Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_003805.5

Sequence Length

1189 nt

GC Content

0.4794

GCCAUUAACAAAGAUGGUGCUUAUGGGGCAGGUUCCCUAACAGUCAGGAUUCCGGUUGCAGUUUUUCUCCCCCGCCCCAAAGAUACGUGGUUGCAGACGGAGAAAUGGAGGCCAGAGACAAACAAGUACUCCGCUCACUUCGCCUGGAGCUGGGUGCAGAGGUAUUGGUGGAGGGACUGGUUCUUCAGUACCUCUACCAGGAAGGAAUCUUGACGGAAAACCAUAUUCAAGAAAUCAAUGCUCAAACCACAGGCCUCCGGAAAACAAUGCUCCUGCUGGAUAUCCUACCUUCCAGGGGCCCUAAAGCAUUUGAUACAUUCCUAGAUUCCCUACAGGAGUUUCCCUGGGUCAGGGAGAAGCUGAAGAAGGCAAGGGAAGAGGCCAUGACCGACCUGCCUGCAGGUGACAGAUUGACUGGGAUCCCCUCGCACAUCCUCAACAGCUCCCCAUCAGACCGGCAGAUUAACCAGCUGGCCCAGAGGCUGGGCCCUGAGUGGGAGCCCAUGGUGCUGUCUCUGGGACUGUCCCAGACGGAUAUCUACCGCUGUAAGGCCAACCACCCCCACAACGUGCAGUCGCAGGUGGUGGAGGCCUUCAUCCGUUGGCGGCAGCGCUUCGGGAAGCAGGCCACCUUCCAGAGCCUGCACAACGGGCUGCGGGCUGUGGAGGUGGACCCCUCGCUGCUCCUGCACAUGUUGGAGUGAUGGUGCCUCCAGCAACCGCUGGGGAGUGUGUCCCUGAGUCAUGUGGGCUGAAUCCUGACUUUCACUCAGAGCAGGUGGUUUUUUGUGUAGGUUUGUUUUUUAUUUUUGAUGAUCUUCAGAUGGAAGGAGAAAACAGGGUUUCCACUAGACAUUACUUGAAAGGCCAGAUUACUCAGCAGAUCUCCCAUGUUGGCUCAACAAUUCUUUGUUUUUAAUUGCUUGAAGAUUGCAUUGUUGUAAUUGUUCAGUUUUUAAAUGUGUAAUGGCAUUUUAAUAGACUAGUAAAUCACAGUGGUUCAAAAUAUAUAUCCAUAUAUAUAUAUAUCCAUAUAUAUAUCUCAUGUCAUCACAUUACAGGCAGGUGUCUCAUAUGUAAAACAUUUACCUGAAUGUUGUCUGAGGACUGAACUGUGGACUUUACUAUUCAUAAUGAUAAAAUAAUAAAAUGCGAAUUACUAUAUAUAAUGUGCCUCACUCAUGAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-403.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -426.37

Frequency: 0.0000

Diversity: 372.88

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((......)))))).((((((((..(((((((......(((((((((((.......((((.((((....((((((......(((........)))......))).)))..)))).))))..((((((.((((.(.......))))).)))))).......((((((((((.(((((....))))).))))))))))...))))))))))))))(((((.(((.((((((((((.(((((...((((((((.((.((.....(((((((((.(((((..........))))))))......)))))).(((((((((((...((((((.......((((((((...)))))))).(((......))).))))))((((((((..(((((.((..((((((.(.(((..(((..(((.(((((((.((((.(((...((((((((((((((...(((.(......).)))(((((((...))))))))))).))))..(((..(((((((((.((((((...))))))(((((..........((.((((((..(((((......((.(((....))).))))))).)))))))))))))....)))))))))..)))..(((((((........).)))))).....)))))).))).)))))))).))).)))))))))).)))))))).))))).))).....)))))((((....))))))))))))))))).))))).)))))..((((........))))....)))))..)))))))))).))))))))((((((((....(((((.(((..((.((((((............))))))))))))))))..))))))))........((((((.........))))))...(((((....))))).((((..(((.((((((((((....))))))).))))))..))))(((((((((.((((((((.((((.((((((((((((((((..............))((((((((((......)))))))))).(((.(((.(((.((.(((..((((((..................))))))..))).)).))).)))))))))))))..))))))).))............)).))))))))..))))).)))).......))))..))))))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((......)))))).((((((((,,({((.{{,,....((((((((((({,{..,.(({(,((((,...(({(((......{{|,,..,,..}}),,,,,.}}}.))),.}}}}.,}}}..((((((.((((.(.......))))).)))))).......{(((((((((.{((((....))))}.)))))))))}...)))))))))))||.,{{||.{{{.||||{{((((.{{{({...,{,,,{({{((.((,,....,{{{({(,.|||||.,,......,)))}))))}}....)))))}.((((((((((,.{{((((.....)))))|((((((...))))))|{,(({{.....(,(((.(((.((((((.(.(((,{((((((((((.(({{{{(,,{{..,(((.,.|}},.,||,|||,,,....((((((..((((...(((.{......}.)))|((((((...))))))}))))..))))))....||{{,||||(((((((...))))))}{{|},,...,))}.{{,..((,....,..},..,,.}).)))))..))))))))).).))))))}.))).))).},.}|,}|||||{{{,{(({((((((({{(((.((((((((........)))))))).))))))))).}}}}}.}})||}}|,|{...,|||||||}}.,,,,})}}|||||,...)))))))))))))))}},|||||,|||||{.|||,.{{{{.{{||,....})))))}}||||}|||||.||||||||((((((({,,,,((({{.,,,}}||,||||||,||,,,,},,,.}}}})}}}}))}}})),.})}}}}}}}|{,,,..,|||,,},,,.,}},))})))}}}|((((....))))},((((..(({,(({(((((((....))))))).))))))..))))|{({(((((.((((((((.{,((.((((((((((((((((,,.....,,,,.....{{(((((((({{,...)))))))))},(((.(,(,,,({(({,(({{,((((({............})))}),))))}}))),),,)))}))))},)))))))..))))))).))............,,.)))))))).,})))).))}}..,,,}.)))),.}}))))))...