Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014380.3
Sequence Length
1127 nt
GC Content
0.4623
CUAAGUGUCUCCGCGGCGCACCUCGCGGCGAGAAUCCGGAGGAGAAGGAGACUGCAAGGAUAGGCCCAGGUCGGUGCGAGGGACGGUGGUGGGGCGGGGGUCGGAACGUAAGGAAAGCCCAGUCUGAGACCCCAACCCCCUCCACCCCAUCCCCCACUCCUAUACCGGUCCUCCAUUUUGGUGCCUGCAAAGCUCUGGGAAAGAAUCCCGGGAAACGAAAAAUGGUGGGUUUGGGGGAAGGGAGGUAAGGGGAGAAAGCUGGAGGGAGGGGCUUUAAUUGGAGGCCCCGUAGAGGACGCGCGGAACUUCUAAGGUGGGAAAAAACGAAAUUAAAAAAUCCUUUGAUAUCAGGGCUCUGAAUCCUGCUGGUCAGAGCACCAAGCAUUCAGUCUCUCUCCUUGCCUUUGUCUUACUUGUGUUCAAAGAAAAACAACCAGAAAAAAAAAAUCUCAUCAUGGCAAAUAUUCACCAGGAAAACGAAGAGAUGGAGCAGCCUAUGCAGAAUGGAGAGGAAGACCGCCCUUUGGGAGGAGGUGAAGGCCACCAGCCUGCAGGAAAUCGACGGGGACAGGCUCGCCGACUUGCCCCUAAUUUUCGAUGGGCCAUACCCAAUAGGCAGAUCAAUGAUGGGAUGGGUGGAGAUGGAGAUGAUAUGGAAAUAUUCAUGGAGGAGAUGAGAGAAAUCAGAAGAAAACUUAGGGAGCUGCAGUUGAGGAAUUGUCUGCGUAUCCUUAUGGGGGAGCUCUCUAAUCACCAUGACCAUCAUGAUGAAUUUUGCCUUAUGCCUUGACUCCUGCCAUUUAUCAUGAGAUUAAUACUGUGAUUCCCGCUGUUUUCUUUUUCCUUGCAUUUUCCUAAUAUGCCUUUACUGAUCCGUUUGCUGUGAACCCUAUGUUAUUUCCAUGUGUCAAGUGGGUCUUGUGUUGCCAGCUUCUAUUUGAAGAUUGCCUUUGCACUCAGUGUAAGUUUCUGUCAGCAGUAGUUUCACCCAUUUGCAUGGAAAAAUUUAAAGCUAAUAAAGCAAUUUAAAAAGCAAUCUAUACAUUUAUUGUCUCAUUAAAAAUGUAUACUUACAUAUAACAGAUGAACUAAAAAAAAAUCUGAGAUUAAAUACACUAGAGUGUUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-343.20 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -366.47
Frequency: 0.0000
Diversity: 275.18
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((.....)))))...((((((((((.(((.(((((...((((((.((((((((((((..((((((((((.(.((((.(((((.((((..((((((...((....((....))..))....))))))..))))..)))))...)))).).((((((...(((((((((((((((..(.((((....((((((((.....))))(((((.......(((((((((((((((((..(((((((((((((((..((((((....((((((((.....)))))))).((((((..........))))))..((........))((.((((((......)))))).)).(((((((((..((....))))))))).)).....)))))).))))))))))))))).))))..((((.(((...)))..)))))))))..........))))))))........))).))..........)))).....)))).)....)))))))))).....))))).....))))))..((((.....))))(((((((.(........)...).))))))))))))))))..))))......(((..(((..........)))..))).(((((((.((((..((((.(.(((...(((.(((((...((((((.((..(((.(.((..............((((((((((.(...((((((............))))))....).)))))))))))).))))..)).)))))).....))).)).)))..))).)))))..)))))))))))((((.....((.(((.....))).))..))))..)))))))).))))))......)))))...)))...))))))))))....(((((..((((((((...(((((((((((..(((((.(((((((.....))))......(((((((...)))))))...))).)))))..))....)))))))))))))))))..(((((((((.....)))..))))))........(((((((((.(((......))))))))))))...)))))...(((((.............)))))......(((((......)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{,{(((((((((((.((.((((.(.(((....((((,.{(.,,.......)).}..))))..)))})))))).)))).)))))(((((.((((..(((((({{,,{....((....))..})}}..))))))..))))..)))))((.(((((((..(((,,,{{(((((.,,.....)).))).{{...,}(((((((.....))))))}...........})))))..))))))).))((((((((((((((..((((((.,..((((((((.....)))))))).((((((.{.....,..)))))}..{{........,}{{.((((({......)))))).}).(((((((((..((....))))))))).))...}.)))))).)))))))))))))},,{,{,.,{({{.,,,...},,..))),..,},.......,{{{{{,{((((((({{{..{{,..{({{{{,.{{{{{{,,{({({({,,,{({{{{.,,||{((((,,{{{.{{},,,{((.(((({{(.(((((.....(((({..((((((....((((.((((.,,...},)))))))),.))))))..}})))....,,,.,.((((((((({(((((((....(((({...,....,{,{(((,,..},,}}))},......,({,......)),.........((((((((((.(...((((((..,,....},..))))))....).)))))))))},))))....))))))),.))}..))))))}.,,))))).)))))).)))...{(({{.,|,,.....}}})))}....)),))))))))))))})))}}|,},,,,...,},},},,..}}},..)))))))))))......,||,.((((((((,..(((((((((((..(((((.(((((((.....))))......{((((((...)))))))...))).)))))..))....))))))))))))))))}..,{{{{,(((.....)))..})))},.,,,....(((((((((.{{(......}}})))))))))..,,,,,....{((((.............)))))}}}}}..,,{{||,...}))},..
Back