Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_012116.4

Sequence Length

1576 nt

GC Content

0.6421

AUCCCAGCCGCACCGGUCCUUCCCGGCACACGCGAGGCUCCCAUGGCUCUGGCGGUGGCCCCGUGGGGGCGACAGUGGGAAGAGGCCCGCGCCCUGGGCCGGGCAGUCAGGAUGCUGCAGCGCCUAGAAGAGCAAUGCGUCGACCCCCGGCUGUCCGUGAGUCCCCCUUCGCUGCGGGACCUGCUGCCCCGCACAGCGCAGCUGCUUCGAGAGGUGGCCCAUUCUCGGCGGGCGGCCGGCGGAGGCGGCCCCGGGGGUCCCGGCGGCUCUGGGGACUUUCUACUCAUCUACCUGGCCAAUCUGGAGGCCAAGAGCAGGCAGGUGGCCGCGCUGCUGCCUCCCCGGGGCCGAAGGAGUGCCAACGACGAGCUCUUCCGGGCGGGCUCCAGACUCAGGCGACAGCUGGCCAAGCUGGCCAUCAUCUUCAGCCACAUGCACGCAGAGCUGCACGCACUCUUCCCCGGGGGAAAGUACUGUGGACACAUGUACCAGCUCACCAAGGCCCCCGCCCACACCUUCUGGAGGGAAAGUUGCGGAGCCCGGUGUGUGCUGCCCUGGGCUGAGUUUGAGUCCCUCCUGGGCACCUGCCACCCUGUGGAACCAGGCUGCACAGCCCUGGCCUUGCGCACCACCAUUGACCUCACCUGCAGCGGGCACGUGUCCAUCUUCGAGUUCGACGUCUUCACCAGGCUCUUUCAGCCAUGGCCAACACUCCUCAAGAACUGGCAGCUCCUGGCAGUCAACCACCCAGGCUACAUGGCCUUCCUCACCUAUGAUGAGGUCCAAGAGCGUCUGCAGGCCUGCAGGGACAAGCCAGGCAGUUACAUCUUCCGGCCCAGCUGUACUCGCCUGGGGCAGUGGGCCAUCGGCUAUGUGAGCUCAGAUGGCAGCAUCCUGCAGACCAUCCCUGCCAACAAACCCCUGUCCCAGGUGCUCCUGGAGGGACAGAAGGACGGCUUCUACCUCUACCCAGAUGGAAAGACCCACAACCCAGACCUGACUGAGCUCGGCCAGGCAGAACCCCAGCAGCGCAUCCACGUGUCAGAGGAGCAGCUGCAGCUCUACUGGGCCAUGGACUCCACAUUUGAGCUCUGCAAGAUCUGUGCUGAGAGCAACAAGGAUGUGAAGAUUGAGCCGUGCGGGCACCUGCUCUGCAGCUGCUGCCUGGCUGCCUGGCAGCACUCGGACAGCCAGACCUGCCCCUUCUGCCGCUGCGAGAUCAAGGGCUGGGAGGCCGUGAGUAUCUACCAGUUCCACGGUCAGGCUACUGCUGAGGACUCAGGGAACAGCAGUGACCAGGAAGGCAGGGAGUUGGAGCUGGGGCAGGUGCCCCUUUCGGCUCCUCCAUUGCCCCCACGGCCAGAUCUGCCCCCCAGGAAGCCCAGAAAUGCCCAGCCGAAAGUGAGACUCCUAAAGGGGAACUCCCCUCCAGCUGCGCUGGGACCCCAGGACCCUGCCCCGGCCUGAAGGCCAGGGCACCCAGAUGUGCUGCUCAAGGGAGCCCCAAGGGCUGGAAGGGGGUUGUGAAACCGAAAUAAACUGCCAAGCCUGGUCUGUCCUCCAGGGUGCAAAGGAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-683.30 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -709.77

