Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_007088.4

Sequence Length

1360 nt

GC Content

0.5522

AGCGCGAGUGCCAGAGCCCAGCCGGCGCGGAGCGGGAGCGGUGCAGGCUGAGGUCUCCGAGCGGCUCGCCAUGGCUGGCCCGCAGCAGCAGCCCCCUUACCUGCACCUGGCCGAGCUGACGGCGUCCCAGUUCCUGGAAAUAUGGAAGCACUUUGACGCAGACGGAAAUGGGUAUAUUGAAGGUAAAGAGCUAGAAAACUUUUUCCAAGAGCUGGAGAAGGCAAGGAAAGGCUCUGGCAUGAUGUCAAAGAGUGACAACUUUGGAGAAAAGAUGAAGGAGUUCAUGCAGAAGUAUGAUAAAAACUCAGAUGGGAAAAUCGAGAUGGCAGAGCUGGCGCAGAUCCUGCCAACCGAAGAGAACUUCCUUCUGUGCUUCAGGCAGCACGUGGGCUCCAGCGCCGAGUUUAUGGAGGCUUGGCGGAAGUACGACACAGACAGGAGUGGCUACAUCGAAGCCAAUGAGCUCAAGGGAUUCCUGUCAGACCUGCUGAAGAAGGCGAACCGGCCGUACGAUGAGCCCAAGCUCCAGGAAUACACCCAAACCAUACUACGGAUGUUUGACUUGAACGGGGAUGGCAAAUUGGGCCUCUCAGAGAUGUCCCGGAUAGAAGCGGCUACAUUGACGAGCAUGAGCUGGAUGCCCUUUUGAAGGAUCUGUACGAGAAAAACAAAAAGGAAAUGAAUAUUCAACAGCUCACCAACUACAGAAAGAGCGUCAUGUCCUUGGCAGAGGCAGGGAAGCUCUACCGCAAGGACCUGGAGAUUGUGCUCUGCAGCGAGCCCCCCAUGUAAAGUGGGGACGGGGGCUGCUUCUCCACCUCCCCCAAACCCUGCUUCUGCUGCCCUGAUGCGUCUACCCAGACUCAGAGACCGUGAGCGCCCCGCCCCCACCCCUACAGCCUGCACACACCUGCCUGCAGAGCAGGAAAUGAGAGAUAGAGGAUGGGCAGCUGGGGGGCUGUCCUGAGCCCCCUGCACCCACCCCUGCCCAGGCAGUCUUUGCUCAGUGGAUCACACACAUGGAAGGUGAUGGGGGCAUGGGUGGAGGGUCCCUAAUUCUCUUCGCUGUGAUGCAUGAGCUCCCUCGCUGUAUGAUUUAGGCUUCUAUGUCCAACAGAGUGGACUCUUCCCUCUCGCUCCCCUCUGCCGGUCCCCCAUGCCACCACCCACCCCAAACUUCCAGGUUCCAUCCACCACCUUGCCAAUGGUGUAGCUGUCCUCUCAGAACUCCUGUGUGUGGAAGGCACCCGCCCUUUCCUUGCCUUCUUUACUCGGCGUGCUCCUUUUCUCUUUGGGUUUCUUGUUUACCAAAGAAGAGUUUACAGACAAUAAAAUGGAAAGGUCCUGCUGUGGAAACUUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-484.80 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -507.34

Frequency: 0.0000

Diversity: 298.87

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((((((((.((((((((((.((((...((....)).)))).))))).)).))).).)).))))))....)))...(((((((((..(((.((......((((...((((((..(((...)))(((((((.((((((......(((.(((((((.((........)).))..........))))).))).........)))))).)))))))((((((((((((((((((((..(((....((..(((((....)))))...))....)))..)))))((((((....))))))......(((.(((......)))))).((((((.((((...))).).))))))...((((........))))((((((((.((.(((......)))))..((((((((((....)))))))))))))))))).((((.((((((((((((.......))))...........((((((((((((((.....))))....(((......))).......((((....)))))))))))...)))............(((.(((((...((...((((.(((((....(((((...(((((.......((((((((((.....(((...((((...(((((..((((((((((......(((.....)))......))))))...(((....)))(((((..................((((((.((....(((((((((((((...(((((((....))...))))).....((((......)))).((((((.....))))))..(((((.((......))...)))))...)))))))))))))))..))))))((((....))))..(((((....(.(..((((((((...((((((..(((((((.....(((((((..(.(((((..............((.((((..((.((((((((......)))))))))).)))))))))))))))))))....)))((((((.......))).))).))))..))))))...)))))).))..).)....)))))..)))))...)))).))))).))))....)))......))))))..))))...((((.(((....))))))).......)))))..)))))....))))))).))))...))))).))).((......))..((((........))))...(((......))).)))))))).))))...(((....))))))))))))))))))...))))))))))......(((((((((............)))))).)))(((....)))........))...))).))))))))).......

Thermodynamic Ensemble Prediction

{(((((((((((.((((((((((.((((...{{....}).)))).))))).)).))).).))}})))))....}}}...(((((((((.,({{.{{{{,{{,{(({...((({({,,(,{.{{|||{{(((((,{({{{{...,,,{{{.||{{|||,|{,.|,,...},,))....},..},)))}).))).........))))}}.|||}|||((((((((((((((((((((..(((..,.((..{({{{....}))))...,}....)))..))))}((((((....))))))......(((.(((......)))))).{(((((|,(((...))).}.})))))...((((.,,...}})))){(((((((.((.(((......)))))..((((((((({....)))))))))))))))))}.((((.((((((((((((,{,,.,.}||}...,.}},...((((((((((((((.....))))....(((......))).......((((....)))))))))))...)))............(((,({{{(,,,((...((((.(((((....(((((...(((((..{,...((((((((((.,,,,({{...{{((,..(((((,.,{{{((((((......(((.....)))......))))))...{{{....}}},||||}},.........,...|,((((((.(,....(((((((((((((..,((({{((....))...||}||.....{{{{..,.,.)))).((((((.....))))))..(((((.,(......}},..)))))...)))))))))))))}...})))))((({....})))..(((((....,,(,,((((((((,,,((((((..(((((((.....(((((((..{.(((((..............((.((((..((.((((((((......)))))))))).)))))))))))})))))))....))){{{(((.....,.)}).}),.))))..))))))...)))))).))),,.}....)))))..})))}}}.)))).))))).)))),}},)})......))))))}.}))).,,|(((.(((....}})}))},},,,..)))))..)))))....))))),}.))}....)}}}}.)))}||},.,,,))..{{{{........)))),,,||{......}}}.)))))))).))))...(((....)))))))))))))))))),,,)))))}}})).,,..{(((((((((............))))))),))|,,....,,,........)),,,))}.))))))))).......