Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_016581.5

Sequence Length

1647 nt

GC Content

0.6187

CUCUGGGCCAAUAUGGCAGCGCCCAGCAACAAGACAGAGCUGGCCUGGAGUCCGCGGCUGGCCGCGUGAGUAGGUGAUUGUCUGACAAGCAGAGGCAUGAGCUGGGUCCAGGCCACCCUACUGGCCCGAGGCCUCUGUAGGGCCUGGGGAGGCACCUGCGGGGCCGCCCUCACAGGAACCUCCAUCUCUCAGGUCCCUCGCCGGCUCCCUCGGGGCCUCCACUGCAGCGCAGCUGCCCAUAGCUCUGAACAGUCCCUGGUUCCCAGCCCACCGGAACCCCGGCAGAGGCCCACCAAGGCUCUGGUGCCCUUUGAGGACCUGUUUGGGCAGGCGCCUGGUGGGGAACGGGACAAGGCGAGCUUCCUGCAGACGGUGCAGAAAUUUGCGGAGCACAGCGUGCGUAAGCGGGGCCACAUUGACUUCAUCUACCUGGCCCUGCGCAAGAUGCGGGAGUAUGGUGUCGAGCGGGACCUGGCUGUGUACAACCAGCUGCUCAACAUCUUCCCCAAGGAGGUCUUCCGGCCUCGCAACAUCAUCCAGCGCAUCUUCGUCCACUACCCUCGGCAGCAGGAGUGUGGGAUUGCUGUCCUGGAGCAGAUGGAGAACCACGGUGUGAUGCCCAACAAGGAGACGGAGUUCCUGCUGAUUCAGAUCUUUGGACGCAAAAGCUACCCCAUGCUCAAGUUGGUGCGCCUGAAGCUGUGGUUCCCUCGAUUCAUGAACGUCAACCCCUUCCCAGUGCCCCGGGACCUGCCCCAGGACCCUGUGGAGCUGGCCAUGUUUGGCCUGCGGCACAUGGAGCCUGACCUUAGUGCCAGGGUCACCAUCUACCAGGUUCCUUUGCCCAAAGACUCAACAGGUGCAGCAGAUCCCCCCCAGCCCCACAUCGUAGGAAUCCAGAGUCCCGAUCAGCAGGCCGCCCUGGCCCGCCACAAUCCAGCCCGGCCUGUCUUUGUUGAGGGCCCCUUCUCCCUGUGGCUCCGCAACAAGUGUGUGUAUUACCACAUCCUCAGAGCUGACUUGCUGCCCCCGGAGGAGAGGGAAGUGGAAGAGACGCCGGAGGAGUGGAACCUCUACUACCCGAUGCAGCUGGACCUGGAGUAUGUGAGGAGUGGCUGGGACAACUACGAGUUUGACAUCAAUGAAGUGGAGGAAGGCCCUGUCUUCGCCAUGUGCAUGGCGGGUGCUCAUGACCAGGCGACGAUGGCUAAGUGGAUCCAGGGCCUGCAGGAGACCAACCCAACCCUGGCCCAGAUCCCCGUGGUCUUCCGCCUCGCCGGGUCCACCCGGGAGCUCCAGACAUCCUCUGCAGGGCUGGAGGAGCCGCCCCUGCCCGAGGACCACCAGGAAGAAGACGACAACCUGCAGCGACAGCAGCAGGGCCAGAGCUAGUCUGAGCCGGCGCGAGGGCACGGGCUGUGGCCCGAGGAGGCGGUGGACUGAAGGCAUGAGAUGCCCUUUGAGUGUACAGCAAAUCAAUGUUUUCCUGCUUGGGGCUCUCUUCCCUCAUCUCUAGCAGUAUGGCAUCCCCUCCCCAGGAUCUCGGGCUGCCAGCGAUGGGCAGGCGAGACCCCUCCAGAAUCUGCAGGCGCCUCUGGUUCUCCGAAUUCAAAUAAAAAGGGGCGGGAGCGCUGUUGGUUGUGCGCA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-695.90 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -723.74

