Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004425.4

Sequence Length

2046 nt

GC Content

0.5787

AACCGUAACAGCCACCAGACAAGCUUCAGUGGCCGGCCCUUCACAUCCAGACUUGCCUGAGAGGACCCACCUCUGAGUGUCCAGUGGUCAGUUGCCCCAGGAUGGGGACCACAGCCAGAGCAGCCUUGGUCUUGACCUAUUUGGCUGUUGCUUCUGCUGCCUCUGAGGGAGGCUUCACGGCUACAGGACAGAGGCAGCUGAGGCCAGAGCACUUUCAAGAAGUUGGCUACGCAGCUCCCCCCUCCCCACCCCUAUCCCGAAGCCUCCCCAUGGAUCACCCUGACUCCUCUCAGCAUGGCCCUCCCUUUGAGGGACAGAGUCAAGUGCAGCCCCCUCCCUCUCAGGAGGCCACCCCUCUCCAACAGGAAAAGCUGCUACCUGCCCAACUCCCUGCUGAAAAGGAAGUGGGUCCCCCUCUCCCUCAGGAAGCUGUCCCCCUCCAAAAAGAGCUGCCCUCUCUCCAGCACCCCAAUGAACAGAAGGAAGGAACGCCAGCUCCAUUUGGGGACCAGAGCCAUCCAGAACCUGAGUCCUGGAAUGCAGCCCAGCACUGCCAACAGGACCGGUCCCAAGGGGGCUGGGGCCACCGGCUGGAUGGCUUCCCCCCUGGGCGGCCUUCUCCAGACAAUCUGAACCAAAUCUGCCUUCCUAACCGUCAGCAUGUGGUAUAUGGUCCCUGGAACCUACCACAGUCCAGCUACUCCCACCUCACUCGCCAGGGUGAGACCCUCAAUUUCCUGGAGAUUGGAUAUUCCCGCUGCUGCCACUGCCGCAGCCACACAAACCGCCUAGAGUGUGCCAAACUUGUGUGGGAGGAAGCAAUGAGCCGAUUCUGUGAGGCCGAGUUCUCGGUCAAGACCCGACCCCACUGGUGCUGCACGCGGCAGGGGGAGGCUCGGUUCUCCUGCUUCCAGGAGGAAGCUCCCCAGCCACACUACCAGCUCCGGGCCUGCCCCAGCCAUCAGCCUGAUAUUUCCUCGGGUCUUGAGCUGCCUUUCCCUCCUGGGGUGCCCACAUUGGACAAUAUCAAGAACAUCUGCCACCUGAGGCGCUUCCGCUCUGUGCCACGCAACCUGCCAGCUACUGACCCCCUACAAAGGGAGCUGCUGGCACUGAUCCAGCUGGAGAGGGAGUUCCAGCGCUGCUGCCGCCAGGGGAACAAUCACACCUGUACAUGGAAGGCCUGGGAGGAUACCCUUGACAAAUACUGUGACCGGGAGUAUGCUGUGAAGACCCACCACCACUUGUGUUGCCGCCACCCUCCCAGCCCUACUCGGGAUGAGUGCUUUGCCCGUCGGGCUCCUUACCCCAACUAUGACCGGGACAUCUUGACCAUUGACAUCGGUCGAGUCACCCCCAACCUCAUGGGCCACCUCUGUGGAAACCAAAGAGUUCUCACCAAGCAUAAACAUAUUCCUGGGCUGAUCCACAACAUGACUGCCCGCUGCUGUGACCUGCCAUUUCCAGAACAGGCCUGCUGUGCAGAGGAGGAGAAAUUAACCUUCAUCAAUGAUCUGUGUGGUCCCCGACGUAACAUCUGGCGAGACCCUGCCCUCUGCUGUUACCUGAGUCCUGGGGAUGAACAGGUCAACUGCUUCAACAUCAAUUAUCUGAGGAACGUGGCUCUAGUGUCUGGAGACACUGAGAACGCCAAGGGCCAGGGGGAGCAGGGCUCAACUGGAGGAACAAAUAUCAGCUCCACCUCUGAGCCCAAGGAAGAAUGAGUCACCCCAGAGCCCUAGAGGGUCAGAUGGGGGGAACCCCACCCUGCCCCACCCAUCUGAACACUCAUUACACUAAACACCUCUUGGAUUUGGUGUCCUCAUUGUCUAUCUAAUGUCUCACCCGCAGUGUUUUAAGUGGAUCUUGGUGCCCUGGCCCAGGAGGGCACUGGCGUUUUCAGACACACCACAGACAAACACACCCUCCUAAGCCUGCUUGUAUUUCCUUCAGUGCCUGGCCCCUGAGGCCCACGGCCCUGCCCCCUUCACUGAGCAGAUGUUCACAGGCUGUGGGAUGCGACCAUAACUAAACAGCUUGACGUCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-748.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -782.93

