Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_006837.3
Sequence Length
1296 nt
GC Content
0.4398
AGGUGUCAUGGCUGCCCCAAGAGUCUAGGUAAGAGUUUGUUCCCGUGGUGCGGAGGGUCAAGGCCCACACCCGGAAACCUAGCGAGGUAAAGUUGCGUCUUGGUUGUAGAGACGACAACUUCUCCGCUUCCUCGGCGAUGGCGGCGUCCGGGAGCGGUAUGGCCCAGAAAACCUGGGAACUGGCCAACAACAUGCAGGAAGCUCAGAGUAUCGAUGAAAUCUACAAAUACGACAAGAAACAGCAGCAAGAAAUCCUGGCGGCGAAGCCCUGGACUAAGGAUCACCAUUACUUUAAGUACUGCAAAAUCUCAGCAUUGGCUCUGCUGAAGAUGGUGAUGCAUGCCAGAUCGGGAGGCAACUUGGAAGUGAUGGGUCUGAUGCUAGGAAAGGUGGAUGGUGAAACCAUGAUCAUUAUGGACAGUUUUGCUUUGCCUGUGGAGGGCACUGAAACCCGAGUAAAUGCUCAGGCUGCUGCAUAUGAAUACAUGGCUGCAUACAUAGAAAAUGCAAAACAGGUUGGCCGCCUUGAAAAUGCAAUCGGGUGGUAUCAUAGCCACCCUGGCUAUGGCUGCUGGCUUUCUGGGAUUGAUGUUAGUACUCAGAUGCUCAAUCAGCAGUUCCAGGAACCAUUUGUAGCAGUGGUGAUUGAUCCAACAAGAACAAUAUCCGCAGGGAAAGUGAAUCUUGGCGCCUUUAGGACAUACCCAAAGGGCUACAAACCUCCUGAUGAAGGACCUUCUGAGUACCAGACUAUUCCACUUAAUAAAAUAGAAGAUUUUGGUGUACACUGCAAACAAUAUUAUGCCUUAGAAGUCUCAUAUUUCAAAUCCUCUUUGGAUCGCAAAUUGCUUGAGCUGUUGUGGAAUAAAUACUGGGUGAAUACGUUGAGUUCUUCUAGCUUGCUUACUAAUGCAGACUAUACCACUGGUCAGGUCUUUGAUUUGUCUGAAAAGUUAGAGCAGUCAGAAGCCCAGCUGGGACGAGGGAGUUUCAUGUUGGGUUUAGAAACGCAUGACCGAAAAUCAGAAGACAAACUUGCCAAAGCUACAAGAGACAGCUGUAAAACUACCAUAGAAGCUAUCCAUGGAUUGAUGUCUCAGGUUAUUAAGGAUAAACUGUUUAAUCAAAUUAACAUCUCUUAAACAGUCUCUGAGAAGUACUUUACCUGAAAGACAGUAUGAGAAAAAUAUUCAAGUAACACUUUAAAACCAGUUACCCAAAAUCUGAUUAGAAGUAUAAGGUGCUCUGAAGUGUCCUAAAUAUUAAUAUCCUGUAAUAAAGCUCUUUAAAAUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-375.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -400.43
Frequency: 0.0000
Diversity: 397.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((....)).)))..((((((.((((..((.((((((.(((..(((((.((((.(((...(((.(((((((........((((((.((((((((((((.......)))))).))))))..((((((((.((.((....)).))...)))))))).....(((((.....)))))....(((((((...((((((..((((..((((((........((((((...................((.((.....)).))(((((((((((((.(...((((..((((((((((((((..((((..(((((((((.......))))).)))).....))))((((.........)))))))).))))))))))))))...))))))((((.((.(((((((........)))))))...)).))))))))))))))))))(((........)))......)))))).)))).)))))).............(((((.........)))))......))))))))))))).........)))))))....((((((((...))))))))((((((((.((((((((((((.((((((((......)))).)).)).)))))))))))))))...))))).((((..((((.((......)).))))..)))).)))....))).)))).)))))....((......))...)))..))))))))))))....(((((((((.(((((((...(((((...........))))).(((((((((.(((.((((.........((((....((....((((((((.((((.(((....(((((.(((...)))...((((.((((((...........(((...(((((((..(((((.((((((((........))(((((..(((...)))..)))))((((((..(((((....)))))..))))))(((((((((((((((......)))))).)))))))))......(((........................)))..)))))).))))).)))).)))..))).)))))).))))))))).)))))))((((((((((((((..(((...(((((((((...............))))))))).)))....))))....))))))..))))))))))))....)).....))))...........))))))))))))))))..............))))))).)))).)))))...(((((........)))))..))))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,..{{.{(({{...,,,.,)}}),....{((((((((((((((.(((.....((((((..((({.,.((((((.{(({..,,}||}.((((((((((((.......)))))).))))))..{((((.{{....,,..})})),})))))).}.))).)))))).....)))))))))),(,,...,...,{((((((.((({{{{(({((..,....{{{,................,,{{,{(..,...{{{|{({{{{.,,|||(({{.,...({(({,((((((((((((((..,{({..(((((((((.......)))))},))),,}}.)}),{{((.....,,.,}))}})))}}}})))))))||}}|.,|))}}},.{((({{(((((,...||||,|}},}}},,}..,{.((((({((.(((((({{(((........)))((((....))))..{{((({(({,(((....|,|||,{((({.........)})))...},,|},.||||||,,|{.....,..}}|||}|||..((((((({...}))))))){(({{(((,{{((((((((((.{{,|{{{{,...,.}))).,,.)),)))))))))))},)),.})))))}||{(,.{(((.{{...,..}}.)}}}.}))))})).)))))))}.)}|{,,{(((((.((......)),)))))),.,,.,}}||||}}}..||||{{{{(,({{{{{|,,}||,{{,,,,,,.....,,||..(((((((((.(((.((((..........||{|,..,,,...((((((((,{{,,{(((....{||||.(({...}))...{(((,{(((((........,{{({{,..(({((((..{((((.((((((((........))|((((,.,,,..|)))}.||||{((((((,.(((((....})))).,}}}}},(((((((((((((((......)))))).)))))))))......}}.,}}},.....}},,,,},,...,,}},..}))))).))))}.)))),))}...}},))}))}.}))}})))).)))}}}}{(((((((((((((..(((...(((((((((...............))))))))).)))....}}}}....)))))}.,))))))))))))....,,.....)}},...........))))))))))))))))..,}}},..,....))))))),)))),}))))...,,,,....,}}}}))...)))))))}..........
Back