Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_018460.4

Sequence Length

1670 nt

GC Content

0.4024

AGUUAGGAGUUGAUGGCAGUUUCAAUAACAGGUCAUUGCCGAGAAAAGGAUAGCACUAUAAUAUGCAGAAAUCUACAAAUUCUGAUACUUCCGUGGAAACACUGAAUUCUACCCGCCAAGGCACAGGAGCUGUGCAAAUGAGAAUCAAAAAUGCCAACAGCCACCAUGACAGGCUCAGCCAAAGUAAAUCCAUGAUCCUCACCGAUGUCGGGAAGGUCACUGAACCUAUAUCCAGACACAGAAGGAAUCAUUCACAGCAUAUCUUGAAAGAUGUCAUUCCUCCAUUGGAACAACUGAUGGUUGAAAAAGAAGGUUAUCUGCAAAAAGCUAAAAUUGCAGAUGGAGGAAAGAAACUAAGGAAAAACUGGUCUACUUCCUGGAUUGUUCUUUCUAGUCGAAGAAUUGAAUUUUACAAAGAAUCCAAGCAACAGGCUCUGUCCAAUAUGAAAACUGGGCACAAACCAGAAAGUGUGGAUUUGUGUGGAGCACACAUUGAAUGGGCCAAGGAAAAAUCGAGCAGAAAGAAUGUCUUUCAGAUCACAACAGUAUCAGGAAAUGAGUUCCUUCUACAGUCAGAUAUUGACUUCAUCAUAUUGGAUUGGUUCCACGCUAUCAAAAAUGCAAUUGACAGAUUGCCAAAGGAUUCAAGUUGUCCAUCAAGAAACCUGGAAUUAUUCAAAAUCCAAAGAUCCUCUAGCACUGAAUUGCUAAGUCACUACGACAGUGAUAUAAAAGAACAGAAACCAGAGCACAGAAAAUCUUUAAUGUUCAGACUGCAUCACAGUGCUUCCGAUACAAGCGACAAAAAUCGAGUUAAAAGCAGAUUAAAGAAGUUUAUUACCCGAAGACCUUCCCUGAAAACUCUGCAAGAAAAAGGACUUAUUAAAGAUCAAAUUUUUGGCUCUCAUCUGCACAAAGUGUGUGAACGUGAAAAUUCCACAGUUCCGUGGUUUGUAAAGCAAUGCAUUGAAGCUGUUGAGAAAAGAGGUCUAGAUGUUGAUGGAAUAUAUCGAGUUAGUGGCAAUCUGGCAACAAUACAGAAGUUAAGAUUUAUUGUCAACCAAGAAGAGAAGCUGAAUUUGGACGACAGCCAGUGGGAGGACAUCCACGUUGUCACCGGAGCACUGAAGAUGUUUUUCCGGGAGCUGCCUGAGCCGCUCUUCCCUUACAGUUUCUUUGAGCAGUUUGUGGAAGCGAUCAAAAAGCAAGACAACAACACAAGAAUUGAAGCUGUAAAAUCUCUUGUACAAAAACUCCCUCCGCCAAAUCGUGACACCAUGAAAGUCCUCUUUGGACAUCUAACUAAGAUAGUGGCCAAAGCCUCCAAGAACCUCAUGUCCACGCAAAGCUUGGGGAUUGUAUUUGGACCUACCCUUCUGCGAGCUGAAAAUGAAACAGGAAACAUGGCGAUCCACAUGGUCUACCAGAACCAGAUAGCUGAGCUCAUGCUGAGUGAGUACAGUAAGAUCUUCGGCUCAGAGGAAGACUGACAGACAAGACAAGCUACUGAAUACGUUCACAUCUGUCUUGAUGCCUAAUAUUUUUACAUUUCUGUAAACAUAUUUCUGAAAUAUUUUUUGCCUUUCAAGCGACAGAUGCCUCAUUUUGUGAAAACUUAAUGAUGAUUUUGUGUUUAAGUUCCAAACAUUUGAAUAAAAUAAUUGACAAUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-406.10 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -439.19

