Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_018664.3
Sequence Length
836 nt
GC Content
0.6053
GGGACAGCGCCCGUAGGCAGCCCCACGGGCAGGGCGCGCGGGCGGGGCGGGGCGGGCCGGGCCAGAGGAGCGCCCGGCAUGUCGCAAGGGCUCCCGGCCGCCGGCAGCGUCCUGCAGAGGAGCGUCGCGGCGCCCGGGAACCAGCCGCAGCCGCAGCCGCAGCAGCAGAGCCCUGAGGAUGAUGACAGGAAGGUCCGAAGGAGAGAAAAAAACCGAGUUGCUGCUCAGAGAAGUCGGAAGAAGCAGACCCAGAAGGCUGACAAGCUCCAUGAGGAAUAUGAGAGCCUGGAGCAAGAAAACACCAUGCUGCGGAGAGAGAUCGGGAAGCUGACAGAGGAGCUGAAGCACCUGACAGAGGCACUGAAGGAGCACGAGAAGAUGUGCCCGCUGCUGCUCUGCCCUAUGAACUUUGUGCCAGUGCCUCCCCGGCCGGACCCUGUGGCCGGCUGCUUGCCCCGAUGAAGCCGGGGACACUCCUCUGCCCAGCAAGGAGCCUUGGUCAUUUUCAUACCUGGGAGGAAGGCUUUUCCUUCACAAUUGUAUACAGGGGGCACCUGUGGCCAGGCCUCCUCCUGGGAGCUCCAGGACCAGCCAGCUGUGUUCCCUGCAGACUGGGCUCAGCCCGACAUCCAACAGGCGCCAAACUCACAGAGCCCUUGUGCAGAUCCAGCAUGGAGGCCACCCUCAGGAGUGACUUCUCAUCCACCCUGGCAGCUAGUAGGUUCUGCUGUUAUGCAGAGCCAUUUCCUCUAGAAUUUGGAUAAUAAAGAUGCUUAUUGUCUCUCCCUUCUCCAGUUCUGGGAAUUUACAGGCACAAUACACUUCCUUUUCCUGGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-337.40 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -350.36
Frequency: 0.0000
Diversity: 196.12
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((....((.((...((.((.((.((((...((((((((((((.((((((((.((((((((......).))))))).)))).....((.((((((.(((((.(.(((((((....)))).))).)))))).)))))).))..))))..))))..)))).)).))...)))))).)).))...)).))...))))(((((.((((........((((....)))).((((((((........(((.((.....)))))....(((((.(((((..........((((((((..(((((.((((.(((((((((.(((.(((((..(((..(((.....))).))).)))))..(((((((((..((.((((........))))))((....))((........)).........)))))))))..(((((((.((....)))))))))..(((((((.......))))).)))))))))))((.....)))))..))))..)))))...((((((((((.(((((..((.............(((((.....)))))))..))))))))))))))).)))))))).((..(((((((.(....(((((.(..((((((.((((...........)).))..........)))))).).)))))..))))).))).))....)))))))))))))))))).......((((.((..(((.((((((((......)))))))))))..))))))......((((((((......)))))))))))))))))(((((....(((((..................)))))....)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,(((,...((((((.((....}),)))))){{((({{(({{((((.((((,((({((((((((......).)))))))..|||.....(|.((((((.(((({,(.(((((((....)))),))).)))))).)))))).)).,))))..))))..)))).}}.))...))))),.{{{,.....,.||,..))))((((({((({........((((....)))).((((((((.......,(((.((.....))))).,..(((((.(((((.......,..((((((((..{{{,,.,(({,(((((((((.({(.(((((..(((..(((.....))).))).))))}..(((((((((..((.(((({......,))))))((....)),,.||.....,......,.},)))))))))..(((((((.((....)))))))))..{{(((((.......))))).)}))))))))}{|||,,.||||,,,||||,.,}}}}...({(((((((({({{{{.,||,,,.,....},.,(((((.....))))))),,)))))))))}))))).)))))))).,|.,(({{(((,({,..(((((.{..((((((.(((,,........,.)),},..........)))))).}.)))))..,}))),))).)),...)))))))))))))))))),{{{{..((((.((..(((.((((((((......)))))))))))..))))))....}}|||(((({......)))))}))))))))))){{{{(.,,,(((({.....,|..........,)))))..,,)))),
Back