Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004418.4

Sequence Length

1685 nt

GC Content

0.6392

GGAGUCGACCGCUCGGGCAGCGCCACCGCCACGAGAGCCCGGGACGCGGGAAAGACCGAAAGGAAGAGGAAGAGGCACCGGUGGCCAUGGGGCUGGAGGCGGCGCGCGAGCUGGAGUGCGCGGCGCUGGGCACGCUGCUGCGGGAUCCGCGGGAGGCGGAACGCACGCUGCUGCUGGACUGCCGCCCCUUCCUGGCCUUCUGCCGGCGCCACGUGCGCGCCGCGCGGCCAGUGCCUUGGAACGCGCUGCUGCGGCGCCGCGCGCGCGGCCCUCCUGCCGCCGUUCUCGCCUGCCUGCUGCCCGACCGCGCGCUGCGGACGCGCCUGGUCCGCGGGGAGCUGGCGCGGGCCGUGGUGCUGGACGAGGGCAGUGCCUCGGUGGCGGAGCUCCGGCCCGACAGCCCGGCUCAUGUGCUGCUGGCCGCGCUGCUGCACGAGACCCGCGCGGGGCCCACUGCCGUGUACUUCCUGCGAGGAGGCUUCGACGGCUUCCAGGGCUGCUGUCCCGAUCUGUGCUCUGAGGCCCCCGCCCCUGCGCUGCCGCCAACAGGGGACAAAACCAGCCGCUCCGACUCCAGGGCUCCUGUCUACGACCAGGGUGGCCCUGUGGAGAUCUUGCCCUACCUGUUCCUGGGCAGCUGCAGUCACUCGUCAGACCUGCAGGGGCUGCAGGCCUGUGGCAUCACAGCCGUCCUCAACGUGUCCGCCAGCUGCCCCAACCACUUUGAGGGCCUUUUCCGCUACAAGAGUAUCCCUGUGGAGGACAACCAGAUGGUGGAGAUCAGUGCCUGGUUCCAGGAGGCCAUAGGCUUCAUUGACUGGGUGAAGAACAGCGGAGGCCGGGUGCUGGUGCACUGCCAGGCGGGUAUCUCGCGCUCUGCCACCAUCUGUCUGGCAUACCUCAUGCAGAGUCGCCGUGUGCGGCUGGACGAGGCCUUUGACUUCGUUAAGCAGCGCCGGGGGGUCAUCUCCCCCAACUUCAGUUUCAUGGGGCAGCUGCUGCAGUUUGAGACCCAGGUGCUGUGUCACUGAGGUGGUGCCCCUCUGCCUGCCUGCCCCACUGUGCUGGCAGGAGCUGACUGUGGACUGGUGGGCUCCCCUCUGGGCCAGCACAGUCCCCUCACCUCUGGCAGGGCUGCUACCUCCUCAGAGUUUCAGAAGCCCCCACAUGGGGGCUCUAGGAAUGCCGGCAUGCUGGUCUUUCCGACCUGGUGCUCUUCUGCUGGGGGACUGAGGCUGGCCCUCAUUCGGGGUCGGGAACCAAGGGUGUGUCUGCUCUUUCCCUCCCCAUCCUCUGGCAGAAAUCAGCUAGACGCUAUACCGUGGACUCUCCCUGGUCCACCACCAUGUUGAAGCCCUUGGCAGCCUGAGAGCUCCAAGGAACAAGCUGUGACAACCAGGAGCCCUGUCUGUGGGUUCGUCUGCCCAGGGCCUGGAGCCCAAGCCCUGUGUUCCUGGGGAAGCUGGGGACUUGGGAAGUGAUGGGUGUGUCAUGUUGCGUGUGUCUGUCUGUGAGCCUUUCACACCUGUGCUGGCGCUGGAAAAUUAUUUGUGCUCAGCUGACAUUUAACACUCCCUCCCCCGCUUCCUCCUAGCCCUGUGGGCAGGGGUUGGAAACUUAGCACUUUAUAUUUAUACAGAACAUUCAGGAUAUGUCAAUAAAAUAUUGUUAUAUUUAAAAAACAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-785.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -813.91

