Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_006487.3

Sequence Length

2442 nt

GC Content

0.5852

GUUGGCUGCCGAGGCUCGGCCGGAGCGUGGAGCCCGCGCCGCUGCCCCAGGACCGCGCCCGCGCCUUUGUCCGCCGCCGCCCACCGCCCGUCGCCCGCCGCCCAUGGAGCGCGCCGCGCCGUCGCGCCGGGUCCCGCUUCCGCUGCUGCUGCUCGGCGGCCUUGCGCUGCUGGCGGCCGGAGUGGACGCGGAUGUCCUCCUGGAGGCCUGCUGUGCGGACGGACACCGGAUGGCCACUCAUCAGAAGGACUGCUCGCUGCCAUAUGCUACGGAAUCCAAAGAAUGCAGGAUGGUGCAGGAGCAGUGCUGCCACAGCCAGCUGGAGGAGCUGCACUGUGCCACGGGCAUCAGCCUGGCCAACGAGCAGGACCGCUGUGCCACGCCCCACGGUGACAACGCCAGCCUGGAGGCCACAUUUGUGAAGAGGUGCUGCCAUUGCUGUCUGCUGGGGAGGGCGGCCCAGGCCCAGGGCCAGAGCUGCGAGUACAGCCUCAUGGUUGGCUACCAGUGUGGACAGGUCUUCCAGGCAUGCUGUGUCAAGAGCCAGGAGACCGGAGAUUUGGAUGUCGGGGGCCUCCAAGAAACGGAUAAGAUCAUUGAGGUUGAGGAGGAACAAGAGGACCCAUAUCUGAAUGACCGCUGCCGAGGAGGCGGGCCCUGCAAGCAGCAGUGCCGAGACACGGGUGACGAGGUGGUCUGCUCCUGCUUCGUGGGCUACCAGCUGCUGUCUGAUGGUGUCUCCUGUGAAGAUGUCAAUGAAUGCAUCACGGGCAGCCACAGCUGCCGGCUUGGAGAAUCCUGCAUCAACACAGUGGGCUCUUUCCGCUGCCAGCGGGACAGCAGCUGCGGGACUGGCUAUGAGCUCACAGAGGACAAUAGCUGCAAAGAUAUUGACGAGUGUGAGAGUGGUAUUCAUAACUGCCUCCCCGAUUUUAUCUGUCAGAAUACUCUGGGAUCCUUCCGCUGCCGACCCAAGCUACAGUGCAAGAGUGGCUUUAUACAAGAUGCUCUAGGCAACUGUAUUGAUAUCAAUGAGUGUUUGAGUAUCAGUGCCCCGUGCCCUAUCGGGCAUACAUGCAUCAACACAGAGGGCUCCUACACGUGCCAGAAGAACGUGCCCAACUGUGGCCGUGGCUACCAUCUCAACGAGGAGGGAACGCGCUGUGUUGAUGUGGACGAGUGCGCGCCACCUGCUGAGCCCUGUGGGAAGGGACAUCGCUGCGUGAACUCUCCCGGCAGUUUCCGCUGCGAAUGCAAGACGGGUUACUAUUUUGACGGCAUCAGCAGGAUGUGUGUCGAUGUCAACGAGUGCCAGCGCUACCCCGGGCGCCUGUGUGGCCACAAGUGCGAGAACACGCUGGGCUCCUACCUCUGCAGCUGUUCCGUGGGCUUCCGGCUCUCUGUGGAUGGCAGGUCAUGUGAAGACAUCAAUGAGUGCAGCAGCAGCCCCUGUAGCCAGGAGUGUGCCAACGUCUACGGCUCCUACCAGUGUUACUGCCGGCGAGGCUACCAGCUCAGCGAUGUGGAUGGAGUCACCUGUGAAGACAUCGACGAGUGCGCCCUGCCCACCGGGGGCCACAUCUGCUCCUACCGCUGCAUCAACAUCCCUGGAAGCUUCCAGUGCAGCUGCCCCUCGUCUGGCUACAGGCUGGCCCCCAAUGGCCGCAACUGCCAAGACAUUGAUGAGUGUGUGACUGGCAUCCACAACUGCUCCAUCAACGAGACCUGCUUCAACAUCCAGGGCGGCUUCCGCUGCCUGGCCUUCGAGUGCCCUGAGAACUACCGCCGCUCCGCAGCCACAUGAUCGUAGGGAACUCUGCAUGAGGCCAUCGGUGCAGGCUGGAGAAGAGAAGGCAAGUUGGCAGGAGUGGAGACCACGGGCAUUUGAGCCACUUCCUCAUGUAACUUAACUUGUGCCUUCAGGACCUGCUCAAGCCCGAUCACGUAUAUACCACUUCCAUUUGAUGAUGGAAUGCUGCUGUUCAUGACCAACUUUAUGGCUAGAUGGGUCAGAAAGCACCCAGUUCAUGAUAGGCAGUUCAGGUCAUAUGGUGACUUGAUGACCCAGAGUCAAACAUUCAGUUUCCACCAAAGCCCAGUAACAGGCCAAGAGCUGUCUCUCAAAAGGAGAGUAGUUAUCUGCAGAAGAUGGCAGGGCCUUGCUCCGAAAGCCUAGAGACCGCCACUGUGAUUCACCUAUGGGGGCCUGCCAAAGGCUGCAGCCAGCAUCCUUAUCUGCCACUGACACCUCAAGCAACAUUGGAUCUGCUGGGUCAUAUGGCCCAAGUGGCAGAGCAACUUGCACAACAGCCUGGACCUGUCAUAGAGCUUUCUCCUGUUCUGGACCCCACUCAAAACUGGCAGCCUUUCAGGUCACUCGAUAAAUGUGCUGGAGUAACACUCAAACGAGGAAUGUGUUGCCUCCAAAAUCCAAUAGGCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-965.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -1006.29

