Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_002991.3
Sequence Length
1422 nt
GC Content
0.5162
ACUCUGCAAGGACCCGAGCUAUUUAUCCCUAGGUCCUUUCCUCCUGCACGUCAGCUUUGAGCCCCGAGCUGGUGCUUCUGCUCUCUGAGACAUGGCAGGCCUGAUGACCAUAGUAACCAGCCUUCUGUUCCUUGGUGUCUGUGCCCACCACAUCAUCCCUACGGGCUCUGUGGUCAUCCCCUCUCCCUGCUGCAUGUUCUUUGUUUCCAAGAGAAUUCCUGAGAACCGAGUGGUCAGCUACCAGCUGUCCAGCAGGAGCACAUGCCUCAAGGCAGGAGUGAUCUUCACCACCAAGAAGGGCCAGCAGUUCUGUGGCGACCCCAAGCAGGAGUGGGUCCAGAGGUACAUGAAGAACCUGGACGCCAAGCAGAAGAAGGCUUCCCCUAGGGCCAGGGCAGUGGCUGUCAAGGGCCCUGUCCAGAGAUAUCCUGGCAACCAAACCACCUGCUAAUCCCCGCCCAGCCCUCCAGCCCUGAGUUUGGGCCUGAGCUGCUUGGCGGGCUACUCGGGGCCUGGAGAAGCCACAGUGAUGGGGGGAAGAGCUAAUUUUCCUGUUUCUUAGCAACACUCUCCAGGGAUGUGUCUCUUCUAUGAAAAACCCGAGGGAGCAGGUGAUGUGGUUCCCGGGGGCUGAGCAAUGGCUCCAAGCAUCCAAGGCCCCUUGCCUUUCUGGAGCUGGGUGAGAAGAUCCCAGAAGGAGAGCAGUGGCAACUCUUUGCCUUCUCCUCCUGACCUGGUUCUGAUGCUUUUUCUUUUUUUUUUUUUUCUGAGACGGAGUCUCGCUCUGUCACCCAGGCUGGAGUGCAGUGGCACAAUCUCGGUUCACUGCAACCUCCGCCUCCUGGGUUCAAGUGAUUCUCGUGCCUCAGCCUCCCGAGUACCUGGGACUACAGGUGUGUACCACCACACCCAACUAACUUUUGUAUUUUUAGUAGAGAUGAGGUUUCACCAUGUUGGCCAGGCUGGUCUCAAACUCCUGGCCUCAAGUGAUCUACCUGCCUCGGCCUCCCAAAGUGCUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACCACACCCAGCCUACUCAAACUUUUAUGUUGAAAAAAAAAAAUCAUAAUUUUUUUUUUUUUAAAGGAAAUGAACGUGGAGGACUGGGGUGAAGGGCCAGCCUGGGUAGUUUAAUCUUUUUGGGAAGACAUGACUUUAAGGAGAUUCCCUGCUUUGUGACAGGUUGCUCCAUGCUGUCUUGGGGACAAGGGCCUGUACUGCCUUCAAAUCUGGGCUCACCCCACAUUUUGGUGAGGGGAAGAUAGGGUGGGGGGAUUAGGGGGAGAAAAGACUCUAGCUUUUUUUUUCUAUGCAUGAUAUACUGUGUGGGUUUAUCAAGAGUGUAGACACAGUUGCUGUUCUCAAAUAAUAGGCCAAAUAAAAUGCGAUUCUUUUUUUCUUUGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-521.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -548.80
Frequency: 0.0000
Diversity: 428.35
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((((((..((..........)).)))))))..(((((((..(((.(((..((((.....((((((.(((((((((.(((.(((((((((((...(((((((((((.....(((((...((.....((((..((((.....)))).))))...)))))))))))))))))).......)))))..))))))(((.((((.((.((....)).)).)))).)))(((.(((((...))))).))).)))))))...((((....))))((.((((...))))..)).))))).)))))).))))...)))))).....)))))))(((((((((.(............))))))).))).)))))((((.((.........((((.((((((.((((......)))))))))).((((......((((((.......(((.(((((((((..(((.((((((((((((((((...(((((..(((....)))))))))))))))).))))))....((((....(((((((....(((((............)))))....)))))))....))))..((((((.........(((((...(((((((.((((((((((((((((((((((..(((((((((((((.(((((.....)))))...((((((((((.((.((.....((((((((((.(((....))))))).)))))).)).)).)))))))))))))))))..((((..............)))).))))))(((((.((..(((((((.(((((((((((((.((.......))))))))))..)))))...))))))).)))))))......)).))))))).)))).......)))))))))((((((......)))))).((((..(.(((.((((...)))).))).).))))((((..((..(((((((..(((.....)))))))))).)).))))..))))))))))))((((((((((((.((((....(((((.((.(((..(((.((((((((.........(((...((((((((((((((.......))))))))))))))...))).........))).))))))))...))))))))))(((((...(((((((((..((((......)))))))))))))..)))))..(((.((((((((((((........))))).))...)))))))).((((........))))....)))))))))))).))))))))))..)).)))))))))))).)))(((((((.......)))))))..(((((((.(((((.(((.....))).)))))...)))))))....))))))..))))........)))).........))..)))).............
Thermodynamic Ensemble Prediction
..,,,,,(((((((.,(,.......,,.,}.))))))}{{((((((({{.,((((((.(....,.})))))}})),{(((({,...,.},,,.}))))|...{{(((((((((.....(((((...{{....{((((,.,{,,..,},}))),)).,...}})))))))))))))||((((((.((((({((((.({(((((((((((((((.,.,,{.........,,,|((.(((((...))))).))|(((((((((,.,({(,(((((((((.{.(((((((....(((((((({((({,({....}})))),,,{{{..,,,}}.}||||||({(,({{.{.......||}}|}}}.}}}..{((((((((((,{,....,|||||,((((((.((((......))))))))}|,{({,..,(((((.(((((...((((((((....((((((.(((.(((..((((.......))))..)))..))).)))))),,.((((((.{{((((((.{{((,,....|||{((({{{{,,...}}}}}}|{{,...,)))....}))))))}}..,,,,.,,|,,},..},....)))))),,))))))))...))))).)))))}{{{((((....)))).,{||{{{.(((((.....)))))..,||{{((((((.,,.....},|{{.(((((((.,,.(((({....)))))))))))),)),})))))))))))})))),,},,........,}}}}}}).((((((((...))))))))(((((((((((,(((((((((,,(......,,}}))))))}.{|||||{,,|||||||.,..||{...|{{||||||,....((((,{((((.(((((.....((((((......))))))..,{,,,,.....|,...,,}}},|||..,((((.((((..((..(((((((..({{.....,),))))))).)).))))...)))){{,,,.)}.)))))..)))))))))...,||||}||}|,|,}{{{,|||||{{{.,,{,..{,(((,..{(((((((((((((.......))))))))))))))..,,,,.},..}}))))).}))))))).,})}))))))))))).,.....|))))))))((((......))))..)))))))}))))))))).,.})})})))))).)))).)))))))))))))))).))),..((((........)))){{.(((({(,.....))).))))},}.))))).))))))},,)))))||(((((({.,{..{|,||||,,,{((((((.(((((.(((.....))).)))))...))))))}.,,,{..|}}}}|,},.....,,,)},,.,,.,,},.))}}.}}}}}}},,,......
Back