Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_014885.5
Sequence Length
1433 nt
GC Content
0.3378
GUUCAACGCCGUUGGCGAAGCCAGCUGCUGGAGGUGCCGAGAAUCUGAGUUUCGGCAAGCAGCCAGAAUAUUUUAAAAAUGACUACACCAAACAAGACACCUCCUGGUGCUGACCCCAAGCAGUUGGAAAGGACUGGAACAGUACGGGAAAUUGGGUCACAAGCUGUUUGGUCACUCUCAUCUUGCAAACCAGGAUUUGGAGUGGAUCAGUUACGAGAUGACAAUCUAGAAACUUAUUGGCAAUCAGAUGGUUCCCAGCCUCAUUUAGUGAACAUCCAAUUCAGAAGAAAAACAACAGUGAAGACAUUAUGUAUUUAUGCAGACUACAAAUCUGAUGAAAGCUAUACUCCAAGCAAGAUCUCAGUCAGAGUAGGAAAUAAUUUUCACAACCUUCAAGAAAUUCGGCAACUUGAGUUGGUGGAACCAAGUGGCUGGAUUCAUGUUCCCUUAACUGACAAUCAUAAGAAGCCAACUCGUACAUUCAUGAUACAGAUUGCUGUUCUAGCCAAUCACCAGAAUGGAAGAGACACCCAUAUGAGACAAAUUAAAAUAUACACACCAGUAGAAGAGAGCUCCAUUGGUAAAUUUCCUAGAUGUACAACUAUAGAUUUCAUGAUGUAUCGUUCAAUAAGGUGACUUUAAAAUGAGACGAAAAUCAUUAAACGUAUCUUUGUUUUAUCCUGUAUUUAAAUAAUAUAUCAUGUACCUUUAUUGAACAAGGCAUCCGUUAUAUCUAAUUUUGUAUAUGUUUAAAAAUAUUUUAUUGUAACUUUGACAAAUAAAUUUGGGGUCAUAUUAUCUUUAUUUUCUUUAACAUGUAAUAAAGCUCACAUAUUUUACAUUACUAAAAAUGGAUUUGAAGCCAAUCAUUUUAUUUUCCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUCCUUGUAUCAAAAGAAAAGAGUUGAACUGAAAAUUUCAGUAUAUACACAAUUAUAAUAGCUAGGUGAUUAUUUCAUUAGUGUUCAUACAUUAGAGUAAUGGUUUAUUGCAUAUUUGAGAACAAGACUGUGUUUUAUCAAUAUAUAUCAUCUUUAAUAGGUCAAAAUUACUAUUUUUUCUACCCAGAGGAAGGUUAUUCUUUUAAUACUGGAUCUUUUAAAAAACAGUGUCAAAUAAGCUUAGUGUUAGGUUGUCUGAUGAGAACCAAUCUAAUAUGGGGAGUAUAAUUAAUUGUCUCAUAUUCACCUUCACGGAAUACUUACAGCCCUAGGGUUGUCUGUAUCCUAAUGAUAUUAUGUAAAGAUUGCCUGUAUAAUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUCUAGCAGUACUUAUGGAAGAGUUAUUUUCAAAUUUGUGUCUGACAUUGUAGCAUUCCCUGGGCAGUCAUAUAUCCCAUAAAAUCGUAAAAGUAUGUGAAAUUUUUUAUAUAUAUUAAAAGAUUUUAAAGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-315.88 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -349.05
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.62
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((...))))...(((((((((((.((((((((((.......))))))).((((.((((.....................................)))))))).))))).)))))))))...((.(((((((((((.(((((..((((((.((.((((((((((((((((.((((((.....))))))..))))))....((((.(.((((....)))).).))))..((((.((((....)))).))))..((((...)))).((.(((((((((..............(((((......((((....))))..((((...((((((((..(((........)))......))).)))))))))((((....)))).....)))))..............)))))))))))..))))))))))))))))))..)))))....(((...(((((..(((.............)))))))).)))..)))))))))))))........))))......(((.((((.((...((((..((((((((....((((((.((.......)).))))))...........((((((((...(((((.....(((((...(((((((((((((........((((((((((................))))))))))..((((((.....)))))).....)))).)))))))))...)))))......)))))...))))))))........))))))))))))...............)).)))))))......((((((...(((((((.((((((.(((..(((((((((((.............(((((.(((.(.((((....((((.((((((......(((((((.....((((((........((((((((.....((((((...))))))..................((.....(((((((.(.(((((((....))))))).).)))))))....))(((((((((((((......)))))..)))).))))...((((.....))))...........)))))))).....)))))).....))))))).((((((..............))))))............((((((((((((((....)))..))))))))))))))))).))))...)))).)))).))))).......(((.(((..((((((....))))))..))))))..(((((.(((((....((((((((............((((((..(((((...)))))..))))))...((((..(((((..(((.((....)).)))....))))).))))..))))))))........))))).))))).)))))))))))..))).))))))...)).)))))...))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{((..((((...))))...(((((((((((.((((((((((.......))))))).((({.((((.............,{.......,......,.......)))))))).)))))}}))))))))...((.(((((((((((.(((((..((((((.(,{((({((((((((((((.((((((.....))))))..)))))),,,.((((.{.((((....)))).}.)))).,||((.((((....)))).))}},.((((...)))).((.(((((((((..............(((((......{({,....}}}}..((((...((((((((..(((........)))....,.}},})))))))))((((....)))).....)))))..............}))))))))))..))))))})))))))))))..)))))....(((...(((((..{{{{,......}}...))}))))).)))..)))))))))))))..,,.,,,...}}|..,.{{,.,,,({((((((({{,{(((,.((({{..{(((((.(({(....|}}.}}}))}.....,...{.((((((((...(((((...{{(((((...(((((((((((({.,......(((((((({{..||,,.....|....})))))))}}..((((((.....))))))....}))))))))))))))...))))).}}...)))))...)))))))).}....,.,}|,}}}}||||,..||,,||,..,,,|,.|||}}|}.,,,,,{{{{{{...{{{{{{{.{((({{,{((,,{{,{{{{{{{{,{,,,....,,{{((({,.((,.,.||||}|.}||,{,{((,,{{{...,,,,,|{{{{{{,,{((||{{{{.|{{{({{,|{{{,{{,((((({...}))))).,,.,......,,,....((.,,{{(({{{{,,|.|((((((....))))))}.},})))}}},}}})){|{{{{{({((((......)))))..}})),}},,.,}},||},,,{|{},.,,,....}},}}||||||....,}})))},,,..))))))).||||,|}}.,,,,,......}}}}}}.,,,....|,,.((((((((((((((....)))..)))))))))))}))}})}))).}}})))))))))}))}}...,,,..((,{(((..((((((....))))))..))))))..,{{{{.{{((({,..((((((((,.....,{{,..((((((..(((({...}))))..))))))..,|||{,.((({{..|{{.,,..,,}}.}})....))))).}},,.,)))))))).,,},...})}||,|||}}.,},||||||||,.||||)))))),,.})}}}}))}}})),,)),.
Back