Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_003216.4
Sequence Length
4381 nt
GC Content
0.5663
GCAGUAGCUGCCCGUGUCGGCAGCUGCAGCGGGUCGCACGGCUCCGGCCCAUCUCGGGGGGCGGGCGGGGGAGGCGAGGUGCGCGAGCCGAGUCCGGGGCACGAUGUCCGACGCGGGCGGCGGAAAGAAGCCGCCUGUGGACCCGCAGGCAGGACCCGGUCCGGGGCCGGGGCGCGCAGCUGGGGAAAGGGGCCUGUCGGGGUCCUUCCCCCUGGUCCUGAAGAAGCUGAUGGAGAACCCCCCGCGCGAGGCGCGCCUCGAUAAGGAAAAGGGGAAGGAAAAGCUGGAGGAGGACGAGGCCGCAGCCGCCAGCACCAUGGCUGUCUCAGCCUCCCUCAUGCCACCCAUCUGGGACAAGACCAUCCCAUAUGAUGGCGAAUCUUUCCACCUGGAGUACAUGGACCUGGAUGAGUUCCUGCUGGAGAAUGGCAUCCCCGCCAGCCCCACCCACCUGGCCCACAACCUGCUGCUGCCUGUAGCAGAGCUAGAAGGGAAGGAGUCUGCCAGCUCUUCCACAGCAUCCCCACCAUCCUCCUCCACUGCCAUCUUUCAGCCCUCUGAAACCGUGUCCAGCACAGAAUCUUCCCUGGAGAAGGAGAGGGAGACUCCCAGUCCCAUCGACCCCAAUUGUGUGGAAGUGGAUGUGAACUUCAAUCCGGACCCCGCCGACCUGGUGCUCUCCAGUGUGCCAGGCGGGGAGCUCUUCAACCCUCGGAAGCACAAGUUUGCUGAGGAGGACCUGAAGCCCCAGCCUAUGAUCAAAAAGGCCAAGAAGGUCUUUGUCCCCGACGAGCAGAAGGAUGAAAAGUACUGGACAAGACGCAAGAAGAACAACGUGGCAGCUAAACGGUCACGGGAUGCCCGGCGCCUGAAAGAGAAUCAGAUCACCAUCCGGGCAGCCUUCCUGGAGAAGGAGAACACAGCCCUGCGGACGGAGGUGGCCGAGCUACGCAAGGAGGUGGGCAAGUGCAAGACCAUCGUGUCCAAGUAUGAGACCAAAUACGGGCCCUUGUAACCCGUGCCCCCCGCCCGGGCGGGGUACUGCCUGCACCUCAGACCUCUGCCUGGGGGCUCCCUGUAACCCCUCACACGCGUGGAGACUUAUGACUCGUCGUGGGCGCAUGGCGGCGCACCUGCUGCAGGAGCGGCCACGUCUCAGCUUCAUUAUACCAUGGCCUGCGCACGUGGCGACGUCCCUGAGGGGCCAGUCUCCUCACUGGUGGGGAACGCAAGAGAAUCUGCGUAGAUGGGUGACUCAGCCUUAGUUUCUAUUCUUGGAUGUCCCAGUUGAAUCAGAAGGGGACCUCUGGAGUACACACCUCUCUCCUGGGCGCUCAGGGUCCCUGGACUCUCCCUCAGUCUCCAGCCUGGGCUGCCGAGGGCUAUCUCUGCAGAAUGAGUUGUGAUCAUUGUCACCCUAUGUCUUCUCAGGUAGCAGGGCGCGUUUCCACUUAAGGUGUGUCUGUCACGCACCUCAUUCUCCCCAGACAGUCUUUGAGUAACAUCUGUUCCCAUCUUCCUUGGAAGCAGGACACACCAGCUCCUCCGUCAGUGUCUGCAUGGGUAGCAGGCUGCAGGAGUGGGGUCUCUGCACAGCCUGGGAUGGGGCUUGGGGCUGGGGCCUGCAGCAGAAGUGUGCCCAGCGUUUCUCGGCUCCCGCACCCCUUUUCCCUUAUGGCUCUGAGGCCAUCGGCUGUCUCUGCAUUUCAUUGGCUGUGGAGGAGAGACUCCUAGGAUGGCUGCUGUCUGAGCCAUGAGUGCCAGGGCUGAGAGAGGCCUCUUCAUUUCCUCUCCAGGCUACUCAGAGGCCAUGUGAAGCUCGUUUGUCCCACUAGACCAGGCCUCUGGGCCUGCUCUUUCUUUCCACCCAAUGUCCAGUCUUGGAUCAUAGAUUUAAAAGGAAAACCCCUCUUAUCUAGGAGGCUUUAACUUCCUGGACCCCAGGAUUCACCUUCCUAGUGGUGUUUAGAAAAUGCCUCCACAGCCCCCUUCCACCAUGGGCAUGAGAGCUGGGGUGUGUUUCUUGAGAAGCUCCCUUUUUUCUUGCUCUGCUCACCGGUGUGGCCUGGGCUGGAGUGCACUCUCCCUGGGGGCAGCUGGGGCCUCGCAAUUCUUGCUUCAGGAUCUCUCCCAUGCGAGCUGCCCGGAGGGUGUCAGCAGGGCAAGACACCUAGUCUAGAGUCACCAAGGUCACAGUGCCACUUUCACGGGAUAGCAGGCUCUUGGGACUUUUACACAGGCCUAGGGUCCCCUCAGUCUUGGUCCCAGGAGAUGGGGGCCACUCGUGAGGCUGGCCAUGCUGUGGCUUCUCACAGCUGUGGUCUCCCCUGCCUCACAACGACUCCUUUCUCUUGUGUGGCGGGACUCGCCCUUUUGCUGUGCUCAGAAGAUUCACUGAGGAAACUCAUGGAAGCCUCUGCUCAUUUGGGUCACUGGGACACCCCUGAGAUGGGUGUGUUUAUUUGCUCAGGGCGGGCAGCCUAUGGUGAAGAGGAGACAGAGGCGAUGGGCGUGCUUCGUCCUCCGUAACACUGGCUUUAUUUACCGUGGUGGUUCAGAGUCCCAGGCCCUGACCUCUAAAGACUUUUCAUAACAGACGUUAAGACCAAGCCGUGGACCUCACCCCAGGGGAAUGCCACGGCCCUUUGGGGACCUGCACACCCACCUCUCCGGGGGACUUGACAAGGGGCCCUGAGGCCAAGGGAGGUCACUCCUCCCUCCAGGCCCCUGACUUUUACUUUGUGGUUCUCUAAAAACCAUGUACACACUUUCACUCUAUUGUAACCACACAGGGCAGGCGCAUCCAGCAUGUCAGUGUCCUGCCCCGGGCAGCUCUCCCUCCCGGGCACGCUCCCUCUGGCCUGGUGGAUCACCAAGAGGGCGGUUCUCAUUUUGUUAUUAGUGGAAGAGCCUUGAGCUUAAAAGCUCUUCAUUUUCUUUGCCGGAAAGUAUAUGGUUUGUGUUUUUGCAGUUUUAUUUUUUUAAGGAUGGACACUAAAUCUCUGGUGUCCAUGUUCCGAGCCCGGUGGCUGGGAUGGUGGCUCGAUGUGUCUCCUCUUUAUCCCGCCCUCUGCCUGUUUGGUGCCCUCCCUUCUUUCCCCCAGGCAGUGGGUAUCGGGUUCUUUCCCAAAGUGCUUACUUGGAAAGAGUGUGGCUGCUGGACUCUUUUCGAAAUGCCCCUCUGAGUCAGGAGCCUGGUGGGGACAAGAUGGAGGAUGUCCACAGAGGCUGACCUGUGGGGGAAAAGAAGUGCUCAGGUAAGGUUGUCUCCUCUCCUGUCCUAAAAAAAUCCAUGCUUGCAGGAGAGGGUUGGUGCCUGCUCAGUUUCUGUCGAGGGAAUGGGAGUCUCCUCGGCUCCCUCCUGGGCCCUCUGCUUCUUGGAGGCCGACCGCUGGAGACUGCGGCUCCUGUGCUUGGAUCUUUGACAUCUGUCAGUCACUGGAGGCUAGAGAAGUUGACUUUACCUUGGCUUUCUGUGGGUUCCCGAUGGGCUUGGAAGUGCCGUCUACUUCCUAAGCAUCCUGUCUAAAGCUUUGUGGCACCCUCAGUGCAACCUCAGAACAGACAAAUCAUGAAUGAGCUGGAACUUUGCAAGAAUAUUCAUAUUAUAAAUGUCUCAUCUGAUGGAGGAACGUGUGCAUUUAGAGAGAGGGAGAGUUUUCAAGGUUUAUGGCAACUUUGUGGAGGACCUGGGUAACUCUUACCCUUGGCCAAAGGAAGAGGUUUUCCUGUCUGGCUUCUGAGGUUGGAGGGGGCACUUAGCAGUGAACCUUAAGUCUGGGUACAUGUAACCCUGCUGAGGGGCUGUGCAGGCCGCUCCUACGGUCCUUUGGCCUGAGGCAGGGCGGGAGGCAUGCAAGCCAGUGGGGGAAAACCCCUCUGAAGCUGGGCAGCCCUCUACCUGGGCCCCGGGAGCCGUGCUCCUUGGAACGCAAAGGGCCGAGGAGCAUCUGGUUUUCAUGGCAAAGCUCUACUCCAGAGCUCCUUUAACAUCUGCUAAUUAAGUGCAAUAAAUUUUUCUAGAAAAUGGCAAAGAUGACUUCCAGGUGGAUAUUGCUCUCUUACGGUGUUGGGGAUGCCAGAACACCACUUGGUUUUAUUUUUCUAAGUGCAUGUGAUGUGAUAGAGUGUGUGGGGCUCUGUGUCCUUCCCUGGGAGCUGGCAUUCCAGCGGGCCCCUCUCUUUACCUUUGUUGGGGGAAGGAGGCAAGAGAGAAAUUCCUUCUUCCCAGCCAGAGAGGGCAGAAGCAGACCGUAGCCCAUUGGCCUUAUGUGCGUGUGUGCGUGCGAGUGUGUCACUGCUGGUGGGCCGGAGUGAUGUGGUGGGAGGGAAGCCGGGAAUGUAUCCUUUUCAGACAAAAUUAAAUAUUUUGAAAUGAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1831.3 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1900.2
Frequency: 0.0000
Diversity: 772.8
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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