Forensic RNA Knowledge Base

Sequence Details

Symbol

NM_021938.4

Sequence Length

1896 nt

GC Content

0.6081

GGGAGGCGCGGCCGCCGCUCCAGCUGCGAGUCCGCCCGCCGCCCGCCGCCGCCGCCGCCGGCUCGGUCCCGCGCCCGCCAUGGCCCGCCUGACGGAGAGCGAGGCGCGCCGGCAGCAGCAGCAGCUCCUGCAGCCGCGGCCCUCGCCCGUGGGCAGCAGCGGGCCCGAGCCCCCCGGGGGGCAGCCCGACGGCAUGAAGGACCUGGACGCCAUCAAACUCUUCGUGGGCCAGAUCCCGCGGCACCUGGACGAGAAGGACCUCAAGCCGCUCUUCGAGCAGUUCGGCCGCAUCUACGAGCUCACGGUGCUCAAAGACCCCUACACGGGGAUGCACAAAGGCUGUGCCUUCCUCACCUACUGUGCCAGGGAUUCCGCCAUCAAAGCUCAGACUGCCCUGCACGAGCAGAAGACCUUGCCCGGAAUGGCGCGGCCAAUCCAGGUGAAGCCUGCGGACAGUGAAAGCCGCGGAGGUAGGGACCGGAAGCUGUUCGUGGGGAUGCUGAACAAGCAGCAGUCGGAGGAGGACGUGCUGCGGCUGUUCCAGCCCUUCGGGGUCAUUGACGAGUGCACCGUGCUCCGGGGGCCUGACGGCAGCAGCAAAGGCUGUGCUUUCGUGAAGUUCUCCUCCCACACGGAGGCGCAGGCGGCCAUCCACGCCUUGCAUGGGAGCCAGACCAUGCCGGGAGCCUCCUCCAGCCUGGUGGUCAAGUUCGCCGACACGGACAAGGAGCGGACGCUCCGGCGCAUGCAGCAGAUGGUGGGCCAGCUGGGCAUCCUGACGCCGUCCCUCACAUUGCCCUUCAGCCCCUACAGUGCCUACGCCCAGGCUCUCAUGCAACAGCAGACAACAGUCCUGUCCACCUCGGGCAGCUACCUGAGUCCCGGCGUGGCCUUCUCACCCUGUCACAUCCAGCAGAUAGGCGCCGUCAGCCUCAACGGGCUGCCUGCCACACCCAUCGCUCCUGCCUCUGGGCUGCACUCACCCCCGCUGCUGGGCACCACCGCUGUGCCUGGCCUCGUGGCUCCCAUCACCAAUGGCUUUGCAGGUGUCGUGCCCUUUCCAGGUGGGCACCCUGCCCUGGAAACCGUCUAUGCCAAUGGCCUUGUGCCCUACCCAGCUCAGAGCCCGACUGUGGCCGAGACACUGCAUCCUGCCUUCUCCGGAGUCCAGCAGUACACAGCCAUGUACCCCACCGCGGCCAUCACGCCCAUCGCGCACAGCGUCCCCCAGCCGCCGCCCCUCCUGCAGCAGCAGCAGCGAGAAGGUCCCGAGGGCUGUAACCUGUUUAUCUACCACCUCCCCCAGGAGUUUGGAGACACGGAGCUGACGCAGAUGUUCCUACCCUUCGGCAAUAUCAUUUCCUCCAAGGUGUUUAUGGAUCGAGCUACCAACCAGAGCAAGUGUUUCGGCUUCGUGAGCUUUGAUAACCCGGCCAGCGCCCAGGCAGCCAUCCAGGCCAUGAACGGCUUCCAGAUCGGCAUGAAGAGGCUCAAAGUCCAGCUGAAGCGGCCCAAAGACCCGGGACACCCCUACUGACCGCGCCCACAGCCGCCCUGAGGCUGUAGGCAUGGCCCAGACCUGCGUGAUUUGUACAAUGUACUUUAUUUCUGCUACGAGUAAUUUCAUGAAGUUUCAACUUGCAAACUGACUUUUGGGACAAACCAACACACACACAGAAGAGAAAGCAAAGAACUUGGAACUUUGGGUUGACUCGGUUUGAGUUUUGUGUCAAAGAAGAUUUCCCGCGGCUGAAGAGGUUGGUGUUCCUGUUACGUGUUUCAGGUGAGAAGCAGCAAAGCGUCUUAAUGUUCAAAACGCCUCUCUUUGGUCUGGAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACAACUAAAAAUUUAUUUAAUAAAAGUUUUACUUGCUAAA

Secondary Structure

Generated by RNAfold

Predictions for this specific transcript isoform.

