Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006712.5
Sequence Length
1794 nt
GC Content
0.6315
AUCUAGGGGCUGCUGGGAAGAUGGCGGACUCGGUGGCUAGCCGAUGAGGAGGCCGCGGGGGGAACCCGGCCCCCGGGCCCCGAGACCGACUGAGGGAGCGACCUGCGCAGGGCCCGGGGAGUCAUGGUCUCCAUCACCCAACUCCAUGCUUCGAGUCCUGCUCUCUGCUCAGACCUCCCCUGCUCGGCUGUCUGGCCUGCUGCUGAUCCCUCCAGUACAGCCCUGCUGUUUGGGGCCCAGCAAAUGGGGGGACCGGCCUGUUGGAGGAGGCCCCAGUGCAGGUCCUGUGCAAGGACUGCAGCGGCUUCUGGAACAGGCGAAGAGCCCUGGGGAGCUGCUGCGCUGGCUGGGCCAGAACCCCAGCAAGGUGCGCGCCCACCACUACUCGGUGGCGCUUCGUCGUCUGGGCCAGCUCUUGGGGUCUCGGCCACGGCCCCCUCCUGUGGAGCAGGUCACACUGCAGGACUUGAGUCAGCUCAUCAUCCGAAACUGCCCCUCCUUUGACAUUCACACCAUCCACGUGUGUCUGCACCUUGCAGUCUUACUUGGCUUUCCAUCUGAUGGUCCCCUGGUGUGUGCCCUGGAACAGGAGCGAAGGCUCCGCCUCCCUCCGAAGCCACCUCCCCCUUUGCAGCCCCUUCUCCGAGGUGGGCAAGGGUUGGAAGCUGCUCUAAGCUGCCCCCGUUUUCUGCGGUAUCCACGGCAGCAUCUGAUCAGCAGCCUGGCAGAGGCAAGGCCAGAGGAACUGACUCCCCACGUGAUGGUGCUCCUGGCCCAGCACCUGGCCCGGCACCGGUUGCGGGAGCCCCAGCUUCUGGAAGCCAUUGCCCACUUCCUGGUGGUUCAGGAAACGCAACUCAGCAGCAAGGUGGUACAGAAGUUGGUCCUGCCCUUUGGGCGACUGAACUACCUGCCCCUGGAACAGCAGUUUAUGCCCUGCCUUGAGAGGAUCCUGGCUCGGGAAGCAGGGGUGGCACCCCUGGCUACAGUCAACAUCUUGAUGUCACUGUGCCAACUGCGGUGCCUGCCCUUCAGAGCCCUGCACUUUGUUUUUUCCCCUGGCUUCAUCAACUACAUCAGUGGCACCCCUCAUGCUCUGAUUGUGCGUCGCUACCUCUCCCUGCUGGACACGGCCGUGGAGCUGGAGCUCCCAGGAUACCGGGGUCCCCGCCUUCCCCGAAGGCAGCAAGUGCCCAUCUUUCCCCAGCCUCUCAUCACCGACCGUGCCCGCUGCAAGUACAGUCACAAGGACAUAGUAGCUGAGGGGUUGCGCCAGCUGCUGGGGGAGGAGAAAUACCGCCAGGACCUGACUGUGCCUCCAGGCUACUGCACAGACUUCCUGCUGUGCGCCAGCAGCUCUGGUGCUGUGCUUCCCGUGAGGACCCAGGACCCCUUCCUGCCAUACCCACCAAGGUCCUGCCCACAGGGCCAGGCUGCCUCUAGCGCCACUACUCGAGACCCUGCCCAGAGGGUGGUGCUGGUGUUGCGGGAACGCUGGCAUUUCUGCCGGGACGGCCGGGUGCUGCUGGGCUCGAGGGCCCUGAGGGAGCGGCACCUAGGCCUGAUGGGCUACCAGCUCCUGCCGCUACCCUUCGAGGAACUGGAGUCCCAGAGAGGCCUGCCCCAGCUCAAGAGCUACCUGAGGCAGAAGCUCCAGGCCCUGGGCCUGCGCUGGGGGCCUGAAGGGGGCUGAGGGGUUGAUGUGGGGUUCAGGAUGGCCCCCCCAUGGGGGGUGGAUGAUUUGCACUUUGGUUCCCUGUGUUUUGAUUUCUCAUUAAAGUUCCUUUCCUUCCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-797.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -831.77
Frequency: 0.0000
Diversity: 402.54
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((..((((((.(((.((((((((((((((........((((((((((((.(((....))).))((((((((((((((..((.((.....))))..)).))..))))))))))......))))))).))).......))))....))))))).))).))).))))).)..))))))(((((((((((.(((.((((((((((.((((((.(((((...)))))))))))....(((((.((((((...(((...(((((((((((.((((.(((((((((.....))))))((((((((((((....(((((.....).)))))))))))))))).(((((...))))).......((((((((((((((.(((.......))))))))...((((...(((.(((.....((((((........)))))).(((...)))((((......)))).(((..((((....))))...)))....))).))).....))))...(((((.......)))))...))))))))).....((((.((....((((...))))...)).))))..))).))))....(((((....))))))))).))))))).)))...))))))))))).((((((((...)))).)))).(((((.(....).)))))..((((((.((((.....)))).......))))))....))))))))))..)))..))))..)))).)))...((((..((((((((.(....