Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004669.3

Sequence Length

809 nt

GC Content

0.6749

GCGCCUGACCGCGGCAGCUCCCACCAUGGCGGAGACCAAGCUCCAGCUGUUUGUCAAGGCGAGUGAGGACGGGGAGAGCGUGGGUCACUGCCCCUCCUGCCAGCGGCUCUUCAUGGUCCUGCUCCUCAAGGGCGUACCUUUCACCCUCACCACGGUGGACACGCGCAGGUCCCCGGACGUGCUGAAGGACUUCGCCCCCGGCUCGCAGCUGCCCAUCCUGCUCUAUGACAGCGACGCCAAGACAGACACGCUGCAGAUCGAGGACUUUCUGGAGGAGACGCUGGGGCCGCCCGACUUCCCCAGCCUGGCGCCUCGUUACAGGGAGUCCAACACCGCCGGCAACGACGUUUUCCACAAGUUCUCCGCGUUCAUCAAGAACCCGGUGCCCGCGCAGGACGAAGCCCUGUACCAGCAGCUGCUGCGCGCCCUCGCCAGGCUGGACAGCUACCUGCGCGCGCCCCUGGAGCACGAGCUGGCGGGGGAGCCGCAGCUGCGCGAGUCCCGCCGCCGCUUCCUGGACGGCGACAGGCUCACGCUGGCCGACUGCAGCCUCCUGCCCAAGCUGCACAUCGUCGACACGGUGUGCGCGCACUUCCGCCAGGCGCCCAUCCCCGCGGAGCUGCGCGGCGUACGCCGCUACCUGGACAGCGCGAUGCAGGAGAAAGAGUUCAAAUACACGUGUCCGCACAGCGCCGAGAUCCUGGCGGCCUACCGGCCCGCCGUGCACCCCCGCUAGCGCCCCACCCCGCGUCUGUCGCCCAAUAAAGGCAUCUUUGUCGGGAGUGAGGGUGUCCUGACAUCUGAAGGGC

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-343.60 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -357.00

Frequency: 0.0000

Diversity: 226.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((((((...((((.((..........(((((((....(((....)))(((((((..((((.(((((..(((((...(((.((((....)))).((((..(((((..(((....((.(((((.((....))((((....((((((........)))))).))))))))).))..)))..))))).))))...)))))))).))))).((((..(((........))).))))..))))..)))))))..(((((((.(((.((((((((((((((.(..(((((((..(.....)..)))))))....).))))....))))))))))......((((((.(((..(((((......(((((.((((..((((........))))..)))).))))))))))..)))....((((((((.(.((.((((((((((.((.(...(((.((.((....))....))))).).)))))))))))).)))))))))))(.(((((.((((((((.....))).)))))...))))).))))))))))))))))))))).)))...((((((((((((....)))))))))).)).)).))))))))))).....(((((((.(.(((((((((...((((((.((.((((.((((..(((.(((.(....((......))...).))))))..))))...).))).)).))).....))).))))))))).).))))..(((((((((((((((...(..(((.......)))..)..)).)))).))).)))))).............))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((((((...((((.((,,.,......{((((((.....,||,|,|||(((((((..(((({{(,(((((,((((((((((((((,..,|||,....,},},}||}))}}}}.},}))))}})},,,..(((((...((((((....({{..(((.((((.{.....})))))))...))).))))))....))))).,(((,....,,,)}}..{{{{({,....}.))),),,)))..))))))),.||||{||.{{{.((((((((((((((.(.,(((((((..{.....}..)))))))....}.))))....))))))))))......({(({{..,|.,|..........|{|||}|{|({{(,{{..,,,,..||}|,.||||{|||,,,.{{{.,{{{.,,,(({{{{{(,(.((.{{{{|||||||||,|,,,|||.||,||},,.}).,,.))))).}.})))||||||||.||,||||||||(.(((((.((((((((.....,)).)))))...))))).}))})))}}}))))}))}}})})))...(({(((((((((....)))))))))).}}.,}.))))))))))).....,,,((((.(.(((((((((,,.((((((,.,.((((.((((..(((.(((.(..,.((......)).,.).))))))..))))...}.)))}))}))).,,..}},.))))))))).).))))..(((((((((((((({...(..(((.......)))..}..}).)))).))).)))))),{,.........,))).