Frequency: 0.0000

Diversity: 620.83

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.(((..........(((((((((((((....))...((((((((((....(((....))))))))))))).....))))))).)))).(((((((((((.((((((.((((.(.((((((((....((...((...((((((.....)))).))..))...))......)))))))).))))))))))).)).(((((((((((.......(((.(.(.((((.((((((((((((((.(...).)))))(((((...))))).((((((((((............(((...(((((........))))))))...(((((((((((((((((((((((((((((((....((((((((........((((((..((.(((((((..(((....(((..(((((.....))))))))....)))..))))...))).)).))))))....))))))))))))))))).....((((((((.((..(((...((((((...(((((((((((...((((...))))...(((((((((((..(((((.(((((((...(((((((((...((((((((.(((((((((((((...)))).....((((....))))..(((((.(((.((.......(((((((.((((((.((((...((.(((((((.(((...((.((.((..(((((((.....)))).)))..)).)))))))))))..))))))))))).))))..........(((((....)))))...(((....)))))))))).......)).)))))))).((((((.....(((((((((.(((.((........)).)))))).))))))(((((.((((((((((((.....))))..)))))).(((...))).......))))))).......))))))..))))))).)).))))))))(((((.....)))))...(((..((....))..))).........(((......)))))))))))).))))).......(((((((.(((.(......).))))).))))).((((....))))(((((.((((((((((..((((((((.......)))..))))).....)))))))......)))))))))).))))).)))))))))))((((((.((...)).)))))).((((..((((((((.........))))..)))))))).....)))).))).))))))))))...)))..))))))))))(((....)))((((....))))))..))))))))....((..((((((((...(((((((((((....)))))....))))))))).))))).)).))))))..))))))))))))..)))).......)))).))))).)))).).).)))..(((((....))))).)))))))))))((((.(((((.((((((((.((((....)))).))))..((((...((..((((....))))..))....)))).))))((((....))))................)))))...)))).)))))))))...))).

Thermodynamic Ensemble Prediction

.,{{..........(((((((((({{(...,||,..((((((((((....(((....)))))))))))))..,..})))))).)))).((((((((((,.(((((((((((.,(((((((,((((.(((((((....(((((.,({{(((((((((({{,({{((,{..,|,,|{|||}}||(({({,|,||.,,||||}||||,..{{{{((|.,...,.}})))})))))))))))).)).,,|(((((((((({.,,|{{{(((..{(|({.|,..,,.,,..,{{.,.(((((........)))))})},.,||{|}|||||},}}||))))}}}))))))))))}..((,,,,|}..}}}}},||||}}}.|}|}((((({{,{{....(((,,.{(,(((((,...)))))}...,},...)))...|||{,|{,,.))))},.|||||,|{||||{{|||...{{{{.((({,,.},,))}),.,{,,,,...,,|}|||},{{,..,,...,)).)))},}}}})}))))))}(((((((((.(((..((((((((((((.{((((....{(((....}}}.,...}.))}.|))))))...)))))).)))...))))),,)))..,,....,..})))))}{(((..,||}|}.{({(.(((...({.((.,,..(((((((.....)))).)))..,,.)))))))}})},,{(|{(({{{|||{|,||{..,,...{({(((.,.,(({((((,(((.....},,)))).,,,.)))}}}||||,}}}})),,)))}}..)))}||{|||,...{(({(((((((,({{{,.,.{(((((((((((.((((((((((((.....)))}..)))))}..,....,|{{{.......}})).......})})))))))))))|{{{((((,(((.{(((,{...{{|||||.,||||....}),|||...,.,)},...(((((.(((..,(({.{{{|,,,.||{{{{,.....(((((((.{{,.,,,,,..}.|}|{|{|||||,((((....))))(((((.((((((((((,.(((({(((.......})).,))))).....}))))))......)))))))).((((,.{,||||}}}||}||||,|({(({{{||,||,,,..}}})).}})))))..}})}|..})))))),,,,)))).})}.))})}))).(((((((.,.........,{{({.,{({(,,({{.{{|(((,...,,,,,},..}))))))),)).}}},(((({((({,,(((({{(((((....)))))...}))))))))).})))).,)})))))...))))})},))))),.}}.,......}},}}))},,.,|}}.}.,,}},..,((((..{{|||}|.||||,||||||((.{,...|}.,,,(((((.((((....)))).)))))}}}}}.,)))),)}}...)))}}}}})..))))))))))}}((((....)))).......,}}}))...))))).})))))})))))))))...)),.