Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_022365.4
Sequence Length
2100 nt
GC Content
0.5143
ACUGUGCAGCCCAGGCGCCGGGCGCUGCCUCUACAGCUGUGUGUAGGCCUGGGGGCGAGGGUCUUCGGAACGUAGCGCUGGCUGCGGCCCCGCCCGCCUACCCACCCGCCCGUCCGGCAGCCGGCUCCCGCCGCCUCCGCGCUCUGUCUGGGGCCAGCCACCUGGCGGGCCGCUCCGGUGCGCCUGCCCGCGCUUUUCACUGACAