Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004044.7

Sequence Length

1972 nt

GC Content

0.4741

GCCACAUCCCGGCAGCCCUCCUACCUGCGCACGUGGUGCCGCCGCUGCUGCCUCCCGCUCGCCCUGAACCCAGUGCCUGCAGCCAUGGCUCCCGGCCAGCUCGCCUUAUUUAGUGUCUCUGACAAAACCGGCCUUGUGGAAUUUGCAAGAAACCUGACCGCUCUUGGUUUGAAUCUGGUCGCUUCCGGAGGGACUGCAAAAGCUCUCAGGGAUGCUGGUCUGGCAGUCAGAGAUGUCUCUGAGUUGACGGGAUUUCCUGAAAUGUUGGGGGGACGUGUGAAAACUUUGCAUCCUGCAGUCCAUGCUGGAAUCCUAGCUCGUAAUAUUCCAGAAGAUAAUGCUGACAUGGCCAGACUUGAUUUCAAUCUUAUAAGAGUUGUUGCCUGCAAUCUCUAUCCCUUUGUAAAGACAGUGGCUUCUCCAGGUGUAACUGUUGAGGAGGCUGUGGAGCAAAUUGACAUUGGUGGAGUAACCUUACUGAGAGCUGCAGCCAAAAACCACGCUCGAGUGACAGUGGUGUGUGAACCAGAGGACUAUGUGGUGGUGUCCACGGAGAUGCAGAGCUCCGAGAGUAAGGACACCUCCUUGGAGACUAGACGCCAGUUAGCCUUGAAGGCAUUCACUCAUACGGCACAAUAUGAUGAAGCAAUUUCAGAUUAUUUCAGGAAACAGUACAGCAAAGGCGUAUCUCAGAUGCCCUUGAGAUAUGGAAUGAACCCACAUCAGACCCCUGCCCAGCUGUACACACUGCAGCCCAAGCUUCCCAUCACAGUUCUAAAUGGAGCCCCUGGAUUUAUAAACUUGUGCGAUGCUUUGAACGCCUGGCAGCUGGUGAAGGAACUCAAGGAGGCUUUAGGUAUUCCAGCCGCUGCCUCUUUCAAACAUGUCAGCCCAGCAGGUGCUGCUGUUGGAAUUCCACUCAGUGAAGAUGAGGCCAAAGUCUGCAUGGUUUAUGAUCUCUAUAAAACCCUCACACCCAUCUCAGCGGCAUAUGCAAGAGCAAGAGGGGCUGAUAGGAUGUCUUCAUUUGGUGAUUUUGUUGCAUUGUCCGAUGUUUGUGAUGUACCAACUGCAAAAAUUAUUUCCAGAGAAGUAUCUGAUGGUAUAAUUGCCCCAGGAUAUGAAGAAGAAGCCUUGACAAUACUUUCCAAAAAGAAAAAUGGAAACUAUUGUGUCCUUCAGAUGGACCAAUCUUACAAACCAGAUGAAAAUGAAGUUCGAACUCUCUUUGGUCUUCAUUUAAGCCAGAAGAGAAAUAAUGGUGUCGUCGACAAGUCAUUAUUUAGCAAUGUUGUUACCAAAAAUAAAGAUUUGCCAGAGUCUGCCCUCCGAGACCUCAUCGUAGCCACCAUUGCUGUCAAGUACACUCAGUCUAACUCUGUGUGCUACGCCAAGAACGGGCAGGUUAUCGGCAUUGGAGCAGGACAGCAGUCUCGUAUACACUGCACUCGCCUUGCAGGAGAUAAGGCAAACUAUUGGUGGCUUAGACACCAUCCACAAGUGCUUUCGAUGAAGUUUAAAACAGGAGUGAAGAGAGCAGAAAUCUCCAAUGCCAUCGAUCAAUAUGUGACUGGAACCAUUGGCGAGGAUGAAGAUUUGAUAAAGUGGAAGGCACUGUUUGAGGAAGUCCCUGAGUUACUCACUGAGGCAGAGAAGAAGGAAUGGGUUGAGAAACUGACUGAAGUUUCUAUCAGCUCUGAUGCCUUCUUCCCUUUCCGAGAUAACGUAGACAGAGCUAAAAGGAGUGGUGUGGCGUACAUUGCGGCUCCCUCCGGUUCUGCUGCUGACAAAGUUGUGAUUGAGGCCUGCGACGAACUGGGAAUCAUCCUCGCUCAUACGAACCUUCGGCUCUUCCACCACUGAUUUUACCACACACUGUUUUUUGGCUUGCUUAUGUGUAGGUGAACAGUCACGCCUGAAACUUUGAGGAUAACUUUUUAAAAAAAUAAAACAGUAUCUCUUAAUCACUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-602.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -641.17