Minimum Free Energy

-732.40 kcal/mol

Ensemble Metrics

Free Energy: -761.69

Frequency: 0.0000

Diversity: 646.42

Structure Visualization

Structure Prediction

MFE Structure Prediction

(((.((((.(((.(((((.......))).))..))))))).)))((.(((.((.(((..(((((((.(((((((...((((((.(((.....)))...((((((.((..((((.((((.((...)).)))).))))..))))))))))))))...)).))))).)))))))...)))))))).)).....((((.(.(((((((((((.........((((((((.(((..((((((..(((((.(((..(((((((......((((((((...))))((((((..........))))))....((((.......((((.....))))..))))...))))...)))).)))..)))..))))).))))))..)))(((((((((((....(((((((....)))).((((((((((.((..(((...((((.(((((......((((..(((.(((((..((((.((.(((((((((((..((((......((((((((((.....(((((((((.......))).))))))(((((...)))))....(((((.......(((((((....((.((((((((..(((((..(((((....)))))(((((((((..............)))))))))((((((((((..(((((((.((((((((((((.((((((((..((((....)))).))...))))))..(((((......)))))..(((((....)))))((((...(((.....(((.((((.....(((((...(((.........)))...)))))....)))))))...)))...))))..))))))))))))((((..(((....)))))))....((((((......))))))....)))))))..........((((........))))..((((.......)))).....))))))))))........))).))..))))))))))))))))))))))(((.(.(((((......((((((..(((...(((((((............((.(((.((((.((.((((((.........))))))...)))))).)))))((((..((((..(((.(((.((........)).))).)))......))))..))))(((((......((......))......)))))....)))))))....))).))))))......))))).))))..))))))))))(((((..((.(((((((((.......)))).)))..))...))..)))))....((((...(((.(((.((((....))))..)))))).))))))))..)).....))))))))))).))))....)))))...))).)))).....))))).).))).))).)).).))))).)))).)))....)))))))))))..((.(((....)))..))..((((((.(((((......)))))...))).))))))))))).......))))))((((..((((((((((..(((((....)))..(((.(((.(((.((((((.......)))))).))).)))..)))..(((.(((.((((((...((.(((((((...((((...)))).....)))))))..))...)))))).......((((......))))....))).)))...................))..))))))))))..))))(((((........))))).....(((((((.(((((((((((..((((((((((..........))))(((((.((......)).)))))........)))))))))))))))))))).))))..........................................))))).).))))...

Thermodynamic Ensemble Prediction

(((.(((({((({((,((....}}.))).),},))}}))).)))((,({,{({{{{{,,(((((((.((((((({.,{{,{||,,,({{,.,|||...((((((.{(,.((((.((((.((...)).)))).)))),,)))))))))))))))).}|.))))).)))))))...||||||||{||{{{.,(((,.(,,(({{((({{({({......,,{{{{(({({{,,|{{|(({{((((({((({.(((,,((.,|.,.,(({{{((,,.||||{|{|,|||{{,.,,..}|{||,.....|)))).,}},((((.....))))..}}.....|||||{{||||{{,,..,,...|||||{{(||,|,.||,,,,,,,||,,,}|..,||||||}},.||||..,,,,||||,.||}},||}}}||||.,||||}}}|..{{|{|||(,.{{{{{..{||||||,{{{{((((((({.(((({{(((.((((((((((.....,|||||(({{{{{{{{|||.((((((.(((((,.,{(((({{(((((({{,,,.,,,,,|,..,}}))))))))))}.,)))))).)))))}..(,({{{(((((((((..|........}..)))))))))}}||,|({{,..,,,||||{((((((((((((.((((((((..((((....)))).))...))))))..(((((......)))))..(((((....)))))((((...(((.,.{.(((.((((..,..(((((...(((.{.......)))...)))))..,.)))))))}.,)))...))))..))))))))))))},,(,,(((....)))})))}}.}|,||||}}}}}.))}),)}}}})))))))}},,.....{(((({.......},,)}}}||,|,.{.{{{{{{....))))))}}}))}...,,....|,,,,})))}})))))))).,,,.,,}}}||,|||((((((,,.,{{,|||||||||,..{{|||,.|,,,..,...,|||..,|{{{{||,.{|({{|...,|,||||||},},}||||||||||.{{((.{,,(((.,{(((,{{{.((.,,..,,.|,{|||{|||{|,..,.|||||||||{||||,,.,{|||,,{,|,|}}}|||||||{{,{{,,||,.}),}},.,..,|||||......||,....}}}..}})))}}},,{{||{,,{({{,(((((((.......)))).)))..)),..}}..))))),...||||...{((.(((.((((....))))..)))))),})))})}}|.,)},,,{|||||,}}|||.,)),,,,.}},,},,},,,.}))},|,,.}}}}}.}.}}}.}},.}}.),)))))}))))})))}})})),))))))),.....||{..,.)),,,)),.|||||,.,||||,,,.,,))}))}},),,.)))},},.||{((.{(({,{{.{(((((..((((((((((..(((((....)))..(((.(((.(((.((((((.......)))))).))).)))..)))..{{{,(((,,,{(((,..{{,({{{{{{...{|,|,,}}))}...,,)))||||,,|,..,|||},,,,..,,,((((......))},....}}}.))),,}.,...},,,.,..}}}))..))))))))))..)))))),)),)))}},}))........{((((((.(((((((((({..((((((((((..........))))(((((.((......)).)))))........)))))))))))))))))))).)))}......................,,{{,.{{{.,......,}}})))),,}))),...