Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005195.4
Sequence Length
1252 nt
GC Content
0.6597
AGGUGACAGCCUCGCUUGGACGCAGAGCCCGGCCCGACGCCGCCAUGAGCGCCGCGCUCUUCAGCCUGGACGGCCCGGCGCGCGGCGCGCCCUGGCCUGCGGAGCCUGCGCCCUUCUACGAACCGGGCCGGGCGGGCAAGCCGGGCCGCGGGGCCGAGCCAGGGGCCCUAGGCGAGCCAGGCGCCGCCGCCCCCGCCAUGUACGACGACGAGAGCGCCAUCGACUUCAGCGCCUACAUCGACUCCAUGGCCGCCGUGCCCACCCUGGAGCUGUGCCACGACGAGCUCUUCGCCGACCUCUUCAACAGCAAUCACAAGGCGGGCGGCGCGGGGCCCCUGGAGCUUCUUCCCGGCGGCCCCGCGCGCCCCUUGGGCCCGGGCCCUGCCGCUCCCCGCCUGCUCAAGCGCGAGCCCGACUGGGGCGACGGCGACGCGCCCGGCUCGCUGUUGCCCGCGCAGGUGGCCGCGUGCGCACAGACCGUGGUGAGCUUGGCGGCCGCAGGGCAGCCCACCCCGCCCACGUCGCCGGAGCCGCCGCGCAGCAGCCCCAGGCAGACCCCCGCGCCCGGCCCCGCCCGGGAGAAGAGCGCCGGCAAGAGGGGCCCGGACCGCGGCAGCCCCGAGUACCGGCAGCGGCGCGAGCGCAACAACAUCGCCGUGCGCAAGAGCCGCGACAAGGCCAAGCGGCGCAACCAGGAGAUGCAGCAGAAGUUGGUGGAGCUGUCGGCUGAGAACGAGAAGCUGCACCAGCGCGUGGAGCAGCUCACGCGGGACCUGGCCGGCCUCCGGCAGUUCUUCAAGCAGCUGCCCAGCCCGCCCUUCCUGCCGGCCGCCGGGACAGCAGACUGCCGGUAACGCGCGGCCGGGGCGGGAGAGACUCAGCAACGACCCAUACCUCAGACCCGACGGCCCGGAGCGGAGCGCGCCCUGCCCUGGCGCAGCCAGAGCCGCCGGGUGCCCGCUGCAGUUUCUUGGGACAUAGGAGCGCAAAGAAGCUACAGCCUGGACUUACCACCACUAAACUGCGAGAGAAGCUAAACGUGUUUAUUUUCCCUUAAAUUAUUUUUGUAAUGGUAGCUUUUUCUACAUCUUACUCCUGUUGAUGCAGCUAAGGUACAUUUGUAAAAAGAAAAAAAACCAGACUUUUCAGACAAACCCUUUGUAUUGUAGAUAAGAGGAAAAGACUGAGCAUGCUCACUUUUUUAUAUUAAUUUUUACAGUAUUUGUAAGAAUAAAGCAGCAUUUGAAAUCGC

Secondary Structure

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Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-563.00 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -583.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 260.50
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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