Frequency: 0.0000

Diversity: 408.28

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(((.....(((((..((......)).))))))))....((.(((((..((..((((((((((.....)))))...(((((((((....((.(((((((((.(((((...((((..(((.(((.((((((((.((....(((((((((((((..(((((((.((.((((((((((..((.((..((...((((.(((((.(((((....(((((...))))))))))...)))))....))))....))..)).)).)))))))))))).((.....))(((((((((((((...((.....)).)))))))...)))))))).)))))..((((((.(.((((.((((((.....(((....)))...((.(((.((((((((.((.(((.......))).)))))).............)))).))).))....(((((((..(((((((..(((.(((...................))).)))..).))))))..)))))))....(((((((((((..((...((((((....((((.......))))...))))))(((((((...)))))))((....))))))))))))))).....((((((((((.(((((((..(((.(((((((.(((((.(.........).))).)).))))....(((..(((((.(........))))))..))).....(((((((....)))))))....))))))..)))))))..))........(((((.((....)).)))))........)))))))).))).)))...)))).).))))))))))))).))))))....))))))))))))))))..(((((((((((.......((.((((.....(((.((((.((((((((((((((((....))))))))((((....((.....))...)))))))))))).)))).)))..)))))).........)))))))))))))))...))))))))))))))))...))))))))).......((((((((((.......(((((.........)))))........(((((((..((....((((....))))))..)))))))......(((.(((((.(((.(...(((.((((..(((..((((((..((..(((....(((((.((.((((.(((((((.....(((.(((.(((((.(.....).)))))..))).))).............((((((...(((((..(((((((((.....))).((((.(((((((((...))))............((((((..(((....(((((((.........))))))).....)))....)))))).((((....)))).......))))).))))...................(((((.(.((........))).)))))..((.((((((((.(((((((((..((((...((...(((((((.((((........))))...........(((.((((((((..........))).).)))).)))))))))).))..))))....)))))))))..)))))).)).))...............))).)))..))))).....((((((..(...((((((((((((((((((.((((((.(((((((((..(((((.............)))))....))))))).........))..)).)))).).))))).((((.((((((((((((.............))).))))))))).).)))...((((((((..((....)).))))))))...((..((((((.(((.....(((.....)))..))).))))))..))(((((((........))))))))))))))))))).....)..)))))))))))).))))))).)))).)))))))........)))..)).)))))).)))...)))).))))))))))))))).)))))))))).))))).)).))))).))........................

Thermodynamic Ensemble Prediction

..,((.....(((((..(,....,,,,.))))),||....{{.{{{{{.,{{..{{(({(((((.....))))),|.(((((((((....(.,(((((((((.(((((...((((..(((.((,{((((((((.{(....(((((((((((((,.(((((((.((.((((((((((..((.{{..((...((((.(((((.(((((....(((({...))))))))))...)))))....))))....})..}}.)).)))))))))))}.((.....}|(((((({{{{{{{...({.,,,|},.,})))))...)))))},}.)))))..{(((((.(.((((.((((((.....(((....)))...{{.(((.(((((((,,((.(((.......))).)))))).............}))).))).||{{,,{,{((((..(((((((..(((.(((..{.............}..))).)))..),})))))..))))))),,..(((((((((((..{(.{.((((((....((((.......))))...))))))|((((((,.{.,,,))))}}}}.,,))))))))))))).....((((((((,,.(((((((..{{{.(({{{{{..,{((,,.........}.}}),},,}||}....(((..{(((,.{........))))))..}}}.....(((((((....)))))))....}}}}}}..)))))))..||......}.(((((.((....)).)))))........)))))))).))).)))...)))).).))))))))))))).))))))....))))))))))))))))..(((((((((((.......{(.((((.....(((.((((.((((((((((((((((....)))))))){(((....||,....,,...}))})))))))).)))).))).}))))}),........)))))))))))))))...)))))))))))))))}...)))))))))....,..((((((((((.....,.(((((.........)))))...,,...(((((((..((....((({....})))))..)))))))......(((.(((((.(((.{...(((.((((..(((..((((((..((..(((....(((((.({.((((.(((((((...,,(((.(((.{{{{|,|....,),}))))..}||,}}}.............{(((((,.,(((((,,(((((((((.....|||,{({(,((({,((((,..)))).......,,,....,{{{..(((....(((((((.........)))))))....})},....,,})))}{{{,{{{{,|||...}}}.)))),.,,,,..,}}}},...........,((((.{.{{........}}}.}}}}|..((.((((((((.(((((((((..((((...((...(((((((.((((........))))......|,...{{,.((((((((,.,......,,)).}.)))).}})))))))).))..))))..,.)))))))))..))))))}.).))...............,})}))}..))))).....((((((..{...((((((((((({((((((.(((({,.{,(((((((..(((((.............)))))....))))))).........}|.,)}.)))).).))))).((({,((((((((((((.............))).))))))))}.}.)))...{(((((((..((....)).))))))))...{{.,({{{{{.{{{.,...{{{..,,.))}..}},.))))))..}}(((((((........))))))))))))))))))).....,,.)))))),}}}},.))))))).)))).),)))))........)))..)).)))))).)))...)))).))))))))))))))).)))))))))).|||||,||.}}|||.},.},...,...,,}}}}}}.,},..