Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_020686.6
Sequence Length
4779 nt
GC Content
0.4974
GAGCAGACACCCAGCGCUGCCGGAACUCGGGGCGCGCAUCCCGCAAGUCGGAACCCGGCGGAUCGGAUCCCGCAGAUCGGAGACGGGGCCUGGAGGGUGGCAGCACGCAAAGGGUGUCCCUGUCCCUCAAGGGGUCAUGGCCUCCAUGUUGCUCGCCCAGCGCCUGGCCUGCAGCUUCCAGCACAGCUACCGCCUGCUGGUGCCUGGAUCCAGACACAUUAGUCAAGCUGCAGCCAAAGUCGACGUUGAAUUUGAUUAUGAUGGGCCUCUGAUGAAGACGGAAGUCCCAGGGCCUAGAUCUCAGGAGUUAAUGAAACAGCUGAAUAUAAUUCAGAAUGCAGAGGCUGUGCAUUUUUUCUGCAAUUACGAAGAGAGCCGAGGCAAUUACCUGGUUGAUGUGGACGGCAACCGAAUGCUGGAUCUUUAUUCCCAGAUCUCCUCUGUCCCCAUAGGUUACAGCCACCCCGCCCUGCUGAAACUCAUCCAACAGCCUCAAAAUGCGAGCAUGUUUGUCAACAGACCCGCCCUCGGAAUCCUGCCUCCGGAGAACUUUGUGGAGAAGCUCCGGCAGUCCUUGCUCUCGGUGGCUCCCAAAGGGAUGUCCCAGCUCAUCACCAUGGCCUGCGGCUCCUGCUCCAAUGAAAACGCCUUAAAGACCAUCUUCAUGUGGUACCGGAGCAAGGAAAGAGGGCAGAGGGGCUUCUCCCAGGAGGAGCUGGAGACGUGCAUGAUUAACCAGGCCCCUGGCUGCCCCGACUACAGCAUCCUCUCCUUCAUGGGCGCGUUCCAUGGGAGGACCAUGGGUUGCUUAGCGACCACGCACUCUAAAGCCAUUCACAAGAUCGACAUCCCUUCCUUUGACUGGCCCAUCGCACCGUUCCCACGGCUGAAAUACCCUCUGGAAGAGUUUGUGAAAGAGAACCAACAGGAGGAGGCCCGCUGUCUGGAAGAGGUGGAGGAUCUGAUUGUGAAAUAUCGGAAAAAGAAGAAGACGGUGGCCGGGAUCAUCGUGGAGCCCAUCCAGUCCGAGGGUGGAGACAACCACGCAUCCGAUGACUUCUUUCGGAAGCUGAGAGACAUCGCCAGGAAGCAUGGCUGCGCCUUCUUGGUGGACGAGGUCCAGACCGGAGGAGGCUGCACGGGCAAGUUCUGGGCCCAUGAGCACUGGGGCCUGGAUGACCCAGCAGACGUGAUGACCUUCAGCAAGAAGAUGAUGACUGGGGGCUUCUUCCACAAGGAGGAGUUCAGGCCUAAUGCUCCCUACCGGAUCUUCAACACCUGGCUGGGGGACCCGUCCAAGAACCUGUUGCUGGCUGAGGUCAUCAACAUCAUCAAGCGGGAGGACCUGCUAAAUAAUGCAGCCCAUGCCGGGAAGGCCCUGCUCACAGGACUGCUGGACCUCCAGGCCCGGUACCCCCAGUUCAUCAGCAGGGUGAGAGGACGAGGCACCUUUUGCUCCUUCGAUACUCCCGAUGAUUCCAUACGGAAUAAGCUCAUUUUAAUUGCCAGAAACAAAGGUGUGGUGUUGGGUGGCUGUGGUGACAAAUCCAUUCGUUUCCGUCCCACGCUGGUCUUCAGGGAUCACCACGCUCACCUGUUCCUCAAUAUUUUCAGUGACAUCUUAGCAGACUUCAAGUAAAGAAGCCAUUUCCACUACAGUGAGAAAGCCCGGAUCCCAACAGUUGUCAAAUUGAUUAGUUUGCCUAAUUCAUGUUUUCACUUAAAAGUAUCAGAGGUGAAUGCACAGUGAAGGGUGAUUUGUGGGGAGGGAGCAUUUUUGGUGGUCUUGGGGGAGGGGAGGGGAGGGAAGGGCUGGUGUUGAUUUUCCUCCCUGCAGAGCCAAUGGUGCACAUUGGUUUAAGCCCAGAGAUCCUGCUUGAGCCCUGGACUCAUCUUGGGAAGGGCCAUGGGAGGUCCUGGCUAGAGUUCUGCCCAACCUUGACCAACCCCAGCAAUUUUUCCAAAAGCCAGUCAAGGGCAUUACAUUUGUUCCUGGGACUGGCAGCUGGGCCUCCUGGGUGCCAGUCCAUCUCAAGUGCCAUAUUCUGUGAUCACGGAUGUUGGCUCCCCCUCGCCCUAUGCAAGCAAACACACUCUCACCUCCUCUCCCAGCCUCCCGGAGCUCUGAGCACGCCCCACGCAUGGUGCAGGAGGGACUGGACAGAUCUGAGGAAGGCCGUAAAAUGGGGACAGGAGGAUUCAGCUCAGGAGUAAGGGAAGAGGUCCUCUGGCCCCCUGAAGAUGAGAAUCACCCCUCUCAGUGCACCUGGGGAUCCCCCUAAACUGUGAAUUCUGCCCUGGACAGGGCUUUGCCCUUGGAGGAUCCCCAGGUGGCCUUACCCGUGAUUCUUACUCGGCAUCCUCCAUUCCCCAAACUCCCUCCUCCCUGUUAAAUGUCAACCUAGACCUGGACCUGGGUGGGAGGAAACUGUAGCCUGAGUGUCCACAGGGACACACGUGAGCCACAGGGCUAGAAGCACAGGCCCGUCACCCCAGGAGGAAAAGCCCAGGGUCUGGGGCAGCAGAGCCAUCGCAUCAUGUUUCCCAGGGCAACUUGAGGUCUGACUUUUGGCUCCCUCGCCCUAAGAGGCUCUUCCUCUCUUUUGCUCAUCCACCUUCACACCACUUGUGAGCUGACCCCCAGGAACAGCUUGGCUGUUCCACCAGAGCAGAGGGAAUCAUUGCUGGACUGGAUUUCUUCUGGAGGGAAGCACCAUGAAUUAAAGGUGCCAGAGCUCCAUGCAUGGAAAAGUGGCCUGUUGGUUCAACGUGGUUUCCUUGUACUUGAUCCUCCUGAAAUGAGAGAUUUUCCUGAGAUGACUGAGUAUGGAGAUUACCAGGCAGAUGAUACCGAAAUGCUUAAAGGGGCUGUGGCUGAGGCUGUAGCAUCUCUGCUGGAGGUGAGACACUCUGGGAACUGAUUUGACCUCGAAUGCUCCUAAAAGAGAACUUGAUAGCCUGACAGCAGAGAAGUAUUAUUUGGUGGGGAGUCUGAGAAAGCCUGGCUUGUAUUAUCUGUCCAAAAGGAAGCCUCUUCAUCUCCCGGUGCCUUGGUUGACUAUUUUGGAAAUAGGCAUAUCAAGGUUCCUGAUUCAGCACUUUGCUCUUUUAAUAACAAAUCGUCCAAAGAUCUCAAAGUAAGGGUUUUUUUUUUUAGCUUCCACUCUUCCGCAGACUUGGUCAUCGACCUAUUUUUGUUGAAGAAUGAAAGGCAAUGACAAGUUUAACAUAUACAAAUUCGUGAAUUCUUGUUCAUUUUGCAUUCCUGCAGUCAGUGCUAAUCCGUCGUUCUUAAUCAGGAGUUCUGCCAGGUUUAAGGUCACCUGCACUCCCAGCCAAGUGGUGAUGUAUGCCUCCCACUCUCUGCAAGGUUUUCCUCAUUUUUAUAUUCAUUUAUUCAUCAUUCAUUCAUUCACCUAACUUUCAUUAAAUAGCUGCACCAUCCCAGGCCCUGUGCGGAGCAUCGGGAAUACAAAGAUGAGAUAAAACAUUGUCCCUGCCCCCGGGGGCUCACAUGCCACUGGAAACAACAGACUCUUAAACUAACAAUUCAAGCAGGCGCCAAGUGCUAUGACAGAGGUGUGAAUAAAAGCAUCAGGAAAUCGGAUGGAGAACCACCAUUCACCCAAGGGUCAGAGGAGGUUUCAAAGAAAAGGUGUCAUUGGAGCAGUGUUUUGCAGAAUGAGCCAGAGUUCACCAAGCAGGCAAGGCAAGGAAGGGUGUUGCAGAGAGGGAACAGCAUAUGCAAAGGCGUAUCAGUUCAUGGCAUCACAUCUUUCACUGGGGAAGCCAGUUUCCACAGGCAGCAUCCCAAGGUUCAAUAAGGCCUUAUUUAACAAGCAAGCAAAAUGCAAACCAAACCAUUAUUCAUUUAUUGGCUUAAGUAUGCUUUCUCCUGAAAACUUUAGCAUUGGGUGCAAAUAUUCAGUAUGGUUCUCGGAGUCCAAAGGGUUUUAAGCCAGGGCACAACCAGAAAAGUGGCUCUCUUUGGUAGGGAGAGGGGCUCCAAUAUUUCGUUCUCUCCCCAUGGGGCACUGACAGAGAAAUGAAAUAGUUUUAUCUGGAAAAUUCCAGAGCUAUUAUUUACUCCUUACCAAGGGAAGUUACUUCUUGUAAAAACUUUUAAGCCAUUUAUCAACAAGUUCUUGUUGACUCAGGGCAUAAUGAGUUCCUGAGACAUGCUCUUUUGGGGGCUGGGGCUUUAGCUAGAAGAAUUUCAAGGAAAAGAAUUCUCAGCAGAGCUCAAGAUUGUAGAAACUCAGCAGAAGCUGGUAAAAACAUGGGGAGCCCGGAGGACAGGCUGCUGUCCAGGGCAGAGGCCAUGAAGAAGUGCUUCCGUGGCCGACAGUCUGGAAAUGAAUCCAUCAUACAUUAGUGCCAUAGAGUUUAGUAACCGUCCAGCAAGUGUCAUCACUUUUACAGAAAACAAGGUCCAGUAAUAGCAAGUCUUAGUACAUCCUCACUUUUAUUAUAAAUGGGUGUUUUUUCAUAAUUUUUACUGACGCUCAGUAACCAUGCAAAAUUGUGUAUAGCAUUAAUGUAUCUACAUACCUACACCUAUCUAUAUAUAAGCUCAUGGUAGAAAACCAUAGCUAAGUAGCAUCGCAGACUUAAGCGUACAAAGUGAUCUUGUUCACAAGUAAUCUGUUGACAGUGCCAAUAAAUGAUAAAAAAAAAAUUAACAUGUCACAAUGUAACGGAUGACCAUAUGCACAAUUCCAUGAAUUAAAUCUGUUUCCUGUGUUAGUCAGUAUUCUUAAAUAAAAUUUAUAAUUGAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1622.50 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1711.62
Frequency: 0.0000
Diversity: 1120.45
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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