Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004231.4
Sequence Length
678 nt
GC Content
0.5546
GUUUCAGUGGCUUCUGGUGCUCUAGGGUGAGCUCUGCCCGGCUGCAGGGAUGGCGGGGAGGGGUAAGCUCAUCGCAGUGAUCGGAGACGAGGACACGGUGACUGGUUUCCUGCUGGGCGGCAUAGGGGAGCUUAACAAGAACCGCCAUCCCAAUUUCCUGGUGGUGGAGAAGGAUACAACCAUCAAUGAGAUCGAAGACACUUUCCGGCAAUUUCUAAACCGGGAUGACAUUGGCAUCAUCCUCAUCAACCAGUACAUCGCAGAGAUGGUGCGGCAUGCCCUGGACGCCCACCAGCAGUCCAUCCCCGCUGUCCUGGAGAUCCCCUCCAAGGAGCACCCAUAUGACGCCGCCAAGGACUCCAUCCUGCGCAGGGCCAGGGGCAUGUUCACUGCCGAAGACCUGCGCUAGGGGACUCCUCAUAGCCCUCAGCCCUUCCCUCGUUUCCAGGCCUCUCCCCAGGCUUGCCAUCAGCCUUCUUUACUUUUUGAGCCUCUGAUUUCCAAUUCCCUGCUCCUUCCCACUCCAUUAAGAGGCUAGGUGAGGCGCUUCUAGGUUGCUGGGGCUCUGCUGGUUAAGGAACAGGAAGCCUGACCAUCUCCCUCCACUACCUCUUCCCUGUGCUGUUACACAGUGUCAUUGUUGAUGUUAAAUUAAAGUCAUAUUCUUGCUUCUCUCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-233.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -243.45
Frequency: 0.0000
Diversity: 105.72
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((...(((((((......))))...))).)))))).)))))...(((((((((((((..((((((((((((.((((((.((..........)).)))))).((((((((((((((((((((((...)))....................((((((((((..((......))(((.....)))............((((...........))))((((..(((((...............))))).))))...((((((((..(((....((((....((.((((((((.........((..((((((((.....)))).))))))..................((((.(((..((((((((((......((((.......)))).....))))))).)))))).))))...(((((.(((((((.....(((((((.(((((((....(((((.......)))))............((((....((........))...))))...............)))))))..).)))))).....)))..)))))))))))))))))...))..))))..)))..)))))))).)))))))))).)))))))))))))))...))))))))))).)))))..................))))))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((...(((((((......))))...))).)))))).)))))...(((((((((((((..((((((((((((.((((((.((..,.......)).)))))).(((((((((((((((((((,,.....,|....................((((((((((..((,.....}},,,.,,{,|||.{{,,...,,}|((((...........))))((((,.,||||..,,},,,,......,,,||.,,,,...((((((((..(((.,..((((..,.{{.((((((((.........{,,.((((((((.....))))},)))}}........|.........((((.(((..((((((((((......((((.......)))).....))))))).)))))).))))...(((((.(((((((.....(({{{{({(((((,,....|||||}}....,||||}.,,.........((((....((........)}...))))...............))))))).}),)))))).....)))..))))))))}))))))))...})..))))..)))..)))))))).)))))))))).))))))))))))))}...)))))))))))}}))))..................))))))))))))).
Back