Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_015681.6
Sequence Length
913 nt
GC Content
0.5915
GCAUGCCACACGCGCACUCGCGUGGCCUUCGCGAAGGUGUCGCUGCCAAGAAACGUGUCCUGCGCGCUACGCCGUCUGUUUCUAGGGCAACGCCGGCGUCUCUUAGCAACCGCGCGCGGCCUAGGUGGGUCCCCCCGGCACCCCCAGACCUGCCAUGGCGACCGCGAGUCCUAGCGUCUUUCUACUCAUGGUCAACGGGCAGGUGGAGAGCGCCCAGUUUCCAGAGUAUGAUGACCUCUACUGCAAGUACUGCUUUGUGUACGGCCAGGACUGGGCCCCCACAGCGGGUCUGGAGGAGGGGAUCUCACAGAUCACAUCCAAGAGCCAAGAUGUGCGGCAAGCACUGGUGUGGAACUUCCCCAUUGAUGUCACCUUUAAAAGCACCAACCCCUACGGCUGGCCACAGAUCGUGCUCAGCGUGUAUGGACCAGAUGUGUUCGGGAACGAUGUGGUUCGAGGCUAUGGGGCCGUGCACGUGCCCUUCUCACCUGGCCGGCACAAAAGGACCAUCCCCAUGUUUGUCCCAGAAUCUACGUCUAAACUGCAGAAGUUUACAAGCUGGUUCAUGGGGCGGCGGCCCGAGUACACAGACCCCAAGGUGGUGGCUCAGGGUGAAGGCCGGGAAGUGACCCGUGUCCGUUCUCAGGGCUUUGUCACCCUCCUCUUCAACGUGGUGACCAAGGACAUGAGGAAACUGGGCUAUGACACUGGGCCUUCUGAUACACAGGGUGUGUUGGGGCCCAGCCCACCCCAGAGCUUCCCCCAGUGAAGGCUCCACAGGCUGCACAGUCUCUGAUAAUGAAGGGCUGCCUUCCCGAAGUCAGCCGCUGCCCAUCGGCCUGAGGGGCAGCCUGGUGGCCAGAGCUGGGGGCACACAGAAUAGUUUUGUAUAAUAAAGUCUCAUUUUCAGAGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-364.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -380.17
Frequency: 0.0000
Diversity: 151.75
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((.((((((....))))))((((((((...(((((.((.((((.((......)).)).)))).)))))((((((..((.((((..((((((((.(((((.....(((....))).((.((.((((((....)).))))))))(((((((.((..(((((.((((...((...))....)))).)))))..))))))))).)))))))))((((......((((.((.....))))))......)))).(((((((.((((((((...((((((.......)))))).(((((((((((((...)))))........((((...(((.((.(((.(((..((((((((.((.((......)).))..)).......)))))).........))).))).)).)))..)))).((((((((((.(((...((.((...((((......)))))).))..)))..)))))))))).)))))))).))))))))))))))).(((...)))........(((((((((((..(...((((((.....))))))...)..))))).)))))))))))))).))...)))))).....((.((.(((((.((((((((.(((((((..(((....)))..))))).)).)))(((((((((((((.....(.(((...))).).....)))))....)))...)))))(((((((..(((((((((...))))))))))))))))..)))))..))))).)).)).))))))))......))))))....(((((((.(((((..(((((.(((....))).)))))(((((((.((.....)).)))))))((((((.((........)).))).)))......................))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
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