Frequency: 0.0000

Diversity: 785.00

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...(((.((.(((((.((.(((((...((((((((((((.((.(((((((((..(((.(((((((....((((((((((..((.(((..((((((.((.((.(((((((((.(((((((....))))..)))..))).)))).))..)).))..))))))...))).)).)))))).))))..)).))))).)))..)))))).)))..)).))))))..(((..((((.(.(((((((((((..(((...((..(((((.....(((..((((((((..((((((((..((((..((((((((((..(((.(((...((((((((((((((((((((...((((((.((((..((((........)).)))))))))).))...))))))).....(((((((..(((((...((((((.....((.((((((.((.((........)).)))))))))).((((...))))......))))))...)))))..))))))).(((.((((.....(((((.((.(((...((......)).))).)))))))((..((((((((((.(((..(((((..((....(((......)))....))..)))))..........)))))))))))))..))..((((.....))))(((.((((.....)))).)))...)))).)))((((...((((.((((((((((.((.(((((....((((((((((.((((((((((.(((((.(((((........))))).(.((((((....)))))).)..........((((((((..(((((.(((((.........(((.(((((...(((((((((((...((.((.((((((((((((........(((...(((((....((.(.(.(((.(((((.......))))))))))))....)))))..)))....)))))(((....)))(((.........)))((((((((.(((((..(((.....)))..)))))..)).)))))).(((((((((.......)))).)))))((((...((((((....))))))....))))...(((((.((((......((((.........))))))))..)))))...((((((((((((((........))))..(((((.(((((((((.(((....(((((...(((((((((((((((.((.((((...((((...)))).)))).)).))))...(((((((....)).)).)))((((......))))))).)))))))).)))))))).))))))))))))))..(((((......))))).)).))))))))....(((......)))))))))).)))))))))))))))))))).)))....))))).)))))))).)))))))))).).))))))).)).)).))))))))))))).)).)).)))))))).)))).))))..)))))))).)))))....)))((((.(.(((.....((((..((((((..((((......))))....))))))..)))).......)))).)))).)))..)).)))))))))))))))))).....))..))))...)))))))))))).)).))).(((((((.....((.((((......))))))....))).))))..))))))))).)).)))))..))).......(((.......)))....))))))...))).)).))))))).)).))).((((((((((((.(((((((....(((((((.(((..(((.(((....(((((....)))))))).)))...))).)).))).))((((((((((((....(((((((.((((((((..(((((..((((((....((((......((.......))......))))...)))))))))))................(((((((....))))))).((((((..(((((((((......))).....(((((........)))))..))))))..))))))(((((((((...)))))))))((((.....))))........)))))))).............(((((....(((((.(((((.....))))))))))..((((((....(((((((..((.(((.....)))..))...((.(((..(((...)))...))).)))))))))....))))))...(((......(((((((((.........((((..........))))(((((....))))).)))))))))......)))......)))))..)))))))....))))))))...))))((...(((........)))...))))))))).))))))).........(((((((((((.............)))))).))))).........)))))..

Thermodynamic Ensemble Prediction

..{((,{({.(((((.{({((({,{.(((((((((((((.((.(((((((((..(((.(((((((....((((((((((,.{(.(((..((((((.((.((.(((((((((.{((((((....)))},})},..)))}}))).))..)).))..))))))...))).)).})))))}})))..)).))))).)))..)))))).)))..)).))))))..(((..((((.(.(((((((((((,.((.(((((((.((((({(,({(,.,,............,)}),.)))}.))))))))))).))({(.,(({{((({((,({({(((((((({(,..{(((({.{(((,,((((.....,..}}.}}})))}|}}.||,,.|||||||,,...{{{(((({{(((((,{{((((|({.,.,((.((((({.,({(({{{{{{{|,{||{|||||},,,(((({{.||,},.{{{{|||||}..,|||}}..))))|||{{{|{{{,|||.{{,({((((,,(({(({.((((,...{((({((((,.{((({{(((({((((((((({{(((((..,...(((....,.(({{{.((({,..|{.||..,....,..))),,)))),)))}}})}.|,|},.}}}))).(((.((((.....)))).)))....{{{({{{{{{{.,{{{||,,|||||||||}{|,|||||.,{{((((((((({.{,((,((((,(((((..(((((.......,,||}}.{.((((((....)))))).|..||,|...,|{{||}}}..}}|||.|||}.},.,|{{{{,..}))))))}}|||||}|{{({...(({((({{{((((((...{.(((((.((....)).))))).}...)))))).,,,||,,}}},,.,}))),)))))}}...,,,,,,|,||,,.}))))|,,}}}},,,{{{,,.....,.))){(((((((.(((((..(({.....)))..)))))..)),,)))}|{((,,.,|||,..{{{|||||||||}.(((({{.({{{{{....))))))..,})),)}}}|||,,.,||||}.}}|||||}}}.}}}}.}),)),}},})))))))}({((({{({.{(((.....,}})}|...(((((,{((((((((.(((....(((((,..((((((((((((((({((.{(((...((((...)))).))))})).))))...(((((((....))},).)))((((......))))))).)))))))).}))))))).))))))))))))))||{|{|{.....,))))),}).))))))))..||(,(.,..|,}}}})}})}}.},}))),)))))),),)),)))))}},}))))))))})}},}})))},||||,,|.,,}}}}}}}}|},.}))))))))))})|)|,,|,})|))))}|)))..}.}}},,||||,,..,{{,|}||,}})..||||,|||..,||||||,|,{{{{|,|{{|,||||,.,|||}...}}},,,,.|{(((.(((((.......,)))))))).}),}))},,...}))})}}}..}}}..|||||,},,}})))))))))),},))}}},))))))...))}.((((......))))||....)),....,.}))))))))).)).)))))..)))......)))))}},..)),).)).))))),.},.}},|((((((....))))))}((((((((((((.(((((((.,..{{(((((.(((..(((.((({...{{((,...})}}))))).)))...))).)).))).||{{,,((((((((....(((((((.((((((((..(((((..((((((.,..((((...{,.((.......)),,....))))..,)))))))))))................(((((((....))))))).((((((..(((((((({......})).....((((({.....,.)))))..))))))..))))))(((((((((...)))))))))((((.....))))........))))))))....{{{......{{|||,..,{((((,(((((.....)))))}}}}}..((((((....(((((((.{((,{((.....}}}...},|.,(.({{..|||...},}...}))})})))))))....))))))...||{......(((((((((......,|,({{{....,,,...}}}|(((((....)))))}))))))))),,....)))....}}))))),.)))))}}....))))))))...)))}{{...{{{........)))..,))))))))).))))))).........(((((((((((,,...........)))))),})))).........)))))..