Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014808.4
Sequence Length
4009 nt
GC Content
0.5503
AGUUGGGAGCAGGCGACGCCGACGCGAGUCUGGCGGCUGCUGCUUGCGACUGCGGAGGCCGGGCGAGGCCGGUGAGGACGCGGCGGGCGAGCGAGAGGCCGAGGUGUUUUCUUCACUCAUGGUGAAGAAUGGGGGAGAUAGAAGGAACAUACAGAGUCCUGCAGACUGCAGGGAUGCGCUUGGGUGCCCAGACCCCUGUGGGAGUUAGCACCCUUGAGCCUGGGCAGACUCUCUUGCCCAGAAUGCAAGAGAAGCACCUGCACCUCAGAGUAAAGCUGCUGGACAACACCAUGGAAAUAUUUGACAUUGAGCCUAAAUGCGAUGGCCAGGUAUUACUGACACAAGUGUGGAAGCGUUUAAACCUGGUAGAAUGUGACUACUUCGGGAUGGAGUUUCAAAAUACUCAGUCCUACUGGAUUUGGCUUGAACCUAUGAAACCCAUCAUUAGGCAAAUACGAAGGCCAAAGAAUGUGGUGCUUCGCCUAGCUGUAAAAUUUUUUCCACCUGAUCCUGGUCAGCUACAAGAAGAAUAUACAAGAUACUUGUUUGCCUUGCAACUUAAGAGAGACCUGCUGGAAGAGCGUUUGACCUGUGCUGACACCACAGCGGCCCUUCUCACGUCCCAUCUCCUGCAGUCGGAAAUAGGAGAUUACGAUGAAACGCUGGACCGAGAGCACCUCAAAGUGAACGAGUAUUUGCCUGGCCAGCAGCACUGCCUUGAGAAGAUACUAGAAUUCCAUCAGAAGCACGUGGGCCAGACACCUGCUGAGUCGGAUUUCCAGGUGCUCGAAAUUGCUCGAAAGUUGGAAAUGUACGGCAUCAGAUUUCACAUGGCUUCUGACAGGGAAGGAACCAAGAUUCAACUGGCAGUUUCCCACAUGGGUGUACUCGUGUUCCAGGGCACCACCAAAAUCAACACUUUCAACUGGUCCAAGGUCCGUAAACUAAGCUUCAAGAGGAAAAGAUUUCUUAUCAAACUUCAUCCAGAGGUUCAUGGACCUUACCAGGACACAUUAGAAUUUUUGUUGGGUAGUAGAGAUGAAUGUAAGAACUUCUGGAAGAUUUGUGUGGAGUAUCACACCUUUUUUAGACUUUUGGACCAACCUAAGCCAAAAGCAAAAGCCGUCUUCUUCAGCCGGGGCUCCUCCUUCAGAUACAGUGGAAGAACUCAGAAACAACUAGUAGAUUAUUUCAAAGACAGUGGAAUGAAGAGAAUUCCAUAUGAAAGAAGGCACAGCAAGACCCACACGUCCGUUCGAGCUCUGACUGCAGACCUACCAAAACAGAGCAUCUCAUUCCCCGAGGGAUUGAGGACUCCUGCCUCCCCAUCUUCAGCGAAUGCCUUUUACUCGCUCUCUCCCUCCACUCUGGUCCCCUCUGGCCUGCCAGAGUUUAAGGACAGCAGCAGCUCCCUCACAGAUCCCCAGGUUUCCUACGUCAAGAGUCCAGCUGCAGAGAGGCGCAGUGGAGCAGUGGCUGGAGGCCCCGACACACCAUCGGCCCAGCCCCUCGGGCCCCCCGCACUCCAGCCUGGUCCAGGCCUUUCCACGAAGAGUCCUCAGCCUUCUCCCUCCAGCCGGAAGAGCCCCCUGAGUCUGAGCCCUGCAUUUCAGGUGCCUUUGGGCCCAGCUGAACAGGGCUCAUCCCCACUCCUGAGCCCUGUCCUCAGUGAUGCUGGCGGAGCCGGGAUGGACUGCGAGGAGCCCAGACACAAGCGCGUGCCUGCAGACGAGGCCUACUUCAUAGUCAAAGAGAUUCUCGCUACAGAACGAACAUACCUCAAGGAUUUAGAAGUUAUUACCGUGUGGUUCCGCAGCGCAGUGGUGAAGGAGGACGCCAUGCCUGCGACUCUGAUGACGCUGCUCUUCUCCAACAUCGAUCCCAUCUAUGAGUUCCACAGAGGCUUCCUGCGCGAGGUGGAGCAGAGGCUGGCACUCUGGGAAGGGCCCUCCAAAGCCCACACAAAAGGCAGUCAUCAACGAAUCGGGGACAUCCUGCUCAGGAACAUGCGCCAGUUAAAGGAGUUUACCAGCUACUUCCAAAGACAUGACGAGGUCCUAACAGAACUGGAAAAGGCUACCAAACGCUGUAAGAAGUUGGAGGCAGUGUACAAGGAGUUUGAGCUGCAGAAGGUCUGCUACUUGCCUCUCAACACGUUCCUGCUGAAGCCCAUCCAGCGGCUGCUGCACUACCGCCUGCUGCUGCGCCGCCUAUGCGGACAUUACAGCCCCGGGCACCAUGACUACGCUGACUGCCAUGACGCCCUGAAAGCCAUCACAGAGGUGACCACCACACUACAGCACAUUCUCAUCCGGCUGGAGAACCUGCAGAAGCUAACGGAGCUGCAGCGGGACCUGGUGGGCAUAGAGAACCUCAUUGCUCCUGGCAGGGAGUUCAUCCGUGAGGGCUGCCUUCACAAGCUCACCAAGAAGGGCCUGCAGCAGAGGAUGUUUUUUCUGUUCUCAGAUAUGUUGCUGUACACAAGCAAAGGAGUUGCAGGGACCAGCCACUUCCGGAUCCGGGGCCUCCUUCCCCUCCAAGGCAUGCUGGUGGAAGAAAGUGAUAACGAGUGGUCUGUUCCACACUGUUUCACCAUCUACGCGGCUCAGAAAACAAUCGUGGUGGCAGCCAGCACUCGGCUGGAGAAAGAGAAGUGGAUGCUGGACCUGAACUCCGCGAUCCAAGCAGCCAAGAGUGGCGGUGACACGGCCCCUGCACUGCCAGGCCGCACUGUGUGCACUCGUCCCCCCAGAUCCCCCAACGAGGUAUCUCUGGAGCAGGAGUCAGAAGAUGAUGCUCGGGGUGUCCGCAGCUCCCUGGAGGGGCAUGGCCAGCACCGGGCCAACACCACAAUGCACGUGUGCUGGUACCGGAACACCAGCGUGUCCAGGGCAGACCACAGUGCAGCUGUCGAGAACCAGCUUUCAGGAUAUCUGCUAAGAAAGUUCAAAAACAGUCAUGGCUGGCAGAAGCUCUGGGUCGUCUUUACCAACUUCUGUUUGUUCUUCUACAAAACUCAUCAGGAUGACUACCCACUGGCCAGCCUCCCGCUGCUGGGCUACAGCGUGAGCAUCCCCAGGGAGGCCGAUGGCAUACACAAAGACUAUGUUUUCAAGCUCCAGUUCAAAUCCCACGUCUACUUCUUCCGGGCUGAGAGCAAGUACACAUUUGAAAGGUGGAUGGAGGUGAUCCAGGGGGCCAGCAGCUCAGCCGGGAGGGCCCCAAGCAUCGUGCAGGAUGGCCCCCAACCCUCCUCAGGGCUGGAGGGGAUGGUCAGGGGGAAGGAGGAAUGACGCUCAACCUGCCCAGGUUUGGACACAACUACAAAGAACAGCAGGACACAGAGGUGACCUCUGUCCUGAGGCUUCUCAACAGAUGGGAAGUGGCUGUGGUCUCACUGGAUCCCCACUGGCACCAGCAGUGUGGGUGGGCCUCAUGUAACAUCUGGGAGGGGCUUCAUCCCCCCACCCAGGACCUAGUGCAUGCCAGCAGCUAUCUGGGGCCCUGGGAAAAAUGUGCGAGUCUUGAGCGCGGAGCCGCUCAAGCCACAGCUCCCAGGCCCCUGGCUCAAAGACGCAGACAAGGCCUGAGCAGUGCUCUCGGCAUCGGACCAAAGCCUGGGCACACCCUGCCUCUCUCCCCAGAGCAGGGUCCCUGCCGAGGACUGGCCUAGAGCAAGCACUGGAAAAGAGGCCCUGCCAUACACCCUGCGUACCCACUGCCAGGACCCUCUCAGACAAGCGUGGCACAGCCAUGCUGACCUUCCAUCUGGUGAACCAAGUGGCAGCCCCAGGGGCCUGCCCUGCAGGUCACAGCUAAACAAGUCUGGCAGAAGCCACGCUUGUUCCCCAUGUACCUCUAGAGAAGCAGAAACCAAAGUCCCCCUGUGCCCUGGGAGGGUGGGGCCGUCUAAUUUAUUACUGCCCAGCAUUCCUUCCAACGGGAAGUAGAUGGGCGACUGCUUUGUUCACACACAUUUGAUUAAAAAUAAACAAACAGCAUCUCCCCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1470.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1540.88
Frequency: 0.0000
Diversity: 856.06
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((((..(.(((((((....))).)))).)..)))))).)))))..(((((..((((..((((((((.((((((..(((.(........).)))..))))..((((((((...))))))))(((((.....((((((.((((.(((((((((((((...)))))))..((.(..((((((...((((((...))).))).))))))..).))((((((((......))))))))..((((.(........))))).(((..(((..((.((((((....((((((((......(((...(((((((.....(((...(((((((.(((((..(((....)))..))....)))))))))).(((.((....)))))..(((((.((((((......((((.((..........)).)))).....))))))))))).((((((((((((...(..((.....((.(((((((((.(((((........((((((...(((((....)))))......))))))...(((((...)))))((((...)))).....(((((..((((((....((((.........)))).......))))))..).)))).((((..((((((((..........))))))))...))))....)))))..))).)))))).))...))..)..))))))))))))(((.(((((.(((((((.((................((((((((.((((...(((....)))((((((((.((((((((.(..((((......)))).).))))))))...)))).))))......))))))))))))..((((((((.((..(((((....(((((...(((.((((((((.((((.(...(((((((((((.(((((.............(((((..(((((((((.((((...((....((((....(((.....)))...))))....)).)))).)))))))))))))).............))))).)))......((((((............(((((((((...(((((......))))).)))))))))(((((((.(........)))))))).......)))))).((((((.(((((((.(((............))).))(((.((......))))).((.....)).......(((((((.......)))))))......(((((((.((((.((((.....((..(((((((((((...((((..............(((..(((((.((((...)))).))))).)))((((((((...(((((((((...(((((((....(((((.(((....((((((((.((....))...))))))))....))).)).))).(((((.((.(((.(((((.((((((((((((((.(((..((((((..(((((((.(..((((.((..((((((((((..............(((((........)))))....)).)))))))))).))))))))))))...((((.((.....))))))........(((.((((.((..((((((..((.......)).)))))).)))))).))).)))))).((((((((((..........)))))))))).)))..))))).))).)))))).))..)))))).)))))))..........(((((((((((((.(((.(....(((((..((((...(((....(((........)))......)))...))))..))))).....)))).))....(((((.(((.(((((........)))))))))))))....(((((((..(((.(((......(((.(((...))).)))..((((.((((((((.(((..((........))..)))..))).)))))))))((((........))))......)))))))))))))......((((.....))))..))))..)))))))(((((..((((.(((..(((((........)).).))..))).)))).....))))).))))))).......))))).))))....))))))))))))...))))))))))).))....))))))))...))))).)).....))))).))))))(((((.((((...((((((((((.(((...(((.(((((((((....)))).............((((..((((.....((.....))))))..))))....((((.....(((((((...............))).)))).....))))((....))))))).)))...))))).))))))))...)))))))))...(((...)))..))).)))))..).)))).)))))))).)))))))).......((((........))))(((.(((((((((....)))))))))..))).....(((((.......))))).(((((.((........)).))))).)))))..))...)))))))).)))))))))))))).))).(((..((((.((((.((((......))))..))))))))..))).))))))))))....)))))))))))....))))))))..))).))).........(((((((.(((.......))))).)))))....((((....))))(((((.(((((((..((.(((((((.(((((((((((((...((.((((.((((....((.....))....))))(((((...(((....)))..)))))))))))...))).(((((((((.(.((.(((...(..((((((((.(((.((.......))))).)))).))))..).))))).).))))))).))..)))))))).(((((...((((...(((.(((.....)))..)))...))))....)))))...)))))))))..))...)))))))..)))))...)))))).)))))))))).....))))).((.....)).))))))))))..(((((((..((((((((...((.((.((..((((..(((.(((.....((..(((.......((((...(..((((((((((......................)))))).))))..)...)))).......)))..))..)))..))).)))))))))))))))))))))))))))))...(((...))).((((((((((..(((((((.(((((((((.((((((((.((((..((..(........)..))..)))).)).(((((.....................(((((((..((((...)))))))))))..(((((((...(((((((..(((((((((((.(((((((.((((((((.((((.....)))).)))))).............(((((.((((........)))).))))))).)))))).).)))).)))))))((((((((((((((....((((...(.((((((((......)))))))))))))..)))))))..((((((......((((((.((.(((((...((((((((((......((.(((...(((.((((.(((((((.(((......))))))))))...)))).)))..)))))..)))..)))))))......))))).)).........)))))).......)))))).............((((((((...))))))))......((((.(((....))).))))..))))))).(((((((...))))))).......(((((((.((((....)))).))))))).)))))....))...)))))))..)))))...))))))))).)))))))))))))))))))))))..........((((((...(((((......))))).....)))))).(((.((((((......................)))))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.((((((..(.(((((((....))).)))).}..)))))).))))){,{{{(({,{{((..({((({((.{(((((..(((.(........).)))..)))),{((((((((...))))))))|,{((,,,{,({({{((((((.{((({{{((((({...})))))|.,{{{(((((({((,,.{{((((...}}}.|||.||}|||,,|,}}((((((((....,,})))))))..,||..{,,..,{,,||}|{,({(.,{{{...{,((((((....((((((((......(({...(((((((.....({({{{({((({,....|||.,((..{{|||{{||{{{{{..,}},}}}.|||}||{{{{|||||{.(((((.((((((......{{(((((....)))}}.}}..,,,.....))))))))))).{(((((((((((...(..((.....((.(((((((((.(((((.{{....{(((((,...(((((....))))).....,))))}},..{{{{(...}}))}{(((...)))}.....(((((..((((((,...((({,.......,}))).....,.))))))..}}}))).((((..((((((((..........))))))))...))))...,)))))..))),)))))).))...))..)..)))))))))))}(((.(((((.(((((((,(,.,..............((((((((.(((({,.(((....)))((((((((.((((((((.(..((((......)))).).))))))))...)))).))))....}.))))))))))))..((((((((.((..(((((....(((((...(((.((((((((.((((.(...(((((((((((.(((((.............(((((..(((((((((.,,,,...,,....(((({,..{,|,,}},,},.,,||||.....)})))).)))))))))))))).............))))).)))......((((((............(((((((((...(((((......))))).)))))))))(((((((.{........}))))))).......)))))).((((((.((((({{.(((............))).)},{(.,(,,,...}},},.|....,,)).......(((((((.......))))))).,|..{({{((((.(((,,((((.....{,,.(((((((((((...((((..............(((..(((((.((((...)))).))))).)))((((((((.,.(((((((((...(((((((.,..(((((.(((.,..((((((((.((....))...))))))))....))).}).}}|.((({,{((.(((,((({{.(({{{({{{((({{.{{{..{{{(((,.{{{{{({,{.,{(((.((..((((((((((...(,.......,,(((((.,......))))}....)).)))))))))).)))