Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004357.5
Sequence Length
1545 nt
GC Content
0.6149
AUUCUCAGCGCUGGGAGCCGCCGCCCCCGCAGCUGCUGCCGCCGCCGCCAGGGCCCGGACUCGGACGCGUGGUAGCCUAGAGUCCUGGGGAGCUUCUGUCCACCUGUCCUGCAGAGGAGUCGUUUCCAGCCCGGCUGCCCCAGGAUGGGUGAGUUCAACGAGAAGAAGACAACAUGUGGCACCGUUUGCCUCAAGUACCUGCUGUUUACCUACAAUUGCUGCUUCUGGCUGGCUGGCCUGGCUGUCAUGGCAGUGGGCAUCUGGACGCUGGCCCUCAAGAGUGACUACAUCAGCCUGCUGGCCUCAGGCACCUACCUGGCCACAGCCUACAUCCUGGUGGUGGCGGGCACUGUCGUCAUGGUGACUGGGGUCUUGGGCUGCUGCGCCACCUUCAAGGAGCGUCGGAACCUGCUGCGCCUGUACUUCAUCCUGCUCCUCAUCAUCUUUCUGCUGGAGAUCAUCGCUGGUAUCCUCGCCUACGCCUACUACCAGCAGCUGAACACGGAGCUCAAGGAGAACCUGAAGGACACCAUGACCAAGCGCUACCACCAGCCGGGCCAUGAGGCUGUGACCAGCGCUGUGGACCAGCUGCAGCAGGAGUUCCACUGCUGUGGCAGCAACAACUCACAGGACUGGCGAGACAGUGAGUGGAUCCGCUCACAGGAGGCCGGUGGCCGUGUGGUCCCAGACAGCUGCUGCAAGACGGUGGUGGCUCUUUGUGGGCAGCGAGACCAUGCCUCCAACAUCUACAAGGUGGAGGGCGGCUGCAUCACCAAGUUGGAGACCUUCAUCCAGGAGCACCUGAGGGUCAUUGGGGCUGUGGGGAUCGGCAUUGCCUGUGUGCAGGUCUUUGGCAUGAUCUUCACGUGCUGCCUGUACAGGAGUCUCAAGCUGGAGCACUACUGACCCUGCCUUGGGCCUUGCUGCUGCUGCACCCAACUACUGAGCUGAGACCACUGAGUACCAGGGGCUGGGCUCCCUGAUGACACCCACCCUGUGCCAUCACCAUAACCUCUGGGGACCCCAACCUCAGAGGCAGCUUCAAGUGCCUUUUGCUGCGCACCAAUGCCCAGCAGGGGAGGUGAGGGGGGCUGGCGGGGCGAAGUUUGGGGGGUGUUUUGUGGGGCUCCCCAGACACACUCUCUGCCUGGUGGUCAGAUGCAGGUUGGAAGGGGCCUUGCUGAGUGGCGCAAGGCCGAGCGUUCCCAGCAGGGGGAGAAACCCUUCACACCCCAGGCCCUUCAGGAACUGGGGCCUUGCCUUGCAGCCACAUGGCCCCAUCCCAGUUGGGGAAGCCAGGUGAGCUCUGACCCUUGGGCCUGGGCCUCUGCCCCUCCCAACCCAGCCCUCGUCUCCCUCGACAGCGCCCCUGCUGUCUUCCCCACCGCAGUCACCACCACCCGAAAUGCCACGUGGUCACUGUGCACUGCCCUGUUCAUGUGCCUCUGCGGGGCAGGGCCUUCCUGGUUUUGUUCACUGCUGUACCCAGAUGCCUACAACCAUCCCUGCCACAUACAGGUGCUCAAUAAACACUUGUAGAGCAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-671.70 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -696.18
Frequency: 0.0000
Diversity: 435.30
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.(((.((....))))).)).))))((((.((((((((((((((((((((((....((......))...)))))).)))...(((((((((((((((((((..(.(((((((.........))))).)))))))))))))).)....)).)))))......((.((.((((.....)))).)).))....((.((............)).))))))))).))).))).((((.(..((((..((((((((((((..(((((...(((....))).....)))))..(((((((.(((((.......(((.((((((((.((((((((((((((..(((.((...(((((((((..(((((...(((((....)).))).)))))(((.(((.(((...))).))).)))...((((((((((((((...(((.....(((((((((.....((..(((......)))..))....)).))))))).)))....)))))...)))).....)))))..)))))))))..)).))).)))))).)))))..))))))))))).))))).))).)).))))).(((((((........))))))).((((((((((..(.(((((..(((......