Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004413.4
Sequence Length
1733 nt
GC Content
0.6249
ACUGUGCGAGCCCUCAAGGAGGUGGCUGUUCUGUAGCUGGAGAGCUCCGUGGGUGGCAGGACUGAACUUGAACACCAGAAACAACCCCCAAGCCUUGUGACCUGGGAGGCAGGAGGCGGGUCUGUCUCCCUGGGACUUGGGUGGCUGAGCCGAGGUACUCGGGACCCUGUCCCGCGCAUGGCAGAGUGGCUCCUCACAGCCUGAAGCUCAUCCUUCUGCACGGGCCAGCCAGGCCAGCACAGAGGCACCAGGGCAGCAGUGCACACAGGUCCCCGGGGACCCCACCAUGUGGAGCGGAUGGUGGCUGUGGCCCCUUGUGGCCGUCUGCACUGCAGACUUCUUUCGGGACGAGGCAGAGAGGAUCAUGAGGGACUCCCCUGUCAUUGAUGGGCACAAUGACCUCCCCUGGCAGCUGCUGGAUAUGUUCAACAACCGGCUGCAGGACGAGAGGGCCAACCUGACCACCUUGGCCGGCACACACACCAACAUCCCCAAGCUGAGGGCCGGCUUUGUGGGAGGCCAGUUCUGGUCCGUGUACACGCCCUGCGACACCCAGAACAAAGACGCCGUGCGGAGGACGCUGGAGCAGAUGGACGUGGUCCACCGCAUGUGCCGGAUGUACCCGGAGACCUUCCUGUAUGUCACCAGCAGUGCAGGCAUUCGGCAGGCCUUCCGGGAAGGGAAGGUGGCCAGCCUGAUCGGCGUGGAGGGCGGCCACUCCAUUGACAGCAGUUUGGGCGUCCUGCGGGCACUCUAUCAGCUGGGCAUGCGGUACCUGACCCUCACCCACAGCUGCAACACGCCCUGGGCUGACAACUGGCUGGUGGACACGGGAGACAGCGAGCCCCAGAGCCAAGGCUUGUCACCCUUUGGGCAGCGUGUGGUGAAGGAGCUGAACCGUCUGGGGGUCCUCAUCGACUUGGCUCACGUGUCUGUGGCCACCAUGAAGGCCACCCUGCAGCUGUCCAGAGCCCCGGUCAUCUUCAGCCACUCCUCGGCCUACAGCGUGUGCGCAAGCCGGCGCAACGUGCCUGACGACGUCCUGAGGCUGGUGAAACAGACAGACAGCCUGGUGAUGGUGAACUUCUACAACAAUUACAUUUCCUGCACCAACAAGGCCAACCUGUCCCAAGUGGCCGACCAUCUGGAUCACAUCAAGGAGGUGGCAGGAGCCAGAGCCGUGGGUUUUGGUGGGGACUUUGAUGGUGUUCCAAGGGUCCCUGAGGGGCUGGAGGACGUCUCCAAGUAUCCAGACCUGAUCGCUGAGCUGCUCAGGAGGAACUGGACGGAGGCGGAGGUCAAGGGCGCACUGGCUGACAACCUGCUGAGGGUCUUCGAGGCUGUGGAACAGGCCAGCAACCUCACACAGGCUCCCGAGGAGGAGCCCAUCCCGCUGGACCAGCUGGGUGGCUCCUGCAGGACCCAUUACGGCUACUCCUCUGGGGCUUCCAGCCUCCAUCGCCACUGGGGGCUCCUGCUGGCCUCCCUCGCUCCCCUGGUCCUCUGUCUGUCUCUCCUGUGAAACCUGGGAGACCAGAGUCCCCUUUAGGGUUCCCGGAGCUCCGGGAAGACCCGCCCAUCCCAGGACUCCAGAUGCCAGGAGCCCUGCUGCCCACAUGCAAGGACCAGCAUCUCCUGAGAGGACGCCUGGGCUUACCUGGGGGGCAGGAUGCCUGGGGACAGUUCAGGACACACACACAGUAGGCCCGCAAUAAAAGCAACACCCCUUCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-750.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -781.52
Frequency: 0.0000
Diversity: 569.02
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(...((((.((((((((.(((((((((((((....))))..((((((((((((.................((.(((((((....(((((.((.(((...))))).))))))))).))).))(((((((..((((((((((.(..(((.((((((((((...)))))((.....)).))))).)))..).)))))....((((...((((((..(.((((.....)))).)..)))))).....)))).((((((((.((.(((((..((((.(((((((((.((...)).)))))))....))))))..).)))))).))))))))((..(((...(((((.((((((((((((((((.(.((((...(((((((((((.......)))))))(((.((((.((((((.((...........))..))))))))))..)))))))....((((.((((((((((.(((.(((...((....((((.((((((.....))))))...((((((((.(((((((...((((...(((...))))))))))))))........(((((((.((((..((...........))..)))).)))))))(((((((((..............(((((((((.....))).)))))))))))))))))))))))))))..))...)))))).)))(((((.(.((((....((((((((.......((.(((((((((((((.