Frequency: 0.0000

Diversity: 396.80

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((((((((.(((((((.........))).))))..((.(((((((((......))...(((((.(((.((.((((.(((.((((.(((((((((.((((((((.(..((.(((((((((((((.(((((.(.((((.(((((.((.((((.((((((.......(((((.((((((((((((((........((((((..(((((((((((.((((((.((((.((((((((........))))))..)).)))).))))))(((((......))))).......(((((((((((.(((((((((((((....).)))))..))))...))).))).)).)))))))))))))))))..))))))........))))))))...))))))..).))))(((((.........))))))))).)).))))..))..))))))))))))))).)))))))))).))).))..(((((((.....))))))).).)).)))))))))......)))))).)))).)))((((((.((....))...)))))).............(((((....(((((((((((........))))..))))))))))))....)))))).))).)))))((((..((((((((........)).))))))(((((.(((((((..(((((((((((.....((((((((...(((((((((((((......((((((......(((.(((((.(......).))))).)))....((((((((((..((((((((((((((((..((((((...)))))).....(((.........))).))).))))))))))))).......((((((.(.....).))).)))))))))))))((((.(((.....))))))).....((.((((.(((.(((((((.......))))))).))).))))))(((((......)))))..)))))).....)))))))))))..)).....(((..((((((.(((...(.((((((.(((((..(((((((....((....(((((((((((.((((((.(((.......))).))))))((...))))))))))))).....)).....)))))))..)).))).)))))).)...))).(((((((....)))))))...((((.(((((....)))))..)))).))))))..)))(((((((((((((.(((((.....)))))...((((..(((((...(((((......)))))))))).)))).)))))))))))))...(((.....))).....(((((((......)))))))...))))))))...((((((.(((......))))))))).....))))))).......((((((.......))))))...))))..))))))).)))))..)))).))))))).))((((((.(((((...((((.((((((((((((.....(((((.(.......))))))......)))))))))((((((((.............)))).))))..........)))))))))))).)))))).(((.((((...))))))))))))...))))............................(((((((.(((((...))))).))))))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

.{{{((((((.(((((((.{.....,.))).))))..{((((((((((({.....||...(((((.(((.((.((((.{(((((({,{(({{({(,.((((((((((,.((.(((((((((((((.(((((.(.((((.(((((.((,((((.((((((...,,..(((({.(((((((({(((((,,..,{{,{(((((..(((((((((((.((((((.((((,((((((((........)))))),.)).)))).))))))(((((......)))))......,(((((((,(((.(((((((((((((....}.)))))..)))}...))).))).)),)))))))))))))))))..)))))))).,....))}))))).|.))))))..}.)))}{{{{{....,.},,))})})))).)).))))..)},,))))))))))))))).)))))))))))})).))..((,((({..,..|||||||,((((.,,.}}}}....,,))))}}}}}}))),),)))}}))})),))))}}..}}||{,......}},}}}}||{{(,{{{((((((((((({{...}},}))),.))))))}))))).}}.)))))).))).)))))||||..((((((((........)),})))))(((((.(((((((,.(((((((((((.{{,,((((,,((,..({{((((((((((......((((((...,,.(((.(((({.{......,.))))).)))....((((((((((.,((((((((((((((((..((((((...))))))...,.(((.........)))})))}})))))))))))),{...,,{{((((,(.....).))).))})))))))))){{{|{({{..,,.}}))})),...|((.((((.(((.(((((((,....,.))))))).))).)))))}(((((......)))))..)))))).....)))))))))))}.))}..}}|||}}(((((({(((.{,,.((((((.(((((..(((((((.,..,{....(((((((((((.((((((.((({.....}))).)))))){{...))))))))))))).....}}...,.)))))))..)).))).)))))).{{{{|{{.{((((((....)))))))}}.||||,|||||}},.))))},.}}}|{||}|||{{,,,(((((((((((((.(((((.....)))))...((((..((((,..,(((((......)))))))))).)))).)))))))))))))...{((.....))).....(((((((......))))))),},)),)))),.,.((((((.(((......))))))))).....))))))).....,.((((((.......)))))).,.)))),,))))))).)))))..,,))})))}}))}))((((((.(((((...(((,,((({((((((((..,.{{{(((.{.......,}}}})}}....))))))))}((((((((.............)))).))))..........)))))))))))).)))))).(((.((((...))))))))))))}..,},}...................,........{((((({.(((({...))))).))))))).........