}||||||||...{{{(,({.,.,,||||||{,..,,..(({,((((.((..{((({{.,,{.{{,,.||,.|}}})).))}}}}.))).)))))},((((((((((..........)))))))))).})),,))))).))).))))))})},|}}}})).)}))})).,,,......((((((((((({(,{((.{|...(((((..((((...(((.,..(((........)))..,...)))...))))..))))).....}),),}}||..(((((.(((.(((((........)))))))))))))....{(((({||{(((,||{......{{{.{{{..,}}}.,}).,{{((.{{{{((((|{{(||,{......}.)),}))),,))},)))))))))((((........))))......,})))}))))))}..,...|||{|,..,)))),,})))..)}))))|(((((..((((.(((..((,,{.,,,....)).,.))..))).)))).....))))))))))))).......))))).)))).,..))))))))))))...))))))))))).)}.,..))))))))...)))))}),.....))))).))))))(((((.((((.,.((((((((((.(((...(((.(((({((((....))))......{{{{{..((((..((((.....{{.....))))))..)))),|...,...,,,..,,{(({.......,.,....,,.,...,,.....))))).......,)))).)))...))))).))))))))...)))))))))...(((...)))..))).)))))..).)))).)))))))).)))))))).......((((........))))(((.(((((((((....)))))))))..))).....(((((.......))))).(((((.((........)).))))),)))))..))...))))))))})})))))))))))).))).,,,..{{,,.,,||}||||}}..,}))))}}))),}}})}}))}.,}})))))))....})}))))))))....)))))}{{{{|||.|,|....,{,,{((((((,.(((..,,,,,|}}||.,}}}}.}},((({....))))(((((.(((((((..((.(((((({{(((((((((((((...((.(((({((((..,,{,...,.))...,))}}(((((...(((....)))..)))))))))})...))},(((((((((.(.((.(((...(..((((((((.((,,{{.......)}))).)))).))))..|.))))).).))))))).))..)))))))).(((((...((((...(((.(((,...,)))..)))...))))....)))))...)))))))))..))...)))))))..)))))...,}}}}},|||}}}}}}),,...)}}},.,{,..,.,,.},}})))|||,,(((((((..(((({({{...|{.{{.||..{{{{.|(({,{{{...,,(({.{{{.......||||,.,|..{|{{{|||||,..,,,..,,,,,,,,,,,,,,}))))),)}))..}...}}}),,,....))).,))..))),.})),))))))})))}})))))}})))})))))),,,|||.,.})).((((((((((..(((((((.((((((,((.(((((((({({{({{(,.,(,{......,.}))..)))}})}.{{{{((....}},,,...........((((({,,(((((...)))))))))))..(((((((..(((((((((.(((((((((((.{((((((.{{((((((.((((.....)))).)))))).............(((((.((((........)))).))))))}.)))))).,.)))},))))))}{{(((({(((((((....((((.,.,.((((((((......)))))))))))))..)))))))))||((((......((((((.((.(((((...((((((({{{.,,...((.(({..,(((.((((.(((((({{(((......))))))))))...)))).))).,)))))..))),.)))))))......))))).)).........)))))).......)))))}......,,,}...((((((((...))))))))....))))))))){{{,.{{.{(.((((((((...)))}}))))}},.,))))}}.....{((((((.((((....)))).))))))).,,,.}}.,,}|...)))))))....,}}...}))))))),.)))))))))))))))))))))))..........{(((((...(((((......}))))}....)))))}.|{(,({((({,.......,,|,........,.}})))},}),})))))}).
Back