Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004355.4
Sequence Length
1461 nt
GC Content
0.5756
AUCCUGCCCCGCAAAAGGCAGCUUCACCAAAGUGGGGUAUUUCCAGCCUUUGUAGCUUUCACUUCCACAUCUACCAAGUGGGCGGAGUGGCCUUCUGUGGACGAAUCAGAUUCCUCUCCAGCACCGACUUUAAGAGGCGAGCCGGGGGGUCAGGGUCCCAGAUGCACAGGAGGAGAAGCAGGAGCUGUCGGGAAGAUCAGAAGCCAGUCAUGGAUGACCAGCGCGACCUUAUCUCCAACAAUGAGCAACUGCCCAUGCUGGGCCGGCGCCCUGGGGCCCCGGAGAGCAAGUGCAGCCGCGGAGCCCUGUACACAGGCUUUUCCAUCCUGGUGACUCUGCUCCUCGCUGGCCAGGCCACCACCGCCUACUUCCUGUACCAGCAGCAGGGCCGGCUGGACAAACUGACAGUCACCUCCCAGAACCUGCAGCUGGAGAACCUGCGCAUGAAGCUUCCCAAGCCUCCCAAGCCUGUGAGCAAGAUGCGCAUGGCCACCCCGCUGCUGAUGCAGGCGCUGCCCAUGGGAGCCCUGCCCCAGGGGCCCAUGCAGAAUGCCACCAAGUAUGGCAACAUGACAGAGGACCAUGUGAUGCACCUGCUCCAGAAUGCUGACCCCCUGAAGGUGUACCCGCCACUGAAGGGGAGCUUCCCGGAGAACCUGAGACACCUUAAGAACACCAUGGAGACCAUAGACUGGAAGGUCUUUGAGAGCUGGAUGCACCAUUGGCUCCUGUUUGAAAUGAGCAGGCACUCCUUGGAGCAAAAGCCCACUGACGCUCCACCGAAAGAGUCACUGGAACUGGAGGACCCGUCUUCUGGGCUGGGUGUGACCAAGCAGGAUCUGGGCCCAGUCCCCAUGUGAGAGCAGCAGAGGCGGUCUUCAACAUCCUGCCAGCCCCACACAGCUACAGCUUUCUUGCUCCCUUCAGCCCCCAGCCCCUCCCCCAUCUCCCACCCUGUACCUCAUCCCAUGAGACCCUGGUGCCUGGCUCUUUCGUCACCCUUGGACAAGACAAACCAAGUCGGAACAGCAGAUAACAAUGCAGCAAGGCCCUGCUGCCCAAUCUCCAUCUGUCAACAGGGGCGUGAGGUCCCAGGAAGUGGCCAAAAGCUAGACAGAUCCCCGUUCCUGACAUCACAGCAGCCUCCAACACAAGGCUCCAAGACCUAGGCUCAUGGACGAGAUGGGAAGGCACAGGGAGAAGGGAUAACCCUACACCCAGACCCCAGGCUGGACAUGCUGACUGUCCUCUCCCCUCCAGCCUUUGGCCUUGGCUUUUCUAGCCUAUUUACCUGCAGGCUGAGCCACUCUCUUCCCUUUCCCCAGCAUCACUCCCCAAGGAAGAGCCAAUGUUUUCCACCCAUAAUCCUUUCUGCCGACCCCUAGUUCCCUCUGCUCAGCCAAGCUUGUUAUCAGCUUUCAGGGCCAUGGUUCACAUUAGAAUAAAAGGUAGUAAUUAGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-509.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -533.90
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.15
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((((....((........))...))))))))......((((((.(((((((((((((((..(((...((((((((((.(((((((.(((.(((.((((...)))).))).)))..............(((.(((.((((((.(((((((......((.(((((((((((((.((((..((((.(..(.(((....(((....))).))).)..).)))).....)))).......((((........))))((((....)))).((((((((((...((....))..))).)).)))))........)))))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))..))))))))))((((((.(((((((.((((((((((.(....(((..((....))..)))....).)))))))....(((((((((...((((..((.((.......)).)).))))...))))))).))...))).))))))).))))))..((((..(((((..(((((...))))).)))))))))..(((((.......))))).(((.(((........))).)))......((((.(((.(((...(((((...((((.......))))..)))))))))))..))))....((((....))))........((((...))))))).)))))).....)))))))))((((.(((((.(((.((((.(((((((((((.(((..((..((((((...((....))...))))))..))..((((....((((((((.((...........((((((((((((.....(((((((..(((((..((((...(((....)))...).)))))))).....))))))).(((........)))..(((......)))((((((..(((...(((.....((((((((......((.....))..(((((((.((..(((...((((......))))..(((((..............((((((((.(.((((......((((((......))))))...)))).)(((((((....(((((.....)))))......((((.....)))))))))))....))))).)))........(((((........)))))))))))))..)))))))))..))))))))..)))...))).)))))).......))))))))).))).((((((((......((......)).....))))))))(((((..((((((....(((((..........)))))))))))..(((((((.......................)))))))............................))))).))))))))))....)))).)))..))))))).))))....))))))))))))...))))......))))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
...,(((({{((....((,.,,,.,,|}...))))))),......{{|||||{,||,.....,,,.....{{{,,((((((((((.(((((((.(((.(((.((((...)))).))).)))..............(((.(({,((((((.(((((((......((.(((((((((((((,((,({.(((({(..(,(,(,..{({,{{{,,,,.}))},.}).},,,}}.}})))).....,,.({....||{||,,.}))|},}},))))}((((((((((...((....))..))).)).)))))........)))))))).))))))))))))))))))))))).))))))))))..))))))))))((((((.(((((((.((((((((((.{....(((..((....))..)))....}.)))))))....(((((((((...((((,.((.((.......)).)).))))...))))))).))...))).))))))).))))))..((((..(((((..(((((...))))).)))))))))..(((((.......))))).(((.(((........))).)))......((((.(((.(((...(((((...((((....,}}),})..))))))))}))..))))....((((....)))}.}...,{{((((.,,{{,,,|,,|,,,.)|}||{((((((((({,,(((...(((((((((((((.....)))))))...{(..((((((...((....))...))))))..)}..((((....((((((((.((....,,,....((((((((((((....,((((((,.,(((,...,,,}},,((({.{.{{.{{{{.||,|,,,,....},)))))).,||..,,,,.,||,...||,.,}}}))|((((((..{((,..{{{,....((((((((......,{...,.||..(((((((.((..(({,,{((({{,{{..{{{|,,(({(({,...,,...||..|{|{({{(.(.((({......((((((......))))))...,,,,..||||||{..,.(((((,....))))}.|,..,|{{|.....)))))}}}}}}....))))),)}}......|.(((((........))))),},,})}),,)))))))))..))))))))..))}...))).))))))|......})))))))).}}}.((((((((...,..((......}).....)))))))),{{{{..((((({...,(((((.,......,.)))))))))))..(((((((.,.......,...........,,))))))).....,......................}}})}})}))))))))....))))))))))...)))..})))))))))))})))))))||......,,....,,)))}}.........
Back