Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_004993.6
Sequence Length
6884 nt
GC Content
0.3771
GUGGGGGCCGUUGGCUCCAGACAAAUAAACAUGGAGUCCAUCUUCCACGAGAAACAAGAAGGCUCACUUUGUGCUCAACAUUGCCUGAAUAACUUAUUGCAAGGAGAAUAUUUUAGCCCUGUGGAAUUAUCCUCAAUUGCACAUCAGCUGGAUGAGGAGGAGAGGAUGAGAAUGGCAGAAGGAGGAGUUACUAGUGAAGAUUAUCGCACGUUUUUACAGCAGCCUUCUGGAAAUAUGGAUGACAGUGGUUUUUUCUCUAUUCAGGUUAUAAGCAAUGCCUUGAAAGUUUGGGGUUUAGAACUAAUCCUGUUCAACAGUCCAGAGUAUCAGAGGCUCAGGAUCGAUCCUAUAAAUGAAAGAUCAUUUAUAUGCAAUUAUAAGGAACACUGGUUUACAGUUAGAAAAUUAGGAAAACAGUGGUUUAACUUGAAUUCUCUCUUGACGGGUCCAGAAUUAAUAUCAGAUACAUAUCUUGCACUUUUCUUGGCUCAAUUACAACAGGAAGGUUAUUCUAUAUUUGUCGUUAAGGGUGAUCUGCCAGAUUGCGAAGCUGACCAACUCCUGCAGAUGAUUAGGGUCCAACAGAUGCAUCGACCAAAACUUAUUGGAGAAGAAUUAGCACAACUAAAAGAGCAAAGAGUCCAUAAAACAGACCUGGAACGAGUGUUAGAAGCAAAUGAUGGCUCAGGAAUGUUAGACGAAGAUGAGGAGGAUUUGCAGAGGGCUCUGGCACUAAGUCGCCAAGAAAUUGACAUGGAAGAUGAGGAAGCAGAUCUCCGCAGGGCUAUUCAGCUAAGUAUGCAAGGUAGUUCCAGAAACAUAUCUCAAGAUAUGACACAGACAUCAGGUACAAAUCUUACUUCAGAAGAGCUUCGGAAGAGACGAGAAGCCUACUUUGAAAAACAGCAGCAAAAGCAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGGGGGACCUAUCAGGACAGAGUUCACAUCCAUGUGAAAGGCCAGCCACCAGUUCAGGAGCACUUGGGAGUGAUCUAGGUGAUGCUAUGAGUGAAGAAGACAUGCUUCAGGCAGCUGUGACCAUGUCUUUAGAAACUGUCAGAAAUGAUUUGAAAACAGAAGGAAAAAAAUAAUACCUUUAAAAAAUAAUUUAGAUAUUCAUACUUUCCAACAUUAUCCUGUGUGAUUACAGCAUAGGGUCCACUUUGGUAAUGUGUCAAAGAGAUGAGGAAAUAAGACUUUUAGCGGUUUGCAAACAAAAUGAUGGGAAAGUGGAACAAUGCGUCGGUUGUAGGACUAAAUAAUGAUCUUCCAAAUAUUAGCCAAAGAGGCAUUCAGCAAUUAAAGACAUUUAAAAUAGUUUUCUAAAUGUUUCUUUUUCUUUUUUGAGUGUGCAAUAUGUAACAUGUCUAAAGUUAGGGCAUUUUUCUUGGAUCUUUUUGCAGACUAGCUAAUUAGCUCUCGCCUCAGGCUUUUUCCAUAUAGUUUGUUUUCUUUUUCUGUCUUGUAGGUAAGUUGGCUCACAUCAUGUAAUAGUGGCUUUCAUUUCUUAUUAACCAAAUUAACCUUUCAGGAAAGUAUCUCUACUUUCCUGAUGUUGAUAAUAGUAAUGGUUCUAGAAGGAUGAACAGUUCUCCCUUCAACUGUAUACCGUGUGCUCCAGUGUUUUCUUGUGUUGUUUUCUCUGAUCACAACUUUUCUGCUACCUGGUUUUCAUUAUUUUCCCACAAUUCUUUUGAAAGAUGGUAAUCUUUUCUGAGGUUUAGCGUUUUAAGCCCUACGAUGGGAUCAUUAUUUCAUGACUGGUGCGUUCCUAAACUCUGAAAUCAGCCUUGCACAAGUACUUGAGAAUAAAUGAGCAUUUUUUAAAAUGUGUGAGCAUGUGCUUUCCCAGAUGCUUUAUGAAUGUCUUUUCACUUAUAUCAAAACCUUACAGCUUUGUUGCAACCCCUUCUUCCUGCGCCUUAUUUUUUCCUUUCUUCUCCAAUUGAGAAAACUAGGAGAAGCAUAGUAUGCAGGCAAGUCUCCUUCUGUUAGAAGACUAAACAUACGUACCCACCAUGAAUGUAUGAUACAUGAAAUUUGGCCUUCAAUUUUAAUAGCAGUUUUAUUUUAUUUUUUCUCCUAUGACUGGAGCUUUGUGUUCUCUUUACAGUUGAGUCAUGGAAUGUAGGUGUCUGCUUCACAUCUUUUAGUAGGUAUAGCUUGUCAAAGAUGGUGAUCUGGAACAUGAAAAUAAUUUACUAAUGAAAAUAUGUUUAAAUUUAUACUGUGAUUUGACACUUGCAUCAUGUUUAGAUAGCUUAAGAACAAUGGAAGUCACAGUACUUAGUGGAUCUAUAAAUAAGAAAGUCCAUAGUUUUGAUAAAUAUUCUCUUUAAUUGAGAUGUACAGAGAGUUUCUUGCUGGGUCAAUAGGAUAGUAUCAUUUUGGUGAAAACCAUGUCUCUGAAAUUGAUGUUUUAGUUUCAGUGUUCCCUAUCCCUCAUUCUCCAUCUCCUUUUGAAGCUCUUUUGAAUGUUGAAUUGUUCAUAAGCUAAAAUCCAAGAAAUUUCAGCUGACAACUUCGAAAAUUAUAAUAUGGUAUAUUGCCCUCCUGGUGUGUGGCUGCACACAUUUUAUCAGGGAAAGUUUUUUGAUCUAGGAUUUAUUGCUAACUAACUGAAAAGAGAAGAAAAAAUAUCUUUUAUUUAUGAUUAUAAAAUAGCUUUUUCUUCGAUAUAACAGAUUUUUUAAGUCAUUAUUUUGUGCCAAUCAGUUUUCUGAAGUUUCCCUUACACAAAAGGAUAGCUUUAUUUUAAAAUCUAAAGUUUCUUUUAAUAGUUAAAAAUGUUUCAGAAGAAUUAUAAAACUUUAAAACUGCAAGGGAUGUUGGAGUUUAGUACUACUCCCUCAAGAUUUAAAAAGCUAAAUAUUUUAAGACUGAACAUUUAUGUUAAUUAUUACCAGUGUGUUUGUCAUAUUUUCCAUGGAUAUUUGUUCAUUACCUUUUUCCAUUGAAAAGUUACAUUAAACUUUUCAUACACUUGAAUUGAUGAGCUACCUAAUAUAAAAAUGAGAAAACCAAUAUGCAUUUUAAAGUUUUAACUUUAGAGUUUAUAAAGUUCAUAUAUACCCUAGUUAAAGCACUUAAGAAAAUAUGGCAUGUUUGACUUUUAGUUCCUAGAGAGUUUUUGUUUUUGUUUUUGUUUUUUUUUGAGACGGAGUCUUGCUAUGUCUCCCAGGCUGGAGGGCAGUGGCAUGAUCUCGGCUCACUACAACUUCCACCUCCCGGGUUCAAGCAAUUCUCCUGCCUCAGCCUCCAGAGUAGCUGGGAUUACAGGCGCCCACCACCACACCCGGCAGAUUUUUGUAUUUUUGGUAGAGACGCGGUUUCAUCAUGUUUGGCCAGGCUGGUCUCGAACUCCUGACCUCAGGUGAUCCGCCUGCCUUGGCCUCCCAAAGUGUUGGGAUUACAGGCAUGAGCCACUGCGCCUGGCCAGCUAGAGAGUUUUUAAAGCAGAGCUGAGCACACACUGGAUGCGUUUGAAUGUGUUUGUGUAGUUUGUUGUGAAAUUGUUACAUUUAGCAGGCAGAUCCAGAAGCACUAGUGAACUGUCAUCUUGGUGGGGUUGGCUUAAAUUUAAUUGACUGUUUAGAUUCCAUUUCUUAAUUGAUUGGCCAGUAUGAAAAGAUGCCAGUGCAAGUAACCAUAGUAUCAAAAAAGUUAAAAAUUAUUCAAAGCUAUAGUUUAUACAUCAGGUACUGCCAUUUACUGUAAACCACCUGCAAGAAAGUCAGGAACAACUAAAUUCACAAGAACUGUCCUGCUAAGAAGUGUAUUAAAGAUUUCCAUUUUGUUUUACUAAUUGGGAACAUCUUAAUGUUUAAUAUUUAAACUAUUGGUAUCAUUUUUCUAAUGUAUAAUUUGUAUUACUGGGAUCAAGUAUGUACAGUGGUGAUGCUAGUAGAAGUUUAAGCCUUGGAAAUACCACUUUCAUAUUUUCAGAUGUCAUGGAUUUAAUGAGUAAUUUAUGUUUUUAAAAUUCAGAAUAGUUAAUCUCUGAUCUAAAACCAUCAAUCUAUGUUUUUUACGGUAAUCAUGUAAAUAUUUCAGUAAUAUAAACUGUUUGAAAAGGCUGCUGCAGGUAAACUCUAUACUAGGAUCUUGGCCAAAUAAUUUACAAUUCACAGAAUAUUUUAUUUAAGGUGGUGCUUUUUUUUUUUGUCCUUAAAACUUGAUUUUUCUUAACUUUAUUCAUGAUGCCAAAGUAAAUGAGGAAAAAAACUCAAAACCAGUUGAGUAUCAUUGCAGACAAAACUACCAGUAGUCCAUAUUGUUUAAUAUUAAGUUGAAUAAAAUAAAUUUUAUUUCAGUCAGAGCCUAAAUCACAUUUUGAUUGUCUGAAUUUUUGAUACUAUUUUUAAAAUCAUGCUAGUGGCGGCUGGGCGUGGUAGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCAUUUUGGGAGGCCGAAGUGGGUGGAUCACGAGGUCGGGAGUUCGAGACCAGCUUGGCCAAAAUGGUGAAACCCCAUCUGUACUAAAAACUACAAAAAUUAGCUGGGCGCGGUGGCAGGUGCCUGUAAUCCCAGCUACCUGGGAGUCUGAGGCAGGAGAAUUGCUUGAACCCUGGCGACAGAGGAUGCAGUGAGCCAAGAUGGUGCCACUGUACUCCAGACUGGGCGACAGAGUGAGACUCUGUCUCAAAAAAAAAAAAAAAAUCAUGCUAGUGCCAAGAGCUACUAAAUUCUUAAAACCGGCCCAUUGGACCUGUACAGAUAAAAAAUAGAUUCAGUGCAUAAUCAAAAUAUGAUAAUUUUAAAAUCUUAAGUAGAAAAAUAAAUCUUGAUGUUUUAAAUUCUUACGAGGAUUCAAUAGUUAAUAUUGAUGAUCUCCCGGCUGGGUGCAGUGGCUCACGCCUGUAAUCCCAGCAGUUCUGGAGGCUGAGGUGGGCGAAUCACUUCAGGCCAGGAGUUCAAGACCAGUCUGGGCAACAUGGUGAAACCUCGUUUCUACUAAA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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2272.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2398.41
Frequency: 0.0000
Diversity: 1654.42
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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