Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002514.4
Sequence Length
2463 nt
GC Content
0.4507
AAGCACCGGACCAGGGGGAAGGCGAGCAGUGCCAAUCUACAGCGAAGAAAGUCUCGUUUGGUAAAAGCGAGAGGGGAAAGCCUGAGCAUGCAGAGUGUGCAGAGCACGAGCUUUUGUCUCCGAAAGCAGUGCCUUUGCCUGACCUUCCUGCUUCUCCAUCUCCUGGGACAGGUCGCUGCGACUCAGCGCUGCCCUCCCCAGUGCCCGGGCCGGUGCCCUGCGACGCCGCCGACCUGCGCCCCCGGGGUGCGCGCGGUGCUGGACGGCUGCUCAUGCUGUCUGGUGUGUGCCCGCCAGCGUGGCGAGAGCUGCUCAGAUCUGGAGCCAUGCGACGAGAGCAGUGGCCUCUACUGUGAUCGCAGCGCGGACCCCAGCAACCAGACUGGCAUCUGCACGGCGGUAGAGGGAGAUAACUGUGUGUUCGAUGGGGUCAUCUACCGCAGUGGAGAGAAAUUUCAGCCAAGCUGCAAAUUCCAGUGCACCUGCAGAGAUGGGCAGAUUGGCUGUGUGCCCCGCUGUCAGCUGGAUGUGCUACUGCCUGAGCCUAACUGCCCAGCUCCAAGAAAAGUUGAGGUGCCUGGAGAGUGCUGUGAAAAGUGGAUCUGUGGCCCAGAUGAGGAGGAUUCACUGGGAGGCCUUACCCUUGCAGCUUACAGGCCAGAAGCCACCCUAGGAGUAGAAGUCUCUGACUCAAGUGUCAACUGCAUUGAACAGACCACAGAGUGGACAGCAUGCUCCAAGAGCUGUGGUAUGGGGUUCUCCACCCGGGUCACCAAUAGGAACCGUCAAUGUGAGAUGCUGAAACAGACUCGGCUCUGCAUGGUGCGGCCCUGUGAACAAGAGCCAGAGCAGCCAACAGAUAAGAAAGGAAAAAAGUGUCUCCGCACCAAGAAGUCACUCAAAGCCAUCCACCUGCAGUUCAAGAACUGCACCAGCCUGCACACCUACAAGCCCAGGUUCUGUGGGGUCUGCAGUGAUGGCCGCUGCUGCACUCCCCACAAUACCAAAACCAUCCAGGCAGAGUUUCAGUGCUCCCCAGGGCAAAUAGUCAAGAAGCCAGUGAUGGUCAUUGGGACCUGCACCUGUCACACCAACUGUCCUAAGAACAAUGAGGCCUUCCUCCAGGAGCUGGAGCUGAAGACUACCAGAGGGAAAAUGUAACCUGUCACUCAAGAAGCACACCUACAGAGCACCUGUAGCUGCUGCGCCACCCACCAUCAAAGGAAUAUAAGAAAAGUAAUGAAGAAUCACGAUUUCAUCCUUGAAUCCUAUGUAUUUUCCUAAUGUGAUCAUAUGAGGACCUUUAUAUCUGUCUUUUAUUUAACAAAAAAUGUAAUUAACUGUAAACUUGGAAUCAAGGUAAGCUCAGGAUAUGGCUUAGGAAUGACUUACUUUCCUGUGGUUUUAUUACAAAUGCAAAUUUCUAUAAAUUUAAGAAAACAAGUAUAUAAUUUACUUUGUAGACUGUUUCACAUUGCACUCAUCAUAUUUUGUUGUGCACUAGUGCAAUUCCAAGAAAAUAUCACUGUAAUGAGUCAGUGAAGUCUAGAAUCAUACUUAACAUUUCAUUGUACAAGUAUUACAACCAUAUAUUGAGGUUCAUUGGGAAGAUUCUCUAUUGGCUCCCUUUUUGGGUAAACCAGCUCUGAACUUCCAAGCUCCAAAUCCAAGGAAACAUGCAGCUCUUCAACAUGACAUCCAGAGAUGACUAUUACUUUUCUGUUUAGUUUUACACUAGGAAACGUGUUGUAUCUACAGUAAUGAAAUGUUUACUAAGUGGACUGGUGUCAUAAACUUUCUCCAUUUAAGACACAUUGACUCCUUUCCAAUAGAAAGAAACUAAACAGAAAACUCCCAAUACAAAGAUGACUGGUCCCUCAUAGCCCUCAGACAUUUAUAUAUUGGAAGCUGCUGAGGCCCCCAAGUUUUUUAAUUAAGCAGAAACAGCAUAUUAGCAGGGAUUCUCUCAUCUAACUGAUGAGUAAACUGAGGCCCAAAGCACUUGCUUACAUCCUCUGAUAGCUGUUUCAAAUGUGCAUUUUGUGGAAUUUUGAGAAAAAUAGAGCAAAAUCAACAUGACUGGUGGUGAGAGACCACACAUUUUAUGAGAGUUUGGAAUUAUUGUAGACAUGCCCAAAACUUAUCCUUGGGCCAUAAUUAUGAAAACUCAUGAUCAAGAUAUAUGUGUAUACAUACAUGUAUCUGGUUUGUCAGGCUACAAGGUAGGCUGCAAAAUUAAAUCUAGACAUUCUUUUAAUGCCACCACACGUGUUCCGCUUCUCUCUUUUAAAGUAUUUAUAAAAAUAUAAAUUGUACAUUUUGUAAAAUAUUAUGUUUGAUUUCUCUACUUGUCAUAUCACUAAAUAAACACGAUUUUAUUGCUGCGUGACUCUGUAUUACUUUGGUGCAUAAAAGUUGAACAUUGUUGUUUACUGAAAAUAAAAUUAAAAUUUAUGAAUUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-741.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -789.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 755.87
