Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004036.5
Sequence Length
4950 nt
GC Content
0.5966
GAGCGCGCGUGGCCCCGGAGCCGCCGGCGCCGCGCGGGGAAUAGCUGUGCAGCACGCCGAGCCCGGACUCGGCUGGCUCGGCUCGGCGCGGGCGGGCGAGAGGAUGCUGGCGGGCUUCCCCGGGCUCGGCCCGCGCUCCCGCCGGGGAGGGCCCCGCGCGCGCCCCUAGCAGCCGCCGCCGCCGCGGGUGCAGGGGAGGGGUCCGGAGAGCCGCGCUCGCCGCCGCCCGCGCCUGCCGGCCCCCGCACGGCCCCUGCCCCUGAGCCUCAGCCCCAGGGCGGGCGCGCUGGGCCGGCGCCCACGGAUCUCCCAGCCCUCGUCGCCGCCUCCUCCUUCCCCCUGCGGCCGGGCGCCCGCGGAUGCUGAGGGGCAGCCCUGCGCCUCUCCCGGUCGGAUCCCGGGCCUGACGGCGGGAGAUCGCGCUCCGGCCGGGCCCCGAGGCGCUGCCGGGGCGGCGCGGCUCUGCGGGGAGCAGCCCUCGGGCGCGCCGAGCUCUCCCGCCCCAGCCCGCGCGGGGACCGUCCCGGAGCACGCGGUGGCCGAGUUCCCGCACAGUUCUAGCUGAUCAGUGCUACCUGUGCUCUGGAAACCCGCUCUGCGUUCCUGCUGGAGGUGGCCUCCCCUCCGCCCCAGACAAGAAGAGGCCCUCAGCCCUCCCCCGGUCUCAGAGAGCCCUGAGAGGAGGCCCAGUCCAGAGCUCUUCCUCCGUUCCCAGUCCACUUCUCUAGGGCCAGUAGCAGACACCAGCCAGUAUGCCGAGGAACCAGGGCUUCUCCGAGCCCGAAUACUCGGCCGAGUACUCAGCCGAGUACUCCGUCAGCCUGCCCUCCGACCCUGACCGCGGGGUGGGCCGGACCCAUGAAAUCUCGGUCCGGAACUCGGGCUCCUGCCUGUGCCUGCCUCGCUUCAUGCGGCUGACUUUCGUGCCGGAGUCCUUGGAGAACCUCUACCAGACCUACUUCAAAAGGCAGCGCCACGAGACCCUGCUGGUGCUGGUGGUCUUUGCAGCCCUCUUUGACUGCUACGUGGUGGUCAUGUGUGCUGUGGUCUUCUCCAGCGACAAGCUGGCUUCCCUCGCCGUGGCUGGAAUUGGACUGGUGUUGGACAUCAUCCUCUUCGUGCUCUGCAAAAAGGGGCUGCUCCCGGACCGGGUCACCCGCAGAGUGCUGCCCUACGUGCUGUGGCUGCUCAUAACCGCCCAGAUCUUCUCCUACCUGGGCCUGAACUUCGCGCGUGCCCACGCGGCUAGUGACACGGUGGGCUGGCAGGUCUUCUUUGUCUUCUCCUUCUUCAUCACGCUGCCCCUCAGCCUCAGCCCCAUCGUGAUCAUCUCCGUGGUCUCCUGUGUGGUGCACACGUUGGUCCUGGGGGUCACCGUGGCCCAGCAGCAGCAGGAGGAGCUCAAGGGGAUGCAGCUGCUGCGGGAGAUCCUGGCCAACGUCUUCCUCUACCUGUGCGCCAUCGCUGUGGGCAUCAUGUCCUACUACAUGGCUGACCGCAAGCACCGCAAGGCCUUCCUGGAGGCCCGCCAGUCGCUGGAGGUGAAGAUGAACCUGGAAGAGCAGAGCCAGCAGCAGGAGAACCUCAUGCUUUCCAUCCUGCCCAAGCACGUGGCUGACGAGAUGCUGAAAGACAUGAAGAAAGACGAGAGCCAGAAGGACCAGCAGCAGUUCAACACCAUGUACAUGUACCGUCACGAGAACGUCAGCAUCCUCUUUGCCGACAUCGUGGGCUUUACCCAGCUGUCUUCUGCCUGCAGUGCCCAGGAGCUUGUGAAGCUGCUCAACGAGCUCUUUGCCCGCUUUGACAAGCUGGCAGCUAAAUACCACCAGCUGCGGAUUAAGAUCCUGGGCGACUGCUACUACUGCAUCUGCGGCUUGCCCGACUACCGGGAGGACCACGCCGUCUGCUCCAUCCUCAUGGGGCUGGCCAUGGUGGAGGCCAUCUCGUAUGUGCGGGAGAAGACCAAGACUGGGGUGGACAUGCGUGUGGGGGUGCACACGGGCACCGUGCUGGGGGGCGUCCUGGGCCAGAAGCGCUGGCAGUACGACGUGUGGUCGACUGAUGUCACUGUAGCCAACAAGAUGGAGGCCGGCGGCAUCCCUGGGCGCGUGCACAUCUCCCAGAGCACCAUGGACUGCCUGAAAGGGGAGUUUGAUGUGGAGCCAGGCGAUGGGGGCAGCCGCUGUGAUUACCUAGAAGAGAAGGGUAUUGAAACCUACCUCAUCAUUGCCUCCAAGCCAGAGGUGAAGAAAACAGCCACCCAGAAUGGCCUCAAUGGCUCGGCCCUGCCCAAUGGAGCACCAGCUUCCUCAAAGUCCAGCUCCCCUGCCCUCAUUGAGACCAAGGAGCCCAACGGGAGUGCCCACAGCAGUGGGUCCACGUCGGAGAAGCCCGAGGAGCAGGAUGCCCAGGCCGACAACCCCUCAUUCCCCAACCCACGCCGGAGGCUGCGCCUGCAGGACCUGGCUGACCGAGUGGUGGAUGCCUCUGAAGAUGAGCACGAGCUCAACCAGCUGCUCAACGAGGCCCUGCUUGAGCGAGAGUCCGCCCAAGUAGUAAAGAAGAGAAACACCUUCCUCUUGUCCAUGCGGUUCAUGGACCCCGAGAUGGAAACCCGCUACUCGGUGGAGAAGGAGAAGCAGAGUGGGGCUGCCUUCAGCUGCUCCUGCGUCGUCCUGCUCUGCACGGCCCUGGUCGAGAUACUCAUCGACCCCUGGCUAAUGACAAACUAUGUGACCUUCAUGGUGGGGGAGAUUCUGCUCCUCAUCCUGACCAUCUGCUCCCUGGCUGCCAUCUUUCCCCGGGCCUUUCCUAAGAAGCUUGUGGCCUUCUCAACUUGGAUUGACCGGACCCGCUGGGCCAGGAACACCUGGGCCAUGCUCGCCAUCUUCAUCCUGGUGAUGGCAAAUGUCGUGGACAUGCUCAGCUGUCUCCAGUACUACACGGGACCCAGCAAUGCAACGGCAGGGAUGGAAACGGAGGGCAGCUGCCUGGAGAACCCCAAGUAUUACAACUAUGUGGCCGUGCUGUCCCUCAUCGCCACCAUCAUGCUGGUGCAGGUCAGCCACAUGGUGAAGCUCACGCUCAUGCUGCUCGUCGCAGGCGCCGUGGCCACCAUCAACCUCUAUGCCUGGCGUCCCGUCUUUGAUGAAUACGACCACAAGCGUUUUCGGGAGCACGACUUACCUAUGGUGGCCUUAGAGCAGAUGCAAGGAUUCAACCCUGGGCUCAAUGGCACUGACAGGCUGCCCCUGGUGCCUUCCAAGUACUCUAUGACGGUGAUGGUGUUCCUCAUGAUGCUCAGCUUCUACUACUUCUCCCGCCACGUAGAAAAACUGGCACGGACACUUUUCUUGUGGAAGAUUGAGGUCCACGACCAGAAGGAACGUGUCUAUGAGAUGCGACGCUGGAACGAGGCCUUGGUCACCAACAUGUUGCCUGAGCACGUGGCACGCCAUUUCCUGGGGUCCAAGAAGAGAGAUGAGGAGCUGUAUAGCCAGACGUAUGAUGAGAUUGGAGUCAUGUUUGCCUCCCUGCCCAACUUUGCUGACUUCUACACAGAGGAGAGCAUCAACAAUGGUGGUAUUGAGUGUCUGCGUUUCCUCAAUGAAAUCAUCUCAGAUUUUGACUCUCUCCUGGACAAUCCCAAGUUCCGGGUGAUCACCAAGAUCAAAACCAUUGGCAGCACGUAUAUGGCGGCUUCAGGAGUCACCCCCGAUGUCAACACCAAUGGCUUUGCCAGCUCCAACAAGGAAGACAAGUCCGAGAGAGAGCGCUGGCAGCACCUGGCUGACCUGGCCGACUUCGCGCUGGCCAUGAAGGAUACGCUCACCAACAUCAACAACCAGUCCUUCAAUAACUUCAUGCUGCGCAUAGGCAUGAACAAAGGCGGGGUUCUGGCUGGGGUCAUCGGAGCCCGGAAACCACACUACGACAUCUGGGGCAAUACAGUCAAUGUAGCCAGCAGGAUGGAGUCCACGGGGGUCAUGGGCAACAUUCAGGUGGUAGAAGAAACCCAAGUCAUCCUCCGAGAGUACGGCUUCCGCUUUGUGAGGCGAGGCCCCAUCUUUGUGAAGGGGAAGGGGGAGCUGCUGACCUUCUUCUUGAAGGGGCGGGAUAAGCUAGCCACCUUCCCCAAUGGCCCCUCUGUCACACUGCCCCACCAGGUGGUGGACAACUCCUGAAUGGCCUCGAGCCUGCAACAGUCCAAACCGGAAGGGAGAAUUUAUUUUUUGAAACUGAAGGAAGUCCCGACCUUCCUGGAUUGAAGUGCACACUCAUGGACUUUAGGUUUAGAAACCUCCUCAGCCUUCAUUUGUUCGUGGAUGUGUGAGCUCUGAGGGUGGCCCUGCUAUUCCUGUGUGUGCCUGUAGUGUCCCCAGCAUAGGGGUCUUAGGCAUAGGGCUGAACAGUCCUUCCAGAGCCCUCGUUCCAAUCCCUGCCGUCCUUGCCCCUGAGGGGCCCUGACCACUGUGAGCAGGAGGGUGGCAGAGCUGGGACAAAGCUGCCUUUGCCGCUGGGCUUUCCGGGACUGUGGAGGGAGCACAGGCGGGGAAGCUCCACUUCAGACAGGGCUUGGUGGGGCAGGACAUGGCUCCCAUUUUGAAGGGAGGUCUCCAUGUGGUCCGAGUGAGGUGAGACGGCCCUCGUCCUGGUGUUCCUGAUCAUCUUGAAAGGUUCUUCUGGAACUCCUGUCCCCUUAGUCAUGAGAACAGAAAGUGCAAUAUUUCCUUUCACCUGGCAGGGGAGGGGGGAUUUAUUUCUGAAAGAAAAAUAUAUAAACAGAUCUUCUACAUUUAUAUUUUUAAUCUUCUGUUAAAUACACUUUCCGAUAUUGCCUUGCCUUUUGAGCUCUUGCUACAGUCGCCUUUGCUACUGCUUUAAGAGAAUUUACAGGUAUUGAUAAAGAACAAGACUGUUUUAUUAAAAGCUUUAUUCAACUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2061.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2148.91
Frequency: 0.0000
Diversity: 1254.03
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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