Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014430.4
Sequence Length
2307 nt
GC Content
0.5947
CCCUUCCGGUGGAGCCAGCGCUGCGACCGCCUGCAGAAGGUUGACUGCGUGGUAGGGGGCCCAGAGCAAGCCGAAGGCAAGCACGAUGGCGCUCACCAGCCGGCCCACCCGCGCCCCGUGCCGCCCGGAGCCCCAGCGGGCGCCCCGCAGCCGUGCCAGCGUCACGCUGUAGCAGCCGAGCAUCAGCCCGAAAGGAAGCACGAAAGCGGUCAGAGUCUCCAGGCUCAGGUGGGCGGCGGCGUGGACCGGCGACGGGUGGCACAGCUGGCAUACGCGGUCCCUCCACAGGUGGCGGUAGACGGCGGCCGGGACGGCGAGCAACAGGGCGGCCAGCCAGACCGCCAGCAGCAGGCGGCGGGCCAGGGCCGGGCUGCGCAGCCGAGGCGCCAGGAAGGGGCGGGUGACUGCGAGGCAGCGCUGCAGGCUGAGCAGGCCGGUGAGCAGCACGCUGGCGUACAUGCUGAGCGCGCACACGUAGUACACCGCCUUGCAGCCCGCCUGGCCCAGCGGCCAGGCCUGCCGGGUCAGGAAGGCCACAAAGAGCGGCGUGAGCAGCAGCACCGCGCCGUCGGCCAGCGCCAGGUGCAGCACAAGCGUGGCCGCCAGCGGUCGCCCCCGUGCAGGCCGCCAGCCCGCCAAGCUCCACACCACGAAGCCGUUGCCAGGCAGCCCCAGCAGCGCCGCCAGCAGCAGGAAGGCUGUGCCUGUGGCCCGCGAAGUCUUCCAGCUCAGCAGUGUCUCGUUCCCUGGGGGACGGUAGCAGACCGACAUCCUUCUGGGCCUACAGGACACAGAAAAAAAGUGGGGAAGCUGGGGGACCCUACAAGGAUCCUUGGCAGGAAAGCAGGGAUUGUGUUCAUUUGAGGGUUUCACUGUCAGUGAGAGUCUCAGCUUCCAUGCAACUGUCCAUCACGGCUGCAACUGAAAUCAGAGCUGGGACACAGCGCACCAGAAGCUAAAGUCUUGAUGCCAUCAAAGGACAUCCCUGCCCCAUUCACAUCUCUGUCACGUCCACUAAUCGGCAAAAGGAGAAAAGUGAGAGAAGAUGACCUAAGUGUGACUGCAGCAGGCAGCUCUGGAAAAUGAAGCCAGAGCAGUGAGCCAGCCCCUCCUCCGACCAAGGAGGAAGGAAAGAGCAGCCCCAGCACAGGAGAGAACCACCCAGCCCAGAAGUUCCAGGGAAGGAACUCUCCGGUCCACCAUGGAGUACCUCUCAGCUCUGAACCCCAGUGACUUACUCAGGUCAGUAUCUAAUAUAAGCUCGGAGUUUGGACGGAGGGUCUGGACCUCAGCUCCACCACCCCAGCGACCUUUCCGUGUCUGUGAUCACAAGCGGACCAUCCGGAAAGGCCUGACAGCUGCCACCCGCCAGGAGCUGCUAGCCAAAGCAUUGGAGACCCUACUGCUGAAUGGAGUGCUAACCCUGGUGCUAGAGGAGGAUGGAACUGCAGUGGACAGUGAGGACUUCUUCCAGCUGCUGGAGGAUGACACGUGCCUGAUGGUGUUGCAGUCUGGUCAGAGCUGGAGCCCUACAAGGAGUGGAGUGCUGUCAUAUGGCCUGGGACGGGAGAGGCCCAAGCACAGCAAGGACAUCGCCCGAUUCACCUUUGACGUGUACAAGCAAAACCCUCGAGACCUCUUUGGCAGCCUGAAUGUCAAAGCCACAUUCUACGGGCUCUACUCUAUGAGUUGUGACUUUCAAGGACUUGGCCCAAAGAAAGUACUCAGGGAGCUCCUUCGUUGGACCUCCACACUGCUGCAAGGCCUGGGCCAUAUGUUGCUGGGAAUUUCCUCCACCCUUCGUCAUGCAGUGGAGGGGGCUGAGCAGUGGCAGCAGAAGGGCCGCCUCCAUUCCUACUAAGGGGCUCUGAGCUUCUGCCCCCAGAAUCAUUCCAACCGACCCACUGCAAAGACUAUGACAGCAUCAAAUUUCAGGACCUGCAGACAGUACAGGCUAGAUAACCCACCCAAUUUCCCCACUGUCCUCUGAUCCCCUCGUGACAGAACCUUUCAGCAUAACGCCUCACAUCCCAAGUCUAUACCCUUACCUGAAGAAUGCUGUUCUUUCCUAGCCACCUUUCUGGCCUCCCACUUGCCCUGAAAGGCCAAGAUCAAGAUGUCCCCCAGGCAUCUUGAUCCCAGCCUGACUGCUGCUACAUCUAAUCCCCUACCAAUGCCUCCUGUCCCUAAACUCCCCAGCAUACUGAUGACAGCCCUCUCUGACUUUACCUUGAGAUCUGUCUUCAUACCCUUCCCCUCAAACUAACAAAAACAUUUCCAAUAAAAAUAUCAAAUAUUUACCACUAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-917.30 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -952.44
Frequency: 0.0000
Diversity: 380.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......(((((.(((..((((((..(((((((..((.((..(((((((((((.(((.(((..(.((..(((...)))..)).)...))).)))))).((((((((((((((((((((((((((((((.((..((((((((((...(((....)))..))))).)))))..))..))).......(((((...((..((......))..)).(((((....)))))...)))))))))))))))...)))).)))))))....))))))..))))))))))))..)))))))..)))).))..))).(((((((.(((((..(((((((((.(((.(.(((((.......)))))).)))...)))))(((.((((.((....((.((.....)).))(((.(.((((..(((((((((...((((..((.(((.((((.((.(((((..((((.((.(((((.(((.((.(((((..(((.(((((((...(((..((((((((.(((((...))).)).))))))))..)))....))).)))).)))....((.(((((((((.(.....).))))..))))).))....)))))))))))))))))))))..)))))..)))))).))).))..))))...........)).)))))))..)))))))).)).)))).)))((((((((..((((((..(((.(((((((.(.(((.(((((..((((((((((((((((((.(((.((..((((((............(((((.(((....)).).))))).....(((((((.((((((((((((((((..((((((((.........)))))))).))).....(((((.(((((((...))))))).)))))((......))..(((((((....((((((..(((....))).(((((..((((((.........)))........((((((......)).))))(((((..((.((((((....((((..((((((..((..