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((...((((((((((((((((.(....((....((((((....((((((((.....))))))))(((.....)))..((((((...))))))...((((..(((((((....))))))).))))))))))..))....)))))))(((....((.((((((((((((...)))).(((((((((((.((((...((.((((.((((((........).))))).)))).))....)))).).).)))))))))((((((.......))))))(((((((.((((((((...))))).).)).((((.......))))...((..(((..(((((((...)))))))..)))..))((((..(((((..((((.((((((.(((.(((.((((((((..((.....((((.......))))..)).)))))))).))).)))........((((((.((((..(((....(((....)))..)))..)))).))))))((((((...((((..((.((((((.(((.(((((((.((((...(((((((((((((......))).......(((((.(((((((.....((((.(((((..(((((.((((.....)))))))))(((......)))(((((......(((.....)))......((((.......))))(((......)))..)))))....))))))))).......))))))).))))).)))))).)))).(((........)))((....)).(((((..((((..((((.(((.(((((.......))))))))))))...)))).))))).....)).))))).))))((.............)).....((((.((.(.......).)).))))...))))))))).))((((((....))))))..))))..))))))(((...((((.(((..(((((((..(((((((........)))))))..)))))))..)))...........((..((((......)))).)).))))...))).......))))))..))))..)))))..))))......))))))).)))))))).)).....))))))))))))).(((..(((((((..(((((((((.((((((...((((...((((.((.....(((((.((((((.....)))))).)).))).................(((((.((((..((..((((((.........((((....))))((((..((((..(((....).))..)))).)))).))))))..)).)))).))))).(((.....))).............((((....)))).(((((.((.....))))))).)).)))))))))))))).))))(((((...((((....))))..))))).......(((((.((.(((((......))))).)))))))...((((((((...((((......))))....))))))))............((((((........)))))))))))......((((((.(((......)))..))))))...((((.........)))).....(((((.(((....((((..(((.....)))....))))....)))))))).)))))))..)))..(((..((((((((........((((((...(((((..........((((((((((((((((...((((((((.(.(((...((((((((((........)))))..)))))...(((((.((((.........)))).)))))...))).).)))))..)))...))))))))))))))))............(((.((((((..(((((((((((.................))..)))).)))))...)).)))).)))(((((((((((((((((.((((((..(((((...((((((.....))))))..............((((....))))..)))))))))))))))))))(((((((((((((((((((((((((((......((((......((((((..((((((((.((((.............(((.(((((((.(((..........((((((.........))))))....(((((((....)))))))..((((((((((((....))))))))))))..((((.(((.((((...)))).)))))))..))).))))))).)))))))..))))))))..))))))..)))).....))))))))).)))))))))........)))))))))............))))))))))))))...)))))).......((((((......))))))))))))))