Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004438.5
Sequence Length
6362 nt
GC Content
0.4478
AAGCAUUUAUUCCACUGGGAUAGAAGCGGCAGGAGCAGCGUUGGCACCGGCGAACCAUGGCUGGGAUUUUCUAUUUCGCCCUAUUUUCGUGUCUCUUCGGGAUUUGCGACGCUGUCACAGGUUCCAGGGUAUACCCCGCGAAUGAAGUUACCUUAUUGGAUUCCAGAUCUGUUCAGGGAGAACUUGGGUGGAUAGCAAGCCCUCUGGAAGGAGGGUGGGAGGAAGUGAGUAUCAUGGAUGAAAAAAAUACACCAAUCCGAACCUACCAAGUGUGCAAUGUGAUGGAACCCAGCCAGAAUAACUGGCUACGAACUGAUUGGAUCACCCGAGAAGGGGCUCAGAGGGUGUAUAUUGAGAUUAAAUUCACCUUGAGGGACUGCAAUAGUCUUCCGGGCGUCAUGGGGACUUGCAAGGAGACGUUUAACCUGUACUACUAUGAAUCAGACAACGACAAAGAGCGUUUCAUCAGAGAGAACCAGUUUGUCAAAAUUGACACCAUUGCUGCUGAUGAGAGCUUCACCCAAGUGGACAUUGGUGACAGAAUCAUGAAGCUGAACACCGAGAUCCGGGAUGUAGGGCCAUUAAGCAAAAAGGGGUUUUACCUGGCUUUUCAGGAUGUGGGGGCCUGCAUCGCCCUGGUAUCAGUCCGUGUGUUCUAUAAAAAGUGUCCACUCACAGUCCGCAAUCUGGCCCAGUUUCCUGACACCAUCACAGGGGCUGAUACGUCUUCCCUGGUGGAAGUUCGAGGCUCCUGUGUCAACAACUCAGAAGAGAAAGAUGUGCCAAAAAUGUACUGUGGGGCAGAUGGUGAAUGGCUGGUACCCAUUGGCAACUGCCUAUGCAACGCUGGGCAUGAGGAGCGGAGCGGAGAAUGCCAAGCUUGCAAAAUUGGAUAUUACAAGGCUCUCUCCACGGAUGCCACCUGUGCCAAGUGCCCACCCCACAGCUACUCUGUCUGGGAAGGAGCCACCUCGUGCACCUGUGACCGAGGCUUUUUCAGAGCUGACAACGAUGCUGCCUCUAUGCCCUGCACCCGUCCACCAUCUGCUCCCCUGAACUUGAUUUCAAAUGUCAACGAGACAUCUGUGAACUUGGAAUGGAGUAGCCCUCAGAAUACAGGUGGCCGCCAGGACAUUUCCUAUAAUGUGGUAUGCAAGAAAUGUGGAGCUGGUGACCCCAGCAAGUGCCGACCCUGUGGAAGUGGGGUCCACUACACCCCACAGCAGAAUGGCUUGAAGACCACCAAAGUCUCCAUCACUGACCUCCUAGCUCAUACCAAUUACACCUUUGAAAUCUGGGCUGUGAAUGGAGUGUCCAAAUAUAACCCUAACCCAGACCAAUCAGUUUCUGUCACUGUGACCACCAACCAAGCAGCACCAUCAUCCAUUGCUUUGGUCCAGGCUAAAGAAGUCACAAGAUACAGUGUGGCACUGGCUUGGCUGGAACCAGAUCGGCCCAAUGGGGUAAUCCUGGAAUAUGAAGUCAAGUAUUAUGAGAAGGAUCAGAAUGAGCGAAGCUAUCGUAUAGUUCGGACAGCUGCCAGGAACACAGAUAUCAAAGGCCUGAACCCUCUCACUUCCUAUGUUUUCCACGUGCGAGCCAGGACAGCAGCUGGCUAUGGAGACUUCAGUGAGCCCUUGGAGGUUACAACCAACACAGUGCCUUCCCGGAUCAUUGGAGAUGGGGCUAACUCCACAGUCCUUCUGGUCUCUGUCUCGGGCAGUGUGGUGCUGGUGGUAAUUCUCAUUGCAGCUUUUGUCAUCAGCCGGAGACGGAGUAAAUACAGUAAAGCCAAACAAGAAGCGGAUGAAGAGAAACAUUUGAAUCAAGGUGUAAGAACAUAUGUGGACCCCUUUACGUACGAAGAUCCCAACCAAGCAGUGCGAGAGUUUGCCAAAGAAAUUGACGCAUCCUGCAUUAAGAUUGAAAAAGUUAUAGGAGUUGGUGAAUUUGGUGAGGUAUGCAGUGGGCGUCUCAAAGUGCCUGGCAAGAGAGAGAUCUGUGUGGCUAUCAAGACUCUGAAAGCUGGUUAUACAGACAAACAGAGGAGAGACUUCCUGAGUGAGGCCAGCAUCAUGGGACAGUUUGACCAUCCGAACAUCAUUCACUUGGAAGGCGUGGUCACUAAAUGUAAACCAGUAAUGAUCAUAACAGAGUACAUGGAGAAUGGCUCCUUGGAUGCAUUCCUCAGGAAAAAUGAUGGCAGAUUUACAGUCAUUCAGCUGGUGGGCAUGCUUCGUGGCAUUGGGUCUGGGAUGAAGUAUUUAUCUGAUAUGAGCUAUGUGCAUCGUGAUCUGGCCGCACGGAACAUCCUGGUGAACAGCAACUUGGUCUGCAAAGUGUCUGAUUUUGGCAUGUCCCGAGUGCUUGAGGAUGAUCCGGAAGCAGCUUACACCACCAGGGGUGGCAAGAUUCCUAUCCGGUGGACUGCGCCAGAAGCAAUUGCCUAUCGUAAAUUCACAUCAGCAAGUGAUGUAUGGAGCUAUGGAAUCGUUAUGUGGGAAGUGAUGUCGUACGGGGAGAGGCCCUAUUGGGAUAUGUCCAAUCAAGAUGUGAUUAAAGCCAUUGAGGAAGGCUAUCGGUUACCCCCUCCAAUGGACUGCCCCAUUGCGCUCCACCAGCUGAUGCUAGACUGCUGGCAGAAGGAGAGGAGCGACAGGCCUAAAUUUGGGCAGAUUGUCAACAUGUUGGACAAACUCAUCCGCAACCCCAACAGCUUGAAGAGGACAGGGACGGAGAGCUCCAGACCUAACACUGCCUUGUUGGAUCCAAGCUCCCCUGAAUUCUCUGCUGUGGUAUCAGUGGGCGAUUGGCUCCAGGCCAUUAAAAUGGACCGGUAUAAGGAUAACUUCACAGCUGCUGGUUAUACCACACUAGAGGCUGUGGUGCACGUGAACCAGGAGGACCUGGCAAGAAUUGGUAUCACAGCCAUCACGCACCAGAAUAAGAUUUUGAGCAGUGUCCAGGCAAUGCGAACCCAAAUGCAGCAGAUGCACGGCAGAAUGGUUCCCGUCUGAGCCAGUACUGAAUAAACUCAAAACUCUUGAAAUUAGUUUACCUCAUCCAUGCACUUUAAUUGAAGAACUGCACUUUUUUUACUUCGUCUUCGCCCUCUGAAAUUAAAGAAAUGAAAAAAAAAAACAAUAUCUGCAGCGUUGCUUGGUGCACAGAUUGCUGAAACUGUGGGGCUUACAGAAAUGACUGCCGGUCAUUUGAAUGAGACCUGGAACAAAUCGUUUCUCAGAAGUACUUUUCUGUUCAUCACCAGUCUGUAAAAUACAUGUACCUAUAGAAAUAGAACACUGCCUCUGAGUUUUGAUGCUGUAUUUGCUGCCAGACACUGAGCUUCUGAGACAUCCCUGAUUCUCUCUCCAUUUGGAAUUACAACCAUUGUAUUUUGUUUGUGGCAUAAAUUACAGUCAUCUGUCUUUCACUGGAAUGAAGACCAUGCCUAGGAACAUUUUUUAAGGACUCAGCUGUGGCUUUUAGGGCUUGGUUCAUACCAUGGGGGAAAAAAAAGUCCUAGGAGAAAGCGACGUGGCUCAUUAGUGUUGCCUCUUCAGUGCUCAAGCCGCCUGGUGGAUUCCUAUGACACAGGGGGCCUGGAAAGAAAGGGAAAGUGGAUUUAAAAUAUAUAUAUACGUAACCCAAGCCCCAUAACCCCUAACUGGACAAAUGAGGUCUGUUUCUUUGGGCCUGAGGCUGUGCCAUAUAAAGUCUUAUUUUGGGACUUUACAAACUUGUCCUAACUAUCUUGUGGAUAGUGGGCUGUGACAAUCUGGAAUAGAGAACGUUCACACUUCGCUCCUUUAAAGAAGCGACCCCAGAUCUGCAAGGGAGUAGAUUCUGCUAUCUUGGCCUCACAGCCCUUCCUGUUGAUUACAAAGCCCGUGGAAGAAAACAGAACACACCCUCCUCAGUUCCGUCUAAAUGUGUUUCUUCUGCUUCAAUUACACCAGUUCUGGGGCAAAGACACUGAUGAAACAACACCCAUACCUGAAAAGAAUAAAUGUGUGACUUUCAAAUCCCCUUUCGCAGUGAAAGAAACAGCAAACACUUAAGAUUCAGCAUCUGUUCUCCAGUUGCACUGAGGAAUGCACUGUCUCGCAGCACCAGCUCUGCAGAGCCCUUGCCCCAGACUCUUUGCGGUUUUAUUUAUAUGUAUUUCCAUAUUUCAUUCCUGUGUGUCACUGCUGCAUUGGUGUGGCAGCAAGUGACCAAAUGCUACAGGUCUUACUAUGGACACCAGGUCAGGUGCAACCACACAAAACAAAGCCAGUUCCAUGAGCUGCCUAUGAUAUGCAUUGCGGAAGUAACAUUUUACCCAGGGUGUGCCAUUGCAGUGAUAUAAAUAUAUUUUUUUCUUAGACUAAAUAUGAGCUGACUAUCUCUUUUGAUGUGUGUACAUAGGUGUGAGUGUGUCUGUAUGCGUGCCUGUCUGUGUGCGGGUGUGUGUAUGUGCGUAGCCUCAUGCUUAGGACUACCCAUGAAUGUUGUGGAAUGCUACACCUGGAGAGUUCUGGUUUUCCACCAGUUUCAAGAUGAAGAACUACAUGAUACAGUGGACCUGGAGACCAUCCCCUUGGAAAGACAACCCAGAGAUGUUCAGCAUCCUGUAUCUACACGCAUCCUGUAUCUACACGUGUAUUUUGUAGCUGUCACACUAACCUUAAUAAGAAUUCUACAGCUUUGGACAGAGGCAUUUUCACCUUAAUGGUGAAGUAAUUUAAAAUAUAAAUCCAUUCAGGUGACAACCCAUCAUCAAAAUUACAAAUUUUCUGAUUGAACUCAUCUGAAUCAUCAGUUCCUUGAUGGAGAGAGAGAAGGAGAUGGAAUGUGUCUGGUAACCCCAAAUGGAGUACAAGUAGCCUUUGUUUUCCUGCAUAAAUGGACUUGUUGAAUGCGAACGAAUAUAUGCAAUUCAUAUACUUUUGGAGAUGAACGUAGAUAUGUGUGUCAGCUUUGAGAUGGUGUGUCCUGGAUUAAUACUUUGUCUCCCA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1894.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2015.13
Frequency: 0.0000
Diversity: 1755.25
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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