Frequency: 0.0000

Diversity: 395.76

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

...((.((((((..((((((((((.((..(.((((((...(.(((((...(((((((....))))).)).))))).)))))))((.((.(((((((.....((((((((((((((......)))))...((((.(((((((((((....)))).)))))))))))..(((...)))..(((((((.((....(((((..((((.((((.(((((((((((.(((((.((...((((....(((((.(....(((((..((((((.(((..((((....))))((((((..(((((......))))).))))))(((.(((((....)))))..)))))).)))))))))))....))))))....)))).)).)))))....(((((.(((...)).).)))))(((((((((....((.....))....)))))))))(((...)))(((((...(((((.((((((...((((.((....)).)))))))))).))))))))))...)))))))..))))..(((((((.(((((((((((((((((.((((((.((((((((((((((.....((((((((((((((((.((((..((.((((((((((..(.((((((((...(((..((((((..(((.(.(((((....)))))))))..)))).)).....)))..))))).))).)....))))))))))))..(((........))).......((((........)))).)))).)))))..(((((.((((((((((....)))))((.((((...(((((((((((((......))))))..........)))))))..)))))).)).))).))))).)))))).)))))...((((.....((((..(((........)))))))..((((((((..((((...........))))..))))))))..((((((.(((((.(........).))).)).))))))(((((.((...))))))).......)))).)))))))))((....)).))))).)))))).))).....((.(.((((((...)))))).)))))))).))))))..))).)).))))))))))))).)))))......((........))...)).)))))))..((((..(((.(((((.((..((((((....)).))))..))))))).)))))))...))))))))).((((((((.((.(((.(((..(((.(((((((...((((((.((((.((((((.(((((....)))))))((((.((((.(((((.((((((.(((.....))).))))))..)))))((....)).............(((((.((....)).)))))((....))..)))))))).)))).)))).))))))))).)))).).))..).))))).))((((((((((..(((..............)))..)).))))))))(((...(((((((.(((.((.((((.((.(((((.(((.((((........)))).))).))))).)).)))))).))).))).))))..)))...))))))))))))))).)).))................)..)).)).)))))))).)))).)).))

Thermodynamic Ensemble Prediction

...{(.((((((..((((((((((.((..{.{(((((...{.(((((.,.(((((((....))))).}}.})))).}}})))){{.{{.(((((((.....((((((((((((({.{{{{{,||||...||||.,,|||||(((({{..||||,|||||||||||.,({{...}))..(((((({.{{,{{{(((((..((({{(({{,,((((((((((.(((((.((...((((....(((((.{....(((((..((((((.(((,.((((....)))),,|,||}.(((({.{{{.{|,,|{{({,,,,{{,.,||,,..}}))))).}))))))})))))))))))....|)))))....)})).}}.)))))....{((({.,((.,.}},),)}}},(((((((((....((.....))....)))))))))(({...}))(((((...(((((.((((((...((((.((....)).)))))))))).)))))}))))...}|}||||..}})}||((((({(.(({((((((((((((((.((((((.((((((((((((((.,.{.((((((((((((((((.((((..((.((((((((((..{.((((((((...(((..((((((..(((.{.(((({....})))),)))..)))).)).....)))..))))).))).}....))))))))))))..{{{........}}).......((((........)))).)))).)))))},(((((.((((((((((....))))){(.((((.,.(((((((((((((......)))))),.........}))))))..)))))}.)).))).))))).})))))}})))),,.((((.....((((..(((........)))))))..((((((((..((((...........))))..)))))))).,((((((.(((((.(........).))).)).)))))){,((({(.....,))))).....,.)))).))))))))){(....)).))))).)))))).))).....{(.(,((((((...)))))).)))))))).))))))..))).)}.))))))))))))),))))}..|,..,}},|,,....},..}}.)))))))..||||}}||{.{((((,({..{|||||,,,,)),}}}}.})))))}}.}})))))...))))))))).(((((((({{{.((,.(({..(((.(((((((...((((({,(((({(((({(.(((((....)))))}}{{({{{({{.(((((.((((((.(((.....))).))))))..))))){{....)).............(((((.((....)).)))))((,,,,}}..}))))})),)))).))))}))))))))).)))).}.))..}.))))).}}(((((((({{..|||,.,,|...,...,.))}..)),,)))))))(((...(((((((.(((.((.((((.((.(((((.(((.((((........)))).))).))))).)).)))))).))).))).))))..)))..,))))))))))))))).}}.}|,...............),,)).)).)))))))).)))).)).)}