Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006721.4
Sequence Length
1992 nt
GC Content
0.3735
ACCAGAGAGUGGAUGGCAGAGGUGGGCUGUAGAGCCAAAGUGGGGUGGGAGCGCGAAGAUGGCAGCUGCUGAGGAGGAGCCGAAGCCCAAAAAGCUGAAGGUGGAGGCGCCGCAAGCGCUGAGAGAAAAUAUUCUCUUUGGAAUGGGAAAUCCUCUGCUUGACAUCUCUGCUGUAGUGGACAAAGAUUUCCUUGAUAAGUAUUCUCUGAAACCAAAUGACCAAAUCUUGGCUGAAGACAAACACAAGGAACUGUUUGAUGAACUUGUGAAAAAAUUCAAAGUCGAAUAUCAUGCUGGUGGCUCUACCCAGAAUUCAAUUAAAGUGGCUCAGUGGAUGAUUCAACAGCCACACAAAGCAGCAACAUUUUUUGGAUGCAUUGGGAUAGAUAAAUUUGGGGAGAUCCUGAAGAGAAAAGCUGCUGAAGCCCAUGUGGAUGCUCAUUACUACGAGCAGAAUGAGCAGCCAACAGGAACUUGUGCUGCAUGCAUCACUGGUGACAACAGGUCCCUCAUAGCUAAUCUUGCUGCUGCCAAUUGUUAUAAAAAGGAAAAACAUCUUGAUCUGGAGAAAAACUGGAUGUUGGUAGAAAAAGCAAGAGUUUGUUAUAUAGCAGGCUUUUUUCUUACAGUUUCCCCAGAGUCAGUAUUAAAGGUGGCUCACCAUGCUUCUGAAAACAACAGGAUUUUCACUUUGAAUCUAUCUGCACCGUUUAUUAGCCAGUUCUACAAGGAAUCAUUGAUGAAAGUUAUGCCUUAUGUUGAUAUACUUUUUGGAAAUGAGACAGAAGCUGCCACUUUUGCUAGAGAGCAAGGCUUUGAGACUAAAGACAUUAAAGAGAUAGCCAAAAAGACACAAGCCCUGCCAAAGAUGAACUCAAAGAGGCAGCGAAUCGUGAUCUUCACCCAAGGGAGAGAUGACACUAUAAUGGCUACAGAAAGUGAAGUCACUGCUUUUGCUGUCUUGGAUCAAGACCAGAAAGAAAUUAUUGAUACCAAUGGAGCUGGAGAUGCAUUUGUUGGAGGUUUUCUGUCUCAACUGGUCUCUGACAAGCCUCUGACUGAAUGUAUCCGUGCUGGCCACUAUGCAGCAAGCAUCAUAAUUAGACGGACUGGCUGCACCUUUCCUGAGAAGCCAGACUUCCACUGAUGGAAGAGCUGAAAACACAAGCCCAGGAGUGCAGACACUGCCCUAAUUGCUUCCUGAGAAUUCCCAUAUUAAUAAAGAAGAAAAUUAUCUGCCAUUUUUUCCUACUAUAAUAAUGCUGAAUCUUAAUUUAGAGGGUACAAGGGUAUGGUAAUGCUUGUAGAAUCUUUAUUAUCUCAACAAUCUAAAAAAUGAUGUUUAUUUCCAUAGUUUGAUAGUGCCACUUAAAUGCCAAUUAAACAAGAAUAUAACAUUUCAAUAGAAAUUUUUAUUUCAUUUUCAAUUACUUUGUAAAUUCGUGUGUAUUUAGUACACUGAUUUGUUUUUUUACAUUUCUGCUUUGAAUGCAGAUGCAAUUUAAUAUAAUAGAUUUUUUAAUGAAUUAAUCUUAACAUAGUAAUCUUUAGCUUUUUAUACAAAUAUAUUUAAUUUAGGAGUAUAUGUGUGUCUAUACACACACAUACAUAAAUAUACCACAUAUACACCUGAUAGUCAAAUAAGGUACAGAAAUUUUAUCUUGUCAAUUAUGCCAAAUAAUCUCUUUAAUGUGCACUCAAACAUGUAAUAAACUUUGGAUAAUUAAAUAAUGUGCCAAAUUUAAGUUGUACCACAAUAUUCAAAUCAUAGUCUUAUGGAACUCUGUAAUUGGACACAAACAAAAACUUGUCAUAUAGGAAUUUUUUUCUGUCUUUUCCCUGUGUACAGCAAACUGAGGAAGAAAGAUCAUUAUUUAAUACUGGGCCCUGAAAUGACACCCAAUUUGUUAAUGGAAUUAUGAAGAACAGCAAUAUAAUACACUGAAGAAUAACUUAGUAUCAGAGACCAAUAAAUCACUUUUUUAAGGAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-485.90 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -527.98
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.60
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((.((...((((((((((((((.....((((...(.(.((....)).).)...)))).(((.((....)).)))...))))))....(((...((((....))))...))).(.(((((((....))))))).)...........))))))))...))))))))..................(((((((.(((((((((((((..((((((......)).))))................(((((((.(((((((((..(((.....(((((((((.(((.(((.((((((.(......)))))............((((((..((.((....)).))))))))...............((((((((.((((.((............((((((((..(((((((((((((((((((....((.(((((.((((((((.((......)))))))))).)).))))).....((((.....))))....((.(((.....)))))..(((((...(((((((.((((((((..........((((......)))).((((((.......))))))))))))))....)))))))....))))).))))).))))))))))).)))))))))))((((((.(......).)))))).)))))).))))))))...)).))).)))))))))))).......))).))))))))).)))))))............((((((...((...((((((((((.(((((.....((((..((((((((((..(((....(((((....))))))))((((((.......((((((((((((((((((.............