(....)..))..)))).)).....))))....)))))).))..)))))..(((((((.........))))))).)))..)))))((.((((((......)))))).)).....))))))........((((((..((.((((((......)))...)))..))..))))))(.((((...)))).)..((((.((((((((.((..((((...))))..))))))...........)))).))))..)))))))))))))....)))))))))).))))..(((.(.((((((((.((((((........))))))....))))))))))))...))))))..)).))))))))((((......))))...)))))...)))))))).))))).)))...).))).)))).)))((((.(((((.(((..((((((((.(((..((((((((...)))))))).(((((..........)))))...((((((((((((.((((((((....((((((((.(((((((((...((..((((.((((.((.(.((..((...))..)).).)).)))).))))))..))))).))))....................((((((((.......)))))))))))).))))..)))))))))))).(((((....((((((..((.......))...))))))))))).((((.(((......))).))))..(((((((((.((((((((..((.((.((((((((......))).......(((.((((((((.(((((.(((....(((..(((((((((((.(((............))))))))).....)))))..)))...))).)))..))...))))))))..))).....))))).)).)))))))).))))))).))))...)))))))).............))).))))))))((((.(((....).))))))...((((((...........((.......))............))))))..))).))))).)))).....((((((.(((.........)))..))))))....((((((((((((.....)))))))))))).))))))..))))))))..........)))).....)).)))))))))).................(((.(((((...((((............)))).))))).)))......................................((((((...)))))).)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......(((((.(((..((((((..(((((((..(,{((..(((((((((((.(((.(((..{.((..(((...)))..)).}...))).)))))).((((((((((((((((((((((((((((((.((((....)))).))((((...(((((,,{{{,,.}||||..{{..,.,.}}..,.}}{{,...}}..)))))...)))).,.(((((....)))))....))))))))}))}))...)))).)))))))....))))))..))))))))))))..)))))))..)))).))..))).(((((((.((((,..(((((((((.(((.(.(((((.......)))))).)))...)))))(((,|{{{.||,(,(((({{.((.{({(({(((((.{{{{..(((.((((({{.((((,.((.(((.((((.((.(((((..((((.((.(((((.(((.((.(((((..(((.((((((({..(((..((((((((.(((((...))).)).))))))))..)))..},))).)))).))}....((.(((((((((.{.....,.))))..))))).))....)))))))))))))))))))))..)))))..)))))).))).))..}))}.........,..}}},}},}}.}))}))).}.)),)))).)))((((((((..((((((..(((.(((((((.(.(((.(((((..(((((((((((((((({(((((.((..((((((............(((((,,((....)).).))))).....((((((,{(((((((((((((,({{.((((((({{(......})))))))).)}}.....(((((.(((((({...))))))).)))))((......))..(((((((....((((((..(((....))).(((((..((((((.........)))....,,..((((((......)).))))(((((..((.((((((.,..((((,.((((((..((..,....,,,}}..)))).))...,.))))....)))))).))..)))))..(((((((.........))))))).)))..))))){(,((((((......)))))).)).....))))))........((((((..((.(((,{(,.....},,...)))..))..)))))){,{(({...}))}.,..{(({.((((((({.{,..{{(({{,|,,,.,)))))}...........)))).))))..)))))))))))))....)))))))))).))))..(((.(.((((((((.((((((........))))))....))))))))))))...))))))..)).))))))))((((......))))...)))))...)))))))).))))).)))...}.))).)))).)))((((.(((((.(((..((((((((.(((,.((((((((...)))))))).}...,..(((((.((.(((((((((((((.(((((((((((((((...((((((((((.((...(((((((((((((.{(((.,,.{|{{..(({{.,|{{||..,||.,,,)},...|}||}}..}}}}....||....|||{.(((((.(((((((({(((((((.((((.((((.{.......}))))..{(((...)))).,)))).))),,)).)}..)})))))))..)).)))}}((((.(((......))).)))).,.,|,,,...})}))))))))))))),((((.((..,(((((((((.,........}..)))))))))})).))))|,(((..|....,.))))))))))))))).....)))))))).)))}})))...)))))..................{((,{{{....{|{...,))}....}}}}})}..))))}}})).)))))))..}...............))).))))))))((((.((,....}.))))))...{(((((...........,,.......},............))))))..))).))))).)))).....{{{{{{.(((,........}}}..)}})))....((((((((((((.....)))))))))))).))))))..)))))))).,,,,,...,)))).,,..))))))}})))))...........,.....(((.(((((...((((............)))).))))).)))......................................{(((({...}))))).)))))..
Back