))).)))))))))...)).)))).)))))................(((......))).)))))))).))....)))))))))))))).)))))).(((((..((((......(((......)))......))))..))))).))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((..({,,,,,..|||(({{{{|{{{{{|||..,,||{..,,,{({({,,{||}{((((((((..{||||,.|{{|,{|||||||.||||,.|||.,},},,|||,(((((((.....})).))))))}.{{{{{{{||{{...|,.|||,.||}}}.)))}},,)}})))))})|||}||(((((,,,,|||||||}}|||.,....{{{||{.||{|||,,,.,|||{|,,||{||,|{||...}|,||}|||,((((((((.................))))))))||{{....,,..{(({{({(((({(({(.{{(.(((((((((.((((((((((((((.((({..((((((((((({,((((.((((.,,........,.))))((((,{((((........)))))))))...(((((....))))).,.)))))))))))))|{({{((({...,,.,}}|,,{(({,{{((((({(((,({(({,.{|}}}})|,}}},,}}}....{((((((((.{({.(((((...|.((((....)))).|..))))).})|))))))))}..{(({((((((({,...,}.))))))).})))..{(((((((((((.(({({(((((((,.((((((((...{.((((.({,,,,(({{{({{,{(({{{{..|||,|||,||,...||,||}.|||,,,}}})))}}}.))))}..}.,)))))).}...)))))))),),)))))).)))}.},)}))))))),...)))))))))).))).}}}}}},......{(((.(((({...)))))))))))).))))...)))))))))...))))).))))))))).,,.}})))}.,))}}}}|(((.{{((((.((..,(((..((((({.(((....))).)))))))))...)).)))).}}))),,,......,......(({......))).)))))))).}}|,,||||}}||}}}}))),)))))),(((((..((((......(((......)))......))))..))))).)))),.
Back