..))).......)))))))).....(((.(((((....)))))))).............................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.((.((({(,,((,{.(((((((...,,..((((((......((((((((.....))))))))(((({,,({,,{{(,,.{(((.,,,,(((((((((..(((((((....))))))).)))}})))))}}|,|,}}},|))}}}}}}....{(((,,.}}}}}))))).},..,.))))))},}}}}}}..}.}}},)})))))))(({.,...(((((((....((((((...)))))){((((,.((((({((((.,,.,..|||}}}}))).))})),(((({...})))).,.(((((,{,,{,{(((((((((((.......))}|))),,)))).}.})}}})))))(((((..((((,.....,.))))..))))).))))))).||))}(((((((...(((((((({{{((({{,...,|(((((|{,|{,..{(({((((...)))).}}}}(((((.((((((.,,(((.(((((((...((((,,(,((,{.(({,,,}}}.}),,},)).,,.}},..))))...))))))).))),,,......,))))))))))))).((((,(((({.{(((((({{((,..,,)))}|{{{,{|,,||},|((((.(((((((.....(((((((...(((.....)))..,...{{(((((..(((((((..{{,.((({,..((((((,{..({.(((((((..(((({,...,}.))))....))))))).}}((((.....))))(((...(({{{{{(((((.((((((((.{|{{,((((((((.(({(((((((((.(({...}}),))).....)))))).))),|(((,,(((....{{{{(.......((({....})}}...,{(((((.((.(((((({{,...(((((((....)))))))..,{{{{(,.,.,,.....},.|}|||..(((((((..(((((((........)))))))..)))))))..}}}....,,.,,{.|{{,{{{({.{{,{|||{|,|,||||,....|{,..,..}||,},}|}))}},}}}}|||.}}}.,,}}..........,||||,.,}..,..,,,||}|||||||{{(,,.)}}}}),,}}}}.,,.,,{{({({{...,{,,,,,}||{.,{{..,..(((((.((((((.....)))))).)).)))..,.....,,.....,||{{{{,{{({..{(..((((((........}||||,.,,)}},||{,.||||,..{{{|.{{|,}...}}}},)))),,}}))),,}}.)))}.||||,.,{,.....}}}........,,...||||},..}}))}},.||,,,)),.,))))))..)).)))))).))))))))))))}................{{(((,.,....,.,}}}}{{{((({.......)))}))))}.,)))))))},||((((((..,((((......)))).,..))))))}|....|{|.....{(((((........)))))},|}}}.|,...{{{({{.{{{......)))..}))))).,,,..}.}))))))))))))...,(((,,.|||,}}}||||..|||{{{{{|||{...,,||{{.,|,.,,}}},)))),,..,)))}}))}..|}})))).......,},)}},,..)))))))..)))),.,|(((((((((((((((...((((((((.(.(((,..{({{{{((((........))))|,,|||||..,(({{{.{{{|,,...,,,,)))).))))),.,))).}.)))))..}))...))))))))))))))),...((((((...(((((.((((...,,...,},..}})).))))}...)))))))))))))))))))))))},}}},,,,{((((((({((((((((.((((((.{(((,{,..((((((.....))))))..,...{,,,,...{(((....))))..,}))))))))))))))))){((((((((((((((({{(((((((({.,...{(((|,,....((((((..((((((({,{{{{.,...{,,,..,.{{{.(((((((.{,,.,........((((((.........))))))....(((((((....))))))),.((((((((((((....)))))))))))),.{(((.(((.((((...)))).))))))}..}},.})))))}.,))})}},,,)))))))..))))))..,,}}}}}}.))))))))).)))}}}}}}.,,,,,..))))))))}.,,.........))))))))),,})))))),))))}.}}}}.,{{{{,......)))}))))))))))))))){{{{{,.,,}))))).....,}}})))))}.))))))).,,.................,,..........
Back