Frequency: 0.0000

Diversity: 620.44

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

........((((..(((...((.((((((...(((((((((..(((((((..(((.(((..........((((((((...(((..(((((...)))))))).(((........((((...)))).....)))((((((.....)))))).((((((.(((.(((((((.....(((((......))))).((((((((..(((..(((((((..((.(((.(((..((((((....)))))))))))).))..)))))))...)))((((.((.((......)).)).).)))))))))))...(((((((..((.....))..)))))))........((((((((((((((....(((....))).....((((((((.....)))).)))).....((((((((..(((.((...(((((..((.((((((((.(((((((.(((..............(((......))).........(((((((.((...(((((..((....))..)))))...)).....((((.(((..(((((((.((((.((((.(((...((((...))))...).)).)))).)))).))....)))))..)))))))....((.((((.(((((........)))))))))))..((((.((.....))..))))..(((((((...((((((((((((......)))))))))((..(((.......)))..))...)))..)))))))...)))))))))))))))))))..)))))).))..))))).)))))..)))))))).....(((.(......).))))))))....(((......))).((((((((....(((......)))...))))))))....)))))))))...(((.(((((((((.(((.....(((...)))...(((((((....)))).)))((((((((.....))).))))).......)))...))))))))).))).(.(((((..(((((((....((.(((((..(((((((((...(((((...((..((((((((((((((((((..........(((((((((((......))))..((((....)))).((((...............))))((((((.((((((..........)))))).))))))((((.......))))..((((........))))..((((((((.(((((.....))))).))))))))...........)))))))))))).)))).))))).))))))...)))))...))))))))).....((((((....)))))).......))))).))....))))).)).))))).)..(((((((..(((...)))..)))))))..))))))).))).))))))...))))))))))).))))))))))..))........)))).)))..))))))))....)))..(((..((((((........))).)))..)))(((((....))))).((((((((..(((..((((((.........(((((...(((.(((.....))).)))...)))))((((((((((...(((.(....((.(.((((.((...(.(((.....))).)(((((((...((((....((((((((...(((((((((((((......))))))..))))))).....))))))))))))...))).))))((((.(((((((....((((.((.((.(((.....))).)).)))))))))))))))))(.(((....))).)...)))))).).))....).))).)))))))))).....(((....))))))))).)))..))).)))))......(((((((....((((((......))))))))))))).............(((((((((.(((((((......))))).)))))).)))))...)))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

,{(.......|||,(((,{,({.((((((...(((((((((..(((((((,.({{.(((,.....,...,{((((((.||(((..{((({...)))))))}.(((....,,..((((...)))),,...)))((((({,...,)))))).((((((.(((.(((((({.....{{(((|.,,..}}}}}|||,{{{{...{{{{{(((((((..(,,((({(((.{((((,{.,{{||||||||,}||,||..||||}}}.,,{|{{{{(({,.{((({{,...,}}})}}}})|)}}|}}.,.{{|||||.}||,,,,,},..)))})))..}}},..,|||||,{{|}|||}}|,|..}}}.,,,.....((((((((.....)))).)))).,...(((((,,,.{(((,{{({{({{(({.,,.,,|||,.|}||{{|||}|,,.}}},,...,....(((......}})...}}}}}}|||(((({{{...{{(((..,,..,,)|,.|||||{.{||,{{{{{({,,({.|,{(({(((((((.(((((.,{{,,,,|||||.|,|,..|},}}})}}|||}|||.||...(||||{{|,|||,,..{|((.((((.,((({,.,{{{{,||||||{{{|,..||||,{{....,||,{|,,...(((((((...((((((((((((......)))))))))((..(((.......)))..})...)))..)))))))...,}}}|||,,,,)))}}},,..,}}|||{|,..,))))),}))),.}))))},,.,}}}||||}}...}}}}.))})}))}}}}|||}..,,.,|||{(((((((....(((......)))...))))))))....},|||||||((.{({.{((((((((.(((....,||{...}}},.,{{{{{((....)))).}}}((((((((.....)))}))))).......)))...))))))))}.|||....|||...,))))))})}|{|,{{(((.,(((((((((..,(((((..,{,..((((((((((((((((({.,{{.,,....,,|||,|||,...{{{{({,..((((....)))).,,)}}}}}....,,{....))}.((((((.((((((..........)))))).))))))((((.......))))..{{{{........))))},,..,,,.,,,|....{((((((((.{{{.....}}))))}}})))).....})))).)))),})))).))))}}...))))),..)))))))}}....,||||||.,,.}}}))),}.}}}})}}}}.}}....,|||||}}|}|||||||.(((((((..(((...)))..)))))))..})))))).))).))))))...))))))))))).))))))))))..})......,,))}}.}}}..))))))}}...,))).......{{||||,...,,))))).||}..}}}|}|||....|,|||,{,,,.(((,.(((..((((((.{{,...,{(({((,{{({,.,,,...,,})).))),..}}}}|((((((((((...(((.,....((.(.((((.((...(.(((.....))}.}(((((((...((((....((((((((...(((((((((((((......)))))),.})))))).....))))))))))))...))).))))((((.(((((((....((((.((.((.(((.....))).)).))))))))))))))))),.(({....})).,...}))))).).))....,.))).)))))))))).....,||...,)),)))))).}}}..|||.,||||||||{|{||{{|,...,||,,}|...,}}))|))}|}}}}}},,),)))),,,,.{((((((({,(((((((......))))).)))))).))))}...,})).