Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_005465.7
Sequence Length
7281 nt
GC Content
0.4105
GCAGCCCUUCGCUUGCCCUCCCGCCGGCCGCACCGGGCUCCAGGAGGCCAGAGGCUCUGUGGGGUGGGGGGAGGACAGGAGGGGAGGAGGAGGGAGGGGGGACCCCCGAGUCGCCCCCUCUCCUCCCCCCGCCCCCCCCCGGCUCCAUCCUCCGCCGCCGCCCGAGCAGCUGCGGGGCCGCCACCGCCGCCGCCGCCGUUGCAGGCUGAGUCAUCACUAGAGAGUGGGAAGGGCAGCAGCAGCAGAGAAUCCAAACCCUAAAGCUGAUAUCACAAAGUACCAUUUCUCCAAGUUGGGGGCUCAGAGGGGAGUCAUCAUGAGCGAUGUUACCAUUGUGAAAGAAGGUUGGGUUCAGAAGAGGGGAGAAUAUAUAAAAAACUGGAGGCCAAGAUACUUCCUUUUGAAGACAGAUGGCUCAUUCAUAGGAUAUAAAGAGAAACCUCAAGAUGUGGAUUUACCUUAUCCCCUCAACAACUUUUCAGUGGCAAAAUGCCAGUUAAUGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACAUUUAUAAUCAGAUGUCUCCAGUGGACUACUGUUAUAGAGAGAACAUUUCAUGUAGAUACUCCAGAGGAAAGGGAAGAAUGGACAGAAGCUAUCCAGGCUGUAGCAGACAGACUGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAAUGAAUUGUAGUCCAACUUCACAAAUUGAUAAUAUAGGAGAGGAAGAGAUGGAUGCCUCUACAACCCAUCAUAAAAGAAAGACAAUGAAUGAUUUUGACUAUUUGAAACUACUAGGUAAAGGCACUUUUGGGAAAGUUAUUUUGGUUCGAGAGAAGGCAAGUGGAAAAUACUAUGCUAUGAAGAUUCUGAAGAAAGAAGUCAUUAUUGCAAAGGAUGAAGUGGCACACACUCUAACUGAAAGCAGAGUAUUAAAGAACACUAGACAUCCCUUUUUAACAUCCUUGAAAUAUUCCUUCCAGACAAAAGACCGUUUGUGUUUUGUGAUGGAAUAUGUUAAUGGGGGCGAGCUGUUUUUCCAUUUGUCGAGAGAGCGGGUGUUCUCUGAGGACCGCACACGUUUCUAUGGUGCAGAAAUUGUCUCUGCCUUGGACUAUCUACAUUCCGGAAAGAUUGUGUACCGUGAUCUCAAGUUGGAGAAUCUAAUGCUGGACAAAGAUGGCCACAUAAAAAUUACAGAUUUUGGACUUUGCAAAGAAGGGAUCACAGAUGCAGCCACCAUGAAGACAUUCUGUGGCACUCCAGAAUAUCUGGCACCAGAGGUGUUAGAAGAUAAUGACUAUGGCCGAGCAGUAGACUGGUGGGGCCUAGGGGUUGUCAUGUAUGAAAUGAUGUGUGGGAGGUUACCUUUCUACAACCAGGACCAUGAGAAACUUUUUGAAUUAAUAUUAAUGGAAGACAUUAAAUUUCCUCGAACACUCUCUUCAGAUGCAAAAUCAUUGCUUUCAGGGCUCUUGAUAAAGGAUCCAAAUAAACGCCUUGGUGGAGGACCAGAUGAUGCAAAAGAAAUUAUGAGACACAGUUUCUUCUCUGGAGUAAACUGGCAAGAUGUAUAUGAUAAAAAGCUUGUACCUCCUUUUAAACCUCAAGUAACAUCUGAGACAGAUACUAGAUAUUUUGAUGAAGAAUUUACAGCUCAGACUAUUACAAUAACACCACCUGAAAAAUAUGAUGAGGAUGGUAUGGACUGCAUGGACAAUGAGAGGCGGCCGCAUUUCCCUCAAUUUUCCUACUCUGCAAGUGGACGAGAAUAAGUCUCUUUCAUUCUGCUACUUCACUGUCAUCUUCAAUUUAUUACUGAAAAUGAUUCCUGGACAUCACCAGUCCUAGCUCUUACACAUAGCAGGGGCACCUUCCGACAUCCCAGACCAGCCAAGGGUCCUCACCCCUCGCCACCUUUCACCCUCAUGAAAACACACAUACACGCAAAUACACUCCAGUUUUUGUUUUUGCAUGAAAUUGUAUCUCAGUCUAAGGUCUCAUGCUGUUGCUGCUACUGUCUUACUAUUAUAGCAACUUUAAGAAGUAAUUUUCCAACCUUUGGAAGUCAUGAGCCCACCAUUGUUCAUUUGUGCACCAAUUAUCAUCUUUUGAUCUUUUAGUUUUUCCCUCAGUGAAGGCUAAAUGAGAUACACUGAUUCUAGGUACAUUUUUUAACUUUCUAGAAGAGAAAAACUAACUAGACUAAGAAGAUUUAGUUUAUAAAUUCAGAACAAGCAAUUGUGGAAGGGUGGUGGCGUGCAUAUGUAAAGCACAUCAGAUCCGUGCGUGAAGUAGGCAUAUAUCACUAAGCUGUGGCUGGAAUUGAUUAGGAAGCAUUUGGUAGAAGGACUGAACAACUGUUGGGAUAUAUAUAUAUAUAUAUAAUUUUUUUUUUUUAAAUUCCUGGUGGAUACUGUAGAAGAAGCCCAUAUCACAUGUGGAUGUCGAGACUUCACGGGCAAUCAUGAGCAAGUGAACACUGUUCUACCAAGAACUGAAGGCAUAUGCACAGUCAAGGUCACUUAAAGGGUCUUAUGAAACAAUUUGAGCCAGAGAGCAUCUUUCCCCUGUGCUUGGAAACCUUUUUUCCUUCUUGACAUUUAUCACCUCUGAUGGCUGAAGAAUGUAGACAGGUAUAAUGAUACUGCUUUUCACCAAAAUUUCUACACCAAGGUAAACAGGUGUUUGCCUUAUUUAAUUUUUUACUUUCAGUUCUACGUGAAUUAGCUUUUUCUCAGAUGUUGAAACUUUGAAUGUCCUUUUAUGAUUUUGUUUAUAUUGCAGUAGUAUUUAUUUUUUAGUGAUGAGAAUUGUAUGUCAUGUUAGCAAACGCAGCUCCAACUUAUAUAAAAUAGACUUACUGCAGUUACUUUUGACCCAUGUGCAAGGAUUGUACACGCUGAUGAGAAUCAUGCACUUUUUCUCCUCUGUUAAAAAAAAUGAUAAGGCUCUGAAAUGGAAUAUAUUGGUUAGAAUUUGGCUUUGGGAGAAGAGAUGCUGCCAUUUAACCCCUUGGUACUGAAAAUGAGAAAAUCCCCAACUAUGCAUGCCAAGGGGUUAAUGAAACAAAUAGCUGUUGACGUUUGCUCAUUUAAGAAUUUGAAACGUUAUGAUGACCUGGCAACAAAAAGUAAUGAAGAAAAUUGAGACCUGAGUGAAGAUAAGAAAUGAUCUUUACGUGGCAAAAUGAACACAUCUUGAGUAUUUAGGAAAUGGGCAGUGAAGGCUAAGAACCUGGUGUGUUUCUUGGGAUCAUGGUACAUUUAUCACUGAAUUAAGCCAUCAGGGAAAAAACAACAAAAAAAGAGAACACCUCCAGCUUUUCUUUUUCUGUAUAUACUCAUGUCCCCCAGAUUCCAACAUUUCUCACUGAAAGGGGGCAUGUAUGCAAACCUCAUCUUUCUCCUUCAUUAAUGAUGAUCUUCAGAUUAAACCCUUUGGUGCUAGGAGCUGACAAUUUCCAAAGCAGCCUGUGAAGUCCUAGGGGCUGGGGGCCACUCUUGCGGCAAGCAGAAGGCCAUCCUACUCCGCGGAGUGAUCAUGGAAAUGUAUUUUAGUUAAACUCUGACAGCUCCCAAACGGAAGACUACAGCAUGACGUAGUAUUAUGAUUGCAUUGUAUGAAAGAGCAAGUGACUUUCUAAGUAGGAUGAAUCAUAUUCAUAUGCAGAUGUCUUAGCCUCUUGACGCUGGAAGUGUGGAUUUAUAGCUAUGAAACCACUGCUGGCAGUGGGUGGGCCACUGGGACUGACGGGGGUUAAAGGGCAUUUUACUAAGGCAGCUAAGACAUAUUCAGACAUCAACGUUAUCCUUCUUUUUCAUAUUUCUACCUGAGUGAAGUUCAUCCUUAGUAUUGAGUAGGAAGUUACAGUAAAUGGUAGUUCAUUCUUACUUACACACAUAGCUAAUCUUUUUUUUUUCACUUGGAAUUAUGUUGAAUGUUUCAUUUUGACAAAAAAGUAGACUAGAAGGUAUGUUCUUUAAGUUGUCUUGCAUCCAUUAUAUAAGAAAGAAACAGGUGAGAGGAAGAGCAGAAAGCUGAGACUGGCUGAUGUUCAGAGCACUUACUCCUCUAGAGGGAAAGCAUGACACCGAACACUAAGCACACAGCUUUUUGUUGUUUUGGUUUUUUCUCCCGCAAAUCUUAAAGUGAUUCCCAUGACCUUGGCCAAGGACACUUCUUAAAGAUUAAUGACUGGCACUGACAUUGCCCCAGGCGGGCCACUCCUCACACUGGCUCUCAGUUCCCAGCCAUGCCUGGGGCUCAGUCACUUCUAUUCCACCCUCUGAGACUCCAUUGGUGUCACACAAGGUGUCUUCUUGGCUUUGAUUUUGAGAAUCCCCUAUUUUCACUUCCAGAUCUGUCAGCUGCCAUGGAGGAAUAAUAGAAAACCAGAAAUGCGUGUAGAGGGAGAUUUCUAAAACUUCCCUUGUGUCGCCCAUAGUUGUAGUUUUGGGUUCUGGCAGGUGGAACACCCUGAAACCUGGAAUCAUUCUAUGAGAAUACAGUUCAGACUUUGCAGACUCCAGCCCAUACUAACUGUCAUGAAGCUUGACUUCUUGUCAUAAUGCAGCCAUCUUGGAGGAAAUUGGCCAUUUCUGCUUAGAUGGUUGGCAGGGUCGCGCUCAGCUUUGCUUUCUACACUAAUUACAUAGCAUUAUUCAAGUAUUGUUUUCCAUUUCCCAUCCCUGAUUUCCAGCUUCUUAAAGCUGACUGUUCUUGCAGGGGCCACUUGCUUCUCCUAGAGUACAAAAGUAAGGGCCUUCCUUACUAACUGCAGGGUCUCUCUAUUACACCUCAACAUACACACUUUGCUGCUACUGUUUGUACUGUCUACAGUAGAAUUUCCUUAUCUUGCUCCUGGUAGUGCAUUACAGGCAAGCAUGAAAUGUAAAGUAUUUAUUUAAAUAAAAAGAAAACCUCUAAAUUGGUAAUUGAAUUACCUCCCUGUAGCUUUAUAGUUUGUGACAUUUCUUGACCUUGCUAGUUCUUUCAUUAGAUCUGCGCAAGAUCUAG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Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-2028.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -2167.49
Frequency: 0.0000
Diversity: 2368.73
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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