Frequency: 0.0000

Diversity: 403.13

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

.((((((.((((.(((((.(((((...((((.((..((((.......((.(((............(((((.........)))))....(((.(((....))).)))..))).)).....))))...)).)))).....)))))........))))).))))..)).))))(((.((((..............(((.(((..(((....)))..)))))))))).)))......((((((((((.((((.(((((.(((...(((((.....(((((((((((((((((.....))))))........((((((..((((((((..........))))))))((((((((((((((((((....((((((.......(((((.((((((((((..((((....(((.(((((....))))).)))......(((((.(((((.(((.....((((.......))))...)))))))).((((((...))))))......))))).........))))..))))))))))...))))).........(((..(((((.....)))))..)))....((((.((((((((.......((((.....)))).((..........))..(((.((((((((((...(((((.(..((((((((((.(....((((.((.....)).)))).(((.(((((((((......))))..((((((.....)))))).........((((....(((((.(((((((((((((((((((..((((.....))))((((.......))))...................((((((((..(((((((.........))).))))..)))....)))))........))))..)))))))))....)))))))))))..))))((((.....))))...........((.(((((((.(((..((((...))))..))).).)))))).))....))))))))...).))))))).)))..).)))))..)))))))))).))).......)))))))).))))..((((..(((((...((...))...)))))..))))))))))(((((((((((((.((..((....))..))))..)))))))))))((((((.((....)).)))))).))))..)))))))))(((...((((((.(((.(((.....(((.......................))).....))).))).))))))..))))))))......(((((....)))))..((((.....))))((((.....))))...(((....)))((((((.((...((.((((.((...)).)))).)).)).)))))).....))))))..(((((((..........(((..((((........)))).))).........((((.((((.((((((.....)))))).))))...))))))))))).))))))...)))))..)))))...)))..)))))..)))).((((((((((((.((..((((((((((((....))))...........))))))))....))...))))..))))))))..(((((..((....))..)))))...))))))))))......(((..((((.....))))..)))......

Thermodynamic Ensemble Prediction

.(((,(({((({.(((((((,,(,...,,,{}{,}}||||.......((,,,({{....,,{{{.(((((.,.......}}}}},,..{{{.(((,,,.}}}.}},,}}}},,,.....||||,,{|}{||||{{,..|||,..,,,....))),,,))))..}}.||,.,(({{{,|||...,........(((,(((..(((....)))|,|))))},}},.}}}...}},,|||{((((||(({(.(((((.(((.,.(((((.....{((({(((({(((((((.....))))))}..},...((((((..((((((((..........))))))))((((((((((((((((((....((((((,,(((({{((,{((((((((({{..,,||}},.{{{.{{{{{....})))).}}|{{....(({{{.((((((((({,...(({(||.....|||}...|||||},||{{{{{{,,,},))))}|...}}}}}}..,,.....}}||..,((({({...})}))).},},......{{{..(((({.....)))))..)))((((({...}))))}...}}}}}})})}}.}}}}}},.||,.,,,,....,,..|||.((((((((((...(((((.,..{{((((((((.(....((((.{{......}.)))).(((.(((((((((......)))),.((((((.....)))))).........{{{{....(((((.(((((((((((((((((((.,((((.,...}}))||{{.......,}}},,......}},.,,.....((((((((..(((({((........,})).))))..)))....)))))........))))..)))))))))....)))))))))))..|}}|((((...,})))}...,,,....{((,(((((((.(((..((((...))))..))).),}))))).),},..})))))))...).)))))))).})..}.)))))..)))))))))).,})}}}..}})))))..},,.....((((..(((({.,,,{...))...}))))..))))))))))(((((((((((..{({{{({....}},}),})..))))))))))){(((((.((....)).)))))}.))))..}))))))))(((...((((((.(((.(((.....(((...................,...))).....))).))).))))))..))))))))......(((((....)))))..((((.....)))){{{{.....}}}),,,(((....)))((((((.((...((.((((.((...)).)))).)).)).)))))).....))))))..((((((({.........{{,..{,{(,.,..|,.,,|||||,.,,,,..}}|{{{.((((.((((((.....)))))).))))...})})))))))).}))))),..)))))..))))).,.)))..))))}..}))).|,|||||||||{,||..{((((.((((((....)))))).})))},,,},,}}}}}...}))..,))|||{}|||||,,{.(((((..((....))..))))).)..))))))))}..,|}}}.}}}..,,............,.......