Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_021822.4
Sequence Length
1564 nt
GC Content
0.4827
GGGCUGUCCUAAAACCAGAAGCUUGGAGCAGAAAGUGAAACCCUGGUGCUCCAGACAAAGAUCUUAGUCGGGACUAGCCGGCCAAGGAUGAAGCCUCACUUCAGAAACACAGUGGAGCGAAUGUAUCGAGACACAUUCUCCUACAACUUUUAUAAUAGACCCAUCCUUUCUCGUCGGAAUACCGUCUGGCUGUGCUACGAAGUGAAAACAAAGGGUCCCUCAAGGCCCCCUUUGGACGCAAAGAUCUUUCGAGGCCAGGUGUAUUCCGAACUUAAGUACCACCCAGAGAUGAGAUUCUUCCACUGGUUCAGCAAGUGGAGGAAGCUGCAUCGUGACCAGGAGUAUGAGGUCACCUGGUACAUAUCCUGGAGCCCCUGCACAAAGUGUACAAGGGAUAUGGCCACGUUCCUGGCCGAGGACCCGAAGGUUACCCUGACCAUCUUUGUUGCCCGCCUCUACUACUUCUGGGACCCAGAUUACCAGGAGGCGCUUCGCAGCCUGUGUCAGAAAAGAGACGGUCCGCGUGCCACCAUGAAGAUCAUGAAUUAUGACGAAUUUCAGCACUGUUGGAGCAAGUUCGUGUACAGCCAAAGAGAGCUAUUUGAGCCUUGGAAUAAUCUGCCUAAAUAUUAUAUAUUACUGCACAUCAUGCUGGGGGAGAUUCUCAGACACUCGAUGGAUCCACCCACAUUCACUUUCAACUUUAACAAUGAACCUUGGGUCAGAGGACGGCAUGAGACUUACCUGUGUUAUGAGGUGGAGCGCAUGCACAAUGACACCUGGGUCCUGCUGAACCAGCGCAGGGGCUUUCUAUGCAACCAGGCUCCACAUAAACACGGUUUCCUUGAAGGCCGCCAUGCAGAGCUGUGCUUCCUGGACGUGAUUCCCUUUUGGAAGCUGGACCUGGACCAGGACUACAGGGUUACCUGCUUCACCUCCUGGAGCCCCUGCUUCAGCUGUGCCCAGGAAAUGGCUAAAUUCAUUUCAAAAAACAAACACGUGAGCCUGUGCAUCUUCACUGCCCGCAUCUAUGAUGAUCAAGGAAGAUGUCAGGAGGGGCUGCGCACCCUGGCCGAGGCUGGGGCCAAAAUUUCAAUAAUGACAUACAGUGAAUUUAAGCACUGCUGGGACACCUUUGUGGACCACCAGGGAUGUCCCUUCCAGCCCUGGGAUGGACUAGAUGAGCACAGCCAAGACCUGAGUGGGAGGCUGCGGGCCAUUCUCCAGAAUCAGGAAAACUGAAGGAUGGGCCUCAGUCUCUAAGGAAGGCAGAGACCUGGGUUGAGCCUCAGAAUAAAAGAUCUUCUUCCAAGAAAUGCAAACAGGCUGUUCACCACCAUCUCCAGCUGAUCACAGACACCAGCAAAGCAAUGCACUCCUGACCAAGUAGAUUCUUUUAAAAAUUAGAGUGCAUUACUUUGAAUCAAAAAUUUAUUUAUAUUUCAAGAAUAAAGUACUAAGAUUGUGCUCAAUACACAGAAAAGUUUCAAACCUACUAAUCCAGCGACAAUUUGAAUCGGUUUUGUAGGUAGAGGAAUAAAAUGAAAUACUAAAUCUUUCUGUA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-503.10 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -531.25
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.22
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((((((...(((..(((.((((((..(((((((((...((((....))))..(((((((((.(((((......)))))...((......))(((((((.....((((((((.(.((((((........)))))).)))))............................((((((......))))))))))....)))))))...(((((((..((....))..)))))))......)))))))))..((((.((((.((((((((.((((((((.(.......((((((.((((((((((.((...)).)))))))))).)).))))((..((((((((((.(((...))).))))...)))))).))((((((((...))))...))))...((((........((((((.(((((.((.(((((...))))).))...(((((.(((((((......(((((...)))))......)))))))....)))))..((.((......)).))))))).)).)))).(((((...))))).......((((((((((((...))))))....)))))).....))))......).))))))))..)))))))))))))))).................(((.....)))(((((..(((((((........)).)))))..))).)))))))))))..))))))........))).)))...)))))))).((((((((..((((((..(((((((..(((((.((..........((((((.(.((((((.....(((((((((..........(((((.((((..........((((((..(((((....((((((((((...)))..)))..))))....))))).))))))))))))))).((((((...((((....)))).......))))))))))))))))))))).).))))))(((((((......)))))))..................((((.((((((((.((.....((((...))))....))))))))))))))....))))))).(((((((....)))))))........(((....)))....(((((........)))))..((((((((((.(((...))).)))).))))))...((((..((((((((....(.(((..((((((....((.....))(((((((.((.(((((((......((((.....))))))))))).)).)))))))...((((((.(((...((((((...))).))).........)))))))))..............))))))))))..))))).)))))))........))))..(((((.(((((((((.(((.....((((....))))....)))))))))))).))))).........(((((((.........)))))))((((.......)))))))..))))))..)))))))).((((((.((.((..(((....)))....)).)).))))))..................................
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((((((...{((,,..,.((((((..(((((((((...((((....))))..{((((((((.(((((......))}||.,{((,,{..{}}{(((({{.....{{{{((((,{.((((((........)))))),)}}}}............||,...,}||,.....{.(((,...,}),)}}))))}),,,,}}}}|},...(((((((..((....))..)))))))..,.,.))))))))}..((({{((((.((((((((.((((((({.,.,.....((((((.{(((((((((,,,...,).)))))))))}.)).)))){{..((((((((((.(((...))).))))...)))))).}}((((((((...)))),..})))...{(((,,.,....|(((((.(((((.((.(((({...})))).))...(((((.(((((((......(((((...)))))......)))))))....)))))..((.((......)).))))))).)).)))}.(((((...))))).......(((((((({{((...}})))}}..,))))))}}},,)}}}....,.},))))))))..)))))))})))))))).,{{{,...,}}},...(((.....))){{(((..(((((((.,....,,)).)))))..))).},)))))))))..)))))}....,...,))})}}...)))))))).((((((((..((((((..(({(((({,({{((,{{.........,((((((.(.((((((.....(((((((((..........(((((.((({.........{((((((..(((((,,{,((,({{({((...))),,}))}.))})....))))).))))))))))))))).((((((...((((....)))).......))))))))))))))))))))).).))))))|((((({......})))))}.............||,,,((((.((((((((.((.....((((...))))....)))))))))))))).,,({{||.||.{{(((((,...}}}}}))........{({....})}....(((((........)))))..((((((((((.(((...))).)))).)))))).,,||||}||(((((((....{.{({||,||(((....||,....,|(((((((.((.(((((((......((((.....))))))))))).)).)))))))}..((((((.(((...((((({...}}),))).........)))))))))............,,)))))))))},.))))),)},|{||....,,,.,..}..(((((.(((((((({,(((.....((((....))))....)))))))))))).))))).........,{(((((.........))))))|((((.......))))))}..))))))..)))))))).((((((.{{.((..(({....,})....)).},.)))))),,((({,.................,,})))}...
Back