(.(((((((.....((((((((..((.((........)).)).)).))))))..((((((..((((((((....(((((((..(((.((((.....(((((((..........)))))))....(((((((((((.((((((((.(((.((...((....)))).))))))))(((.((.....)).))).((((((........))))))...)))))))))))))).)))))))....)))))))....))))))))..))))))((((......))))...)))))))).)))))))..)))))).)).....(((((...((((.((..(((((..........................))))))).))))....)))))...)))))))).)))).).))))).......))))))))))).(((((((((...)))))))))(((((((((..(((....))))))))))))((((((((((((((.((((((((((.(((...(((((..((......))))))).)))))).((.(((((((((((((.((((.(.(.((((((.........((((((((((.(((.(((((....(((.......)))..))))).)))....(.(((((((.((((.((((...)))).))))))))))).)))))))).))))))))).))))))..))))))).)))))).)).....))))))))))).)))))..)))))..)))))))))))))..))))))))))))).)))..))(((.(((....))))))....((((((((((....))))))..)))))))))))))))).((((........)))).))))))))))))..)).)))).)))))))))))..))))...((((((((..((((((.(......).))))))...)))))))).....).)))))).((...((.......))....))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((((.(.{{((((.((((((({,(((((((((((((....)))).,((((((((((((.,,,...........}}|..,{,,,{{,...(((((.((.(((...})))).)))))))||{|||{|{(((((((,{((((((((((.({{((({(,(,((((((...)))))|,,...{||,|}|||{|||{{|.,,}||,{..{{{,...((((((..,.((((.....)))).}..)))))).,{{{|||,.((((((((.{{.(((({,.((((.(((((((((.((...)).)))))))....))})))..}.))))}}.)))))))).{{,{{{{{{(({{{.{{,{{{||||||{||,.,{(((....}}}}(((((((.......))))))){{,,|||||((((((.(({.....,,...}}.,))))))))))..)})})|}||,.||||.||||||||||||||.|,,...,,....,,||||||||{,}}},}}}|||{,{((((((((.(((((((...((((...(((...))))))))))))))......,,(((((((.((((.,{{...,....,..)}..)))).))))))){|(((((((,..,,{{...,,,,|{(({{({{,.,,.}},|})))}))}}}}|||}}|||||||}.},,,||}}}||{|||.|||{,.{{,|,.|||,|||||||||||,,..,,.((.({{({,(((((((.,.(((((((.....((((((((..,(.(({.....}})}.,,.)).))))))..((((((..((((((((..,.(((((((..(((.((((.,...(((((((..........)))))))....(((((((((((.(((((({,,({{.{{...{{....|||}.}}})}}}}{{{.{(||.,.}}.}}}.((((((........)))))).,.)))))))))))))).)))))))....))))))).,..))))))))..))))))((((......))))...))))))),.)))))))..}})))).))....,|||||.,.{((({({(,((({(.....................{{{{{||||,.,.,|||,...}}}}}.,,}))))))|.||.},}}).},,,,,,..}}})))}}))))|(((((((((...)))))))))(((((((({..(((,.,,}}}}}}}}}}}}{{(((((((((((,,{{|{{{,,{{.((({{.(((,,,,{({,,|..,))))))}}},.))}||.|||||||{(((({..{((,{,..,{|||{...,|||,,{{|{{{{{{{,(((.{((((,...(((,,,,,..}}}..}}}}},|}|,.,,(,((((((({((((.((((...)))).))))))))))).},)))}))....})))},||}}}}.}))))))}}|||||||,...,,.,))))))))}})}))))))}}))}})},}))}))))))))}})))))))})))}}.}}..}|||||},|}}}),)))))}....||{(((((((....)))))),,)))))))))))))))).((((........)))).)))))))))))).,)),}))),}))))))))))}}),))..,((((((((..(((,(({{,.....}.))),))}..)))))))).,...}.)))))).||...{{.......}}..............
Back