Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_020396.4

Sequence Length

1249 nt

GC Content

0.5300

CGGGCCAAGAAAACCAGCGAAGGCCCGGCCCCCCAGCAGAGGCCGGACCAUGGUUGACCAGUUGCGGGAGCGCACCACCAUGGCCGACCCGCUGCGGGAGCGCACCGAGCUGUUGCUGGCCGACUACCUGGGGUACUGCGCCCGGGAACCCGGCACCCCCGAGCCGGCGCCAUCCACGCCCGAGGCCGCCGUGCUGCGCUCCGCGGCCGCCAGGUUACGGCAGAUUCACCGGUCCUUUUUCUCCGCCUACCUCGGCUACCCCGGGAACCGCUUCGAGCUGGUGGCGCUGAUGGCGGAUUCCGUGCUCUCCGACAGCCCCGGCCCCACCUGGGGCAGAGUGGUGACGCUCGUGACCUUCGCAGGGACGCUGCUGGAGAGAGGGCCGCUGGUGACCGCCCGGUGGAAGAAGUGGGGCUUCCAGCCGCGGCUAAAGGAGCAGGAGGGCGACGUCGCCCGGGACUGCCAGCGCCUGGUGGCCUUGCUGAGCUCGCGGCUCAUGGGGCAGCACCGCGCCUGGCUGCAGGCUCAGGGCGGCUGGGAUGGCUUUUGUCACUUCUUCAGGACCCCCUUUCCACUGGCUUUUUGGAGAAAACAGCUGGUCCAGGCUUUUCUGUCAUGCUUGUUAACAACAGCCUUCAUUUAUCUCUGGACACGAUUAUUAUGAGUUUUAAAACUUUUAACCCGCUUCUACCUGCCCAACUGUGACCAACUAAAUGACAGAUGUGUGAGAACAAGAACUGAGGGAAAGCACCUUCCCCCACCCCAGACGUUUUUAUCUGAAUGCAUACAAGGAGUCCUGAGGUGGUGAUUUGGCCAGUGUUUUAACUUGUGACAAGUACUCAGGUGUGAGGACAAGAAUGCAAAUGGCUCUUCCUUGAGUGAAAGAAAUGGGGAGUCUAGAGCCUCUUUAUGCCAAAGAACCGCAGAAGAAACUGCAUUCCAUUAAAUGGGAAAUACAGUGCUAUUUGCUAAAACUUGGAUAAGAGUGCGAACCUCUCAUCUCUCCACAACUUCAUGUGCUGCUGACUAAUUUUAAACAUGGCCACAGCUGGGGCAAAAUAAUCCCCAAAGUAGAAAAAGUCCCAGUUUAACAAAGAAUGUAAUGUUAAAAUCACUUAUAAGGAAUUCUUUGAAACCAAAUCCUUUGAAAUCUAAUUCCUGGGACUUCUAGGUUUUUAUAGUUAACAUACUAAUUUCUUCAAUAAUUGUUAACUGCAAAGUUUUAAUAAAUUUGUACCUUUAAAAAAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-451.70 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -474.15

Frequency: 0.0000

Diversity: 283.89

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

((((((...............))))))((.(((((((.(.((.(((.(((((((.(......((((....))))).)))))))))).))))))).))).))((((((((.....(((((((((...((((((........))))))...(((((........))))).(((((((.(......(((((((.....(((...)))(((((((((((...(((((.(((.(((.((((((....((((....(((((.....)))))..(((((((..((((((((((((...(((((...((.(.(((((((.(((((((.(((((....))))).(((((....)))))((((...)))).)))..)))).)))))))).))))))))))).))).)))))....)))))))((((...))))))))..)))))).).)).(((((....))))).))))))))...)))))))))))...(((((((.(((((.((.((.((......)).))))))))).))))))))))))))))))))))....((((((.(((((((((..((((.......((..((((((((((((..((((....(((......)))...((((((..(((((..(((((((((....(((.((((....(((.(((((....))))).)))...((........)).....)))).)))..))))))).)).))).))..))))))...((.(((((......))))).))..))))..)))))).)))))).))....)))).))))))))).)))))))))))))))......(((((...))))).))).)))))((((((((.........(.((((......)))).)(((...(((((((...((((((((((....((((......(((((((..((((..((((((...))))))....)))).)).)))))......))))..))))).)).....)))...)))))))...))).....((((.((.(((..........))).))))))(((((.........))))).........((((((((((((((((..........))))))).....((..(((((....((((....)))))))))..)).........))))))))).((((.((((.(((((((((...................))))))))).)))).))))......)))).)))).........

Thermodynamic Ensemble Prediction

((((((..,........,...))))))(({(({((((.(.((.(((.(((((((.{....{.((((....))))}})))))))))).))})))).))).))((.((.(({{{,.,,{((((,....((((((,.......))))))..((((((..(((.(((((.(((((,.....,,,..,(({{((.(((((((.(({,({(((((((((((...(((((.,((.((({,(((((,.{{((,,...{(,((({,...,,|||..(((((((..((((((((((((...(((((...((.(.(((((((.(((((((.(((((....))))).(((((....)))))((((...)))).)))..)))).)))))))).))))))))))).)))))})))....))))))),,||,..))))),))..,,,)))},,))}||(((....))))))))))))))...)))))))))))..)}((((((...)))))).))}))))))).))))))))).)).))))).)))..)))))).{{{{{...((((((.(((((((((..((((.......((..((((((((((((..((((...,(((,,,{{{}||,..((((((..({(((..,,(((((((....(((.((((....{((.(((((....))))).))}...((........)).....)))).)))..))))))).,).))).)}..))))))...||,{||||,,....}}}}}.,,..))))..)))))).)))))).))....)))).))))))))).))))))..))))){(((({.,{.{{({.,,,{{(((|,{{{{{{({(({{{{{...{{,,,{{((|{{{||||},||,.,,,...(((((((...{{{{{|(({||||.{{{{......(((({,|..((((..(((({,...,}}))),.,.)))).}),))))).....,)))|||}||||.},....,))).,,))))}))}..))}.,.))))},.}.}}.,.....}))))))))))))))|,|||}........,,}},...((((,.,(((((((({((((((..........})))))}.....,{..{((((....{(((....}))}))))),|},.........)))))))))}}}||,||||.{((((((((...................))))))))|,||||{{{....}},))))).,,,..........