Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004701.4

Sequence Length

1488 nt

GC Content

0.4516

GAAGAUCCCCAGCGCUGCGGGCUCGGAGAGCAGUCCUAACGGCGCCUCGUACGCUAGUGUCCUCCCUUUUCAGUCCGCGUCCCUCCCUGGGCCGGGCUGGCACUCUUGCCUUCCCCGUCCCUCAUGGCGCUGCUCCGACGCCCGACGGUGUCCAGUGAUUUGGAGAAUAUUGACACAGGAGUUAAUUCUAAAGUUAAGAGUCAUGUGACUAUUAGGCGAACUGUUUUAGAAGAAAUUGGAAAUAGAGUUACAACCAGAGCAGCACAAGUAGCUAAGAAAGCUCAGAACACCAAAGUUCCAGUUCAACCCACCAAAACAACAAAUGUCAACAAACAACUGAAACCUACUGCUUCUGUCAAACCAGUACAGAUGGAAAAGUUGGCUCCAAAGGGUCCUUCUCCCACACCUGAGGAUGUCUCCAUGAAGGAAGAGAAUCUCUGCCAAGCUUUUUCUGAUGCCUUGCUCUGCAAAAUCGAGGACAUUGAUAACGAAGAUUGGGAGAACCCUCAGCUCUGCAGUGACUACGUUAAGGAUAUCUAUCAGUAUCUCAGGCAGCUGGAGGUUUUGCAGUCCAUAAACCCACAUUUCUUAGAUGGAAGAGAUAUAAAUGGACGCAUGCGUGCCAUCCUAGUGGAUUGGCUGGUACAAGUCCACUCCAAGUUUAGGCUUCUGCAGGAGACUCUGUACAUGUGCGUUGGCAUUAUGGAUCGAUUUUUACAGGUUCAGCCAGUUUCCCGGAAGAAGCUUCAAUUAGUUGGGAUUACUGCUCUGCUCUUGGCUUCCAAGUAUGAGGAGAUGUUUUCUCCAAAUAUUGAAGACUUUGUUUACAUCACAGACAAUGCUUAUACCAGUUCCCAAAUCCGAGAAAUGGAAACUCUAAUUUUGAAAGAAUUGAAAUUUGAGUUGGGUCGACCCUUGCCACUACACUUCUUAAGGCGAGCAUCAAAAGCCGGGGAGGUUGAUGUUGAACAGCACACUUUAGCCAAGUAUUUGAUGGAGCUGACUCUCAUCGACUAUGAUAUGGUGCAUUAUCAUCCUUCUAAGGUAGCAGCAGCUGCUUCCUGCUUGUCUCAGAAGGUUCUAGGACAAGGAAAAUGGAACUUAAAGCAGCAGUAUUACACAGGAUACACAGAGAAUGAAGUAUUGGAAGUCAUGCAGCACAUGGCCAAGAAUGUGGUGAAAGUAAAUGAAAACUUAACUAAAUUCAUCGCCAUCAAGAAUAAGUAUGCAAGCAGCAAACUCCUGAAGAUCAGCAUGAUCCCUCAGCUGAACUCAAAAGCCGUCAAAGACCUUGCCUCCCCACUGAUAGGAAGGUCCUAGGCUGCCGUGGCCCCUGGGGAUGUGUGCUUCAUUGUGCCCUUUUUCUUAUUGGUUUAGAACUCUUGAUUUUGUACAUAGUCCUCUGGUCUAUCUCAUGAAACCUCUUCUCAGACCAGUUUUCUAAACAUAUAUUGAGGAAAAAUAAAGCGAUUGGUUUUUCUUAAGGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-415.17 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -446.71

Frequency: 0.0000

Diversity: 302.07

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

..(.((((((((.(((((((......((((((((((((((((((.......))))(((((((((.....((((((((.((((......)))))))))))).....((((((.....(((...((((((((((....((((((....))))))))))..((((((....((((((......)))))))))))).......)))))).)))....)))))).(((((((...........))))))).........((((((((((((.(.((((.....))))).((((......))))(((((...............................)))))............((((((......).))))).((((((((((((......(((.......)))......((((.(.(((((.....)).))).).)))).))).))))))))))).)))..))))))).......))))))))).........(((((..((((((.(((((((((.((..(((..................)))..)))))..)))))).)))))).)))))...........(((((((......))))))).....(((((...(((..(((((((....))).))))..)))...))))).....((((.((((((((.(.((((((((((.((.((((.((((((......).)))))...)))).)).)))..)))))))..).)))))))).)))).)))))))...)))))))((((.((((((((((((((..(((((.....)))))..)))))....(((((((((.............((((......((((((....(((.......)))(((((.((((((((.....)))))))).)))))........(((((((...((.(((((..((((((((...........((((((.(((((.((.......((((.((.....(((.(((((((((....))).)))))).)))..)).)))))).))))).)))))).(((.(((((...))))).))))))))))).)))))))....)).))))).....))))))......))))(((((......))))).....)))))))))..))))))))).).)))..(((((...((((.((((..((((........)))).)))).))))...)))))........(((.(((.....))).)))..(((.(.(((((.(((....)))))))).))))..((((......((((((.(((..(....)..)))))))))...)))).)))))))..)))))))).)..(((..(((((....((((((((((..((((((((.....((((........))))..(((((((.......((....)).....)))))))..))))))))..)))....)))))))....))))).))).............

Thermodynamic Ensemble Prediction

,,(,((((((((.((((((({{,,,,((((((((((((((,{{{..,,{{.,,}|(((((((((...,,{(((((((.({((,.....)))))))))))}.,...((((((.....(((...{{{((({(((,,..((((((....))))))|}}}|,{{{||({{..,{((((......))))))))).}}},},}},)))}}}.))),...))))}}.(((((((.,{.....}}.))))))),},,.,...(((((((((({{.{.((((.....)))),.((((......))))(((({....................,||........}}})).......||,..((((({......).))))}.((((((((((((.,....(((,..,,,.|}}......{{||.{.{{{{{.....))}|||,,.,))),)))}}})))))))}}.)))..)))))))..,,,..)))))))))}...,}},.(((((.{((((((.((((({{((,,{,{(,(,,....,{{,,.,,}...,))},)))}})})))))).)))))).)))))...........(((((((......))))))).....{((((...(((..(((((((....)))}})))..)))...))))).....((((.((((((((.(.((((((((((.{(.((((,{{{{||,...,,|.}}}}}...}))},)).)))..))))))).,,.)))))))).)))).))))))}..,)))))))((((.((((((((((((((..(((((.....)))))..))))}....{((((((((........,....(((({.....((((((....(((,.....})))(((((.{(((((((.....)))))))}.))))),,.....,(((((((...({.(((((..((((((((,......,,,.((((((.(((((.((....,,,({{,.{{.....(({.(((((((((....))).)))))).)})..}}.)))))).))))).)))))).,|||(((((...))))).,,))))))))).)))))}}..,.)).))))).....))))))..,}}}),,,(((((......))))).....}}}))}})}.,))))))))).).)))..(((((.,.((((.((((..((((........)))).)))).)))).,.)))))........(((.(((.....))).)))..{({,(.(((((.(((....)))))))).)))}..((((......((((((.(((..,....}..)))))))))...)))),)))))))..)))))))).,{{((,.....}|}},,(({{(({(({..((((((((.....((((........))))..(((((((.......({....,,.....)))))))..})))))))..}}}.,})))}}}|..,{{||..,..))))},},,..,,..