Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_004935.4

Sequence Length

1122 nt

GC Content

0.5633

GCCAGAGUCUUAAAACCGAGGGCCCGCAGGGGUCCCCGCGGCCGCCGCGAUGCAGAAAUACGAGAAACUGGAAAAGAUUGGGGAAGGCACCUACGGAACUGUGUUCAAGGCCAAAAACCGGGAGACUCAUGAGAUCGUGGCUCUGAAACGGGUGAGGCUGGAUGACGAUGAUGAGGGUGUGCCGAGUUCCGCCCUCCGGGAGAUCUGCCUACUCAAGGAGCUGAAGCACAAGAACAUCGUCAGGCUUCAUGACGUCCUGCACAGCGACAAGAAGCUGACUUUGGUUUUUGAAUUCUGUGACCAGGACCUGAAGAAGUAUUUUGACAGUUGCAAUGGUGACCUCGAUCCUGAGAUUGUAAAGUCAUUCCUCUUCCAGCUACUAAAAGGGCUGGGAUUCUGUCAUAGCCGCAAUGUGCUACACAGGGACCUGAAGCCCCAGAACCUGCUAAUAAACAGGAAUGGGGAGCUGAAAUUGGCUGAUUUUGGCCUGGCUCGAGCCUUUGGGAUUCCCGUCCGCUGUUACUCAGCUGAGGUGGUCACACUGUGGUACCGCCCACCGGAUGUCCUCUUUGGGGCCAAGCUGUACUCCACGUCCAUCGACAUGUGGUCAGCCGGCUGCAUCUUUGCAGAGCUGGCCAAUGCUGGGCGGCCUCUUUUUCCCGGCAAUGAUGUCGAUGACCAGUUGAAGAGGAUCUUCCGACUGCUGGGGACGCCCACCGAGGAGCAGUGGCCCUCUAUGACCAAGCUGCCAGACUAUAAGCCCUAUCCGAUGUACCCGGCCACAACAUCCCUGGUGAACGUCGUGCCCAAACUCAAUGCCACAGGGAGGGAUCUGCUGCAGAACCUUCUGAAGUGUAACCCUGUCCAGCGUAUCUCAGCAGAAGAGGCCCUGCAGCACCCCUACUUCUCCGACUUCUGUCCGCCCUAGGCCCCGGGACCCCCGGCCUCCAGGCUGGGGCCUGGCCUAUUUAAGCCCCCUCUUGAGAGGGGUGAGACAGUGGGGGUGCCUGGUGCGCUGUGCUCCAGCAGUGCUGGGCCCAGCCGGGGUGGGGUGCCUGAGCCCGAAUUUCUCACUCCCUUUGUGGACUUUAUUUAAUUUCAUAAAUUGGCUCCUUUCCCACA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-434.00 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -451.00

Frequency: 0.0000

Diversity: 207.80

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((..((((........((((((....)))))).(((((...)))))............))))..)))).......(((((((((........((((...))))..((((((.....(((((.....((((((((.(((((.....(.((((.(((.((.((((((((.......(((((..((((((.......((........)).......))))))...)))))....)))))))).(((((.(.(.(((((((((((.....(((((((......))))))).....)))))..)))))).).).)))))....((((((.......((((((..(((((....)))))....))))))....((((((((........))))))))..))))))..((((((.((((((((...((((((((((((((((...((((........))))..))))).(((((....((((......))))....)).))))))))))..)))).((.((((.....)))).)).)))).)))).)))))).))))))))).)..(((((....)))))......(((((((((.(((((((((((.((((((((...(((((....))))).)))))))).(((((((.((......)).)))))))...)))))))))...(((((((((...)))).)))))((((((((((..(((((.(((...((((((...(((((....(((...........)))....))....)))...))))))....))).)))))..))))...(((...............)))((((...((((.((((....)))).))))...))))((.(((((((((...((((........)))).(((((((((((((((.(((....))).....((((((..(((..((((((((....))))))))))))))))).......((((((....)))))).)))).)))))))))))..))))))))).))((((((...)))))))))))).)).)))))))))..))))))))...))))))))))((((((((.((.....)).)))))))))))))))))))))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

.((((..((((........((((((....)))))),(((((...)))))............))))..)))).......(((((((((........((((...))))..((((({.....(((((.....((((((((.(((((.,...(.((((.(((.((.((((((((.{....,((({{..((((((.......((,.......)).......))))))...))))}....)))))))).(((((.(.(.(((((((((((...,,(((((({......))))))),....)))))..)))))).).).)))))....((((((.......{(((((..(((((....)))))....))))),....((((((((........))))))))..))))))..((((((.((((((((.{.(((((((((({(((((...((((........))))..))))).(((({..,.{{{{,....})))).|||}}.,)))))))))..)))).{{.((((.....)))).)},)))).)))).)))))).))))))))),}..(((((....})))}......(((((((((,({(((((((((.((((((((...(((((....))))).)))))))).(((((((.({......}}.)))))))...)))))))))}}((((((((({...))))}}))))),(((({(((,.(((((.(((,..((((((...{{{{{....(((...........)))....}}....}}}...))))))....))).)))))..})})||.}}},.......,,,,.,.|||((((.,.{(({.((((....)))).}))}...)))){|.{((((({{{...((((........)))).(((((((((((((((.(((....))).,...((((((..(((..((((((((....))))))))))))))))).....,,((((((....)))))).)))).)))))))))))..))))))))).}},(((((...))))))|||,},.))})))))))))}.))))))))...)))))))))){(((((((.{{.....}}.))))))))}))))})))))))))..