Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004322.3
Sequence Length
1240 nt
GC Content
0.6589
AACUAGGGCCCGGAGCCCGGGGUGCUGGAGGGAGGCGGCAGGCCCGGGUCAGGGGCCUCGAGAUCGGGCUUGGGGUGAGACCUGUGCGCCGUCACCACGGGCGGGGCGGGGCCUGGGUCCACCGGGGUUCUGAGGGGAGACUGAGGUCCUGAGCCGACAGCCUCAGCUCCCUGCCAGGCCAGACCCGGCAGACAGAUGAGGGCCCAGGAGGCCUGGCGGGCCUGGGGGCGCUACGGUGGGAGAGGAAGCCAGGGGUACCUGCCUCUGCCUUCCAGGGCCACCGUUGGCCCCAGCUGUGCCUUGACUACGUAACAUCUUGUCCUCACAGCCCAGAGCAUGUUCCAGAUCCCAGAGUUUGAGCCGAGUGAGCAGGAAGACUCCAGCUCUGCAGAGAGGGGCCUGGGCCCCAGCCCCGCAGGGGACGGGCCCUCAGGCUCCGGCAAGCAUCAUCGCCAGGCCCCAGGCCUCCUGUGGGACGCCAGUCACCAGCAGGAGCAGCCAACCAGCAGCAGCCAUCAUGGAGGCGCUGGGGCUGUGGAGAUCCGGAGUCGCCACAGCUCCUACCCCGCGGGGACGGAGGACGACGAAGGGAUGGGGGAGGAGCCCAGCCCCUUUCGGGGCCGCUCGCGCUCGGCGCCCCCCAACCUCUGGGCAGCACAGCGCUAUGGCCGCGAGCUCCGGAGGAUGAGUGACGAGUUUGUGGACUCCUUUAAGAAGGGACUUCCUCGCCCGAAGAGCGCGGGCACAGCAACGCAGAUGCGGCAAAGCUCCAGCUGGACGCGAGUCUUCCAGUCCUGGUGGGAUCGGAACUUGGGCAGGGGAAGCUCCGCCCCCUCCCAGUGACCUUCGCUCCACAUCCCGAAACUCCACCCGUUCCCACUGCCCUGGGCAGCCAUCUUGAAUAUGGGCGGAAGUACUUCCCUCAGGCCUAUGCAAAAAGAGGAUCCGUGCUGUCUCCUUUGGAGGGAGGGCUGACCCAGAUUCCCUUCCGGUGCGUGUGAAGCCACGGAAGGCUUGGUCCCAUCGGAAGUUUUGGGUUUUCCGCCCACAGCCGCCGGAAGUGGCUCCGUGGCCCCGCCCUCAGGCUCCGGGCUUUCCCCCAGGCGCCUGCGCUAAGUCGCGAGCCAGGUUUAACCGUUGCGUCACCGGGACCCGAGCCCCCGCGAUGCCCUGGGGGCCGUGCUCACUACCAAAUGUUAAUAAAGCCCGCGUCUGUGCCGCCGAAAAAAAAAAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-590.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -610.01
Frequency: 0.0000
Diversity: 414.40
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((((((((((((((.(.(((((((((((((((((.(((((((.((((((....(((.(((((..(((((((((......((.(((((......))))).))((((((((((((..(((((..((((.((((((.((((((..(((......)))))))))))))))..)))).....)))))..))).((((...(((..((((.(((((.((((((((((((.(.(((((((....(((((.(((((((....))))))).)))))....))))))).)))))).((((((....(((.............)))..)))))).((((((..((((.((((......)))))))).((((..........))))..))))))......(((((....)))))..((((...)))).)))))))))))))))))))...))))....))))))))).(((((((((((((((....))).))).))))))..)))..(((((.((..(((...)))..)))))))((((((((.(((.....))).)))))))).....(((((.((((((((((((......(((.((((((((((((...(((((....))))).))))(((((..((((((..........)))).))..))))).....((((((((((.(..(......)..)))))))))))..((((((...))))))))))))))))).....((((.(((..(((..(((....))).....)))...))).).)))..))))))).))))).)))))...((.(((.(((.(((((..((...)))))))))))))..)))))))))))...)))))..)))........))).))).)))))))..((.((((...(((((((((((....)))).....)))))))....)))))).....)))))))))))))...(((.(((..((((((((....(((((((((.(.((.(((((......))))).).))))))))))).)))))))).))).))).))))).))).....))))))).))))).((...(((((..((((((((((((((((.(((((.(((........)))))))).........(((((.(.(((........))).).)))))))))))))........................)))))))).)))))....))...................
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,(((((((((((({((((|(|{(({(,({((((((,{(({((((((.(((((((.(.(((.{{(((((,,(,(((.((((.((,(((((.({.|.,((((((((((((((((((((.,(((((,((((.((((((.((((((,.{((......))))))))))))))}{{|||{{{...||,||{.,,|.,,,|...|||,,||.|||||||||{(((((((((,{(,(((((((....(((((.(((((((....))))))).)))))....))))))).)))))).((((((....(((.............)))..))))))}))).))..,,,,|||||}}}.,.|||}},||,..,,{{{{.{{{...,))}.)))){||...}.||||||}|||}||}.}||||}}.))))}))))),,.))))))))..)}})).,,})),),))))))).(((((((((((((((....))).))},))))))..)))..(((((.((..(({...}))..))))))){(((((((.(({.....))).)))))))|{{...{{{({,((((((({((({......(((,((((((((((((...(((((....))))).))))(((((.,(((({{..,......,)))}.))..)))))...,,((((((((({{(..{......}..))))))))))).,{((((,...}))))}}))))))}})},..,.{{{|||||..,((..(((....))),,...||},..)))||,}}},.)))}|||.|||||.}}))),}.)))|,{((((.(((((..{,...,}))))))))))}},))))),))))}))))))}...,|||.,||||}}}|.{{{{|,,,)))}}.|.||,|,...}||||{|||{{{.{,{{((((..({....)}....,}}}},..,|}}|||{{|||},.})))}|}||||.((((((((....(((((((((.(.,(.(((((......))))).).}}))))))))).)))))))).}))})))},|{{{{{,},,.}}))))))),)))))})}}}}|{|||,||||||||,,,|||,((,(|||({((...,.,|||.||}}}}}|,,{|.,{(({({....(((.|.{{.{{|||{|.|,.},)}))))))}}}.}}}}...,},,,..}},,,..,,))})),)})))}))))))..................
Back