(((((((....))))))).((((((..((((.(.(((.((((((((.(((((((((......))))))))).)))).)))).))).).))))))))))........((((((..(((((((.(((....(((.(((.((((((((....(((((((((.((((((((((....(((..(((((((.((((.......)))).)))))))))))))))))))).))))).))))...))).))))).)))))).)))...))).))))))))))(((((((..(((((..............(((((.((.((.(((.....))).)))).)))))..(((((.(((.......))).))))).......((((((((.......)))))))))))))..)))).)))...(((((.(((....))).)))))((((((((((((((((.(((.((((((..(((((((((((.((....)).))))))))))).....(((.((((((.(((((((.((.....(((.((((((.......((((((((((((...((.......))(((((......)))))....((((((..((....))..))))))....))))))).)))))..)))))).)))((.((((.....)))).)).))))))))).))))))..)))....))))))..))).)))..))))))))))))).((((((......))))))........((((((.(((((...............))))).))))))..(((((((((............))))))))).))).))))))..))))....))))))..))))))))))))..))))..).))))..((((((((.........))))))))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((.(((.((....))))).)).))))((((,((((((((((((,(((((((((.,..((......))...)))))).)))..,(({{({{{(((((((((((..(.(,(((((.........))))).)},))))))))))).},,,..,.,}}}).,,.,.,{.((.((((.....)))).)),||,...{,{((......}}}...)},})})))))).))).))).((((.{..((((..((((((((((((.,((((({({.({,,{{{{{,,,{.,|,(({.({{{{{{,{{{|,.....,|||{.((((((((.((((((((((((((..(((.((...(((((((((.{{,({((,,{(((({.{,||,|,,,{{,,.{((,(({.,((,..,}|.|}}.},.}},,{{{.|||{|||||,..,,,.....(((((((((.....((..(((......)))..))....)).))))))).,))....))))),,,)))}..,}}),})),.)))))))))..)).))).)))))},)))))..))))))))))).}||||}|||,||.}}}||{(((((((..,.....))))))),|||||,{{{{..{,({(((,,(((......(((((((....))))))).{{{{||}}||{{}{}|||}||||{{{{,{(({{{{{{......)))))}))),)))).)))),))).}.}}},}|||||..,.....,,{|{|}||||{(((,{((...,(({,{{{,(((((((({...{((({{{{|,||||||||{{.,{{((({{((((({,{((,,.}}}..,||||{|||}},.||||||}}}}}}},))))),)))),},}})||||||.,}}}})})}),,.}},.||||||,,||(((,(((.{((,((.{{,......,,,,(((((,{{.{{.{((.,,..}}|||}}},|}}}}..{((((.(((.......))).))))}......{((((((((.......)))))))))))))..}})),)}}...|||,|}|||.}},,))})))))|||((((,((,(((((((((.((((,{..(((((((((((.((....)).))))))))))).....,,,.((((((.(((((((.((.....(((.((((((.,.....((((((((((({.{{(,,..,,,.},,{{{(,.,...,}})),...((((((..((....))..)))))),})}))))))).)))))..)))))).})}((.{{((,....)))).)).))))))))).)}))))..|||{....))))}.})),.,))})))))).)),})))}((((((,....,)))))).}}})),,((((((.(((((..........,....))))).))))))..(((((((((............)))))))))}))).)))))),.})))...,}))))}..))))))))))))..))))..}.))))..((((((((.........)))))))),.)))).
Back