((((((.................))))).)....((.(((((..((...))..))))).)).......)))))......((((....)))).(((((...((((((...))))))..)))))....(((((....)))))(((((((((((((((((((((((((((...((((.............)))))))))))))).)))))))))...((((.........))))(((((((((..(((((..(.((((((...............)))))).((((((....)))))).(((.........))).((((((.((((............)))))))))).............((((((((((.((.((((((((((......((((.(((.....................)))))))......)))).))))))..)).)....)))))))))......)..)))))...))))))))).........(((((((.(.((.........))).)))))))..(((........)))....(((((....))))).......((((((.(((((((((((.(((((((((......((..(((......)))..))....))))))))).))).)))))........(((((..((....))..)))))..))).)))))).))))))))....................(((((.(((((((((.((.(((................))).))))))))))).))))).......((((((((.........))))))))...............)))))))))))))...)))))).......((((.(((((...(((....)))...))))))))).(((((...))))).............(((((((..((...((..(((........)))..))..))..))))))).....))))))))))))))..))))))))))...)))))...))...)))))).((((((.((((.............))))...)))))).............................(((((........))))).))))))).......)).))))..)))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,(((((((((.,,((((((((((((((....,|{{{...(.(.((....}).).}...}})).(((.((....}).}))}..}})))}....(((...((((....))))...))).{.(((((({....})))))).},....,,....))))))))...))))))))}}}|..............(((((({.{{((,,({((({{..{{{{,,,.,,...,.}))).,..,},.........(((((((.(((((((((.,(((.....(((((((((.(((.(((.,((((({(..,{{{|||||..,.,.......((((((..(({({....}).,))))))).....,,,,,..,..|{{|||||,{{,||||}.},,,.....,((((((((..(((((((((((((((((((.,,.((.(((((.((((((((.((......)))))))))).))},))))..|||((((.....)))}....((.(((.....)))))..(((((...(((((((.((((((((..........{(({......}))}.((((((.......))))))))))))))....)))))))....))))).)))))}})))))))))).)))))))))))|(((((.(......).)))))),))),)).}|||},,....)),))).))))))))))))......,))}.))))))))).))))))).,,,}},,,}.,{(((((...{{...((((((((((.(((((.....((((..{(((((((({..(((....(((((....)))))))){{((((,,,,...((((((((((((({((({....,.......,,(((((.....,,....},....))))).}....((.(((((..((...}),.))))).)).......})))},,,,..((((....)))).|||||}||{({(((...})}}}|.|||,,|,,,,(,(((.{,{|}}}|(((((((((((((((((((((((((((...{(((.............)))))))))))))).)))))))}}..{((((,,....,,|}}}}|{(((((({..{((({.,{.((((((....,......}.,.)))))).((((((....)))))).(((.........))).((((((,((({...,,,,.....,}))}))))),{,.,,,....,,((((((((({,({,(({{{{{{{{.,|,,,|{{{.{{{.,,|,,,,..,,,,.,|,,|.}}}|}}},,,{|,}||}.}}}})).,)),),...)))}}))))..,...,..}))}}...})))))))}.........((((({{.{,({.,.......)}}.}))))}}..(((.,.,,.{{|||....|||||...,))))).......((((((.((({(((((((,((((({{{|,,||,.((..(((......)))..}|||,.,}}}}}))),))).)))}},.......{((((..{,...,))..))))}..})).))))))})))))))),.,.........,,,,,...(((((.(((((((((.((.{{{................}}).))))))))))).)))))..,,.,,|||{||||,|}.,}}}})})))})),..,{{|..,..,,.)))))))))))))...},,,,,..,,,....,,.{{{{(,|,{{{....,,|||,}}}}}||,,,({{({.,,}}}}}..........,}}}}}}}|||.,,,||{{|.||||,||,,...,.....,}))}.,}}})}......})))))))))))))..))))))))))...)))))...}}...)))))}.,{{,,,.((((..,,,....,...))))..,})})},,|,.,{{{{,......,.,..,,,,,,..(((((........))))).))))))}.......,,,)))),,)}}}))}...
Back