((((((((((((((((((((((.((((..((((.(((((((....)))))))..))))..))))...(((((((....))))))).((((((...(((((..(((((((((((((..(((((((.((((.(((((((((.....((.......)).....)))))...)))).(((..((.....))..))).(((((((((((((((((((((.((((.(((((..((((....)))).)))))))))...).)))))).)))))((((.(.(((((......((((((((((((((...............((((((((((((((.(((((((((((((...((...........((.((.((((((.((((((((((........(((.....((((.((.((((((...)))))).)...).)))).....))))))).)))....))).).))))))).)).))..))))))))..........)).)))))))))))...)))).))))))))))))))))......).)))).)))))..(((((....))).))(((((((.(.....)))))))).(((((.(...).)))))))))))))).))))...))))))).))).)))...)).)))))..(((((((....)))))))..)))))..(((((((((((.(((.............)))))))))))))).))))))......((((((....))))))...))))))))))).((((((((.((..(((.((((((((((((....(((....(((....))))))..))))))).))))).).))..)).))).))))).(((..(((((.(((............))).)))))...)))((((((((.(((....))).))))))))....))))).))))))).)))))))).))))....(((((((...)))))))(((.((...(.((((((((.....((......)).....)))))))).)...))..))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{(((((..{(((((.(((.((((((((((({((,.....{.((((((((((({,(((....))){||((((((((((,{,,.,({.,,..,}.,|||..}}.)),.)))))))))).}},..))))))).))).......}}},,,,,))))))).))).))).))))).}..)))))}...((((((((.(((.((((((((((.((((((.(((((...)))))))))))....(((((.((((((...(((...(((((((((((.((((.(((((((((.....))))))((((((((((((....{{(((.....)))}))))))))))))))...(((((({(((({,({{{{{{.,{{{{{(((((((((.......))))))))...{,,...,}}})}}})}.,}|||||}}.}}}}.})))),|{,{{.,.)),((((......)))).(((..((((....))))...}}},,..,,},,,,......},,...(((((({.{{{.(({.{.(((({...})))).}.})).)))....((({...)))).....)))))))))).))))....(((((....)))))))))}})))))).)))...))))))))))).((((((((...)))).)))).,{(({.({..,|,}}}}}.,(({({{.{{({.....))))......,))))))....))))))))))..)))..))))|.|))){((((((((((..((((((((.(....((((((((((((((((((((((.((((..((((.(((((((....))))))).,})))..))))...(((((((....))))))).((((((.,,({{((..(((((({((({{{.,((((({(.{{,,.||||{||||,|||,|||||..,,))..,,||||}},.,}}}),||{..{{,.{{.||,{|||.(((((((((((((((((((({.((((.(((((..((((....)))).)))))))))...).)))))).)))))((((.(.(((((......((((((((((((((...............{|{(((((((((((.(((((((((((((...((...........((.((.((((({,((((((((((.,,.,,..(({....,(({{....((((((...)))))).|...,.))}}.....}}}))))},)).,..}}}.).)))))}).)).)}..))))))))}.........}).)))))))))))...)))},},))))))))))))))......)}}))).)))))..{{(((....))).}}{((((((.{.....}))))))}.{((((,(...}.)))))))))))))).}))}..,)))))}).)})||)),..}}||}}}}..(((((((....))))))).,)))))..{((((((((((.(((..{..........)))))))))))))).))))))......((((((....))))))...))))))))))).((((((((.((..(({,((((((((((((..,,((({...,||.}}.,,)},...))))))).))))),).))..)).))).))))).{{(,,(((((.((({{....}}},..,}).)))))..,)))((((((((.(((....))).))))))))....))))).))))))).)))))))).))},..,.(((((((...))))))),{{,,{...((((...{{...}}.))))..,||}...,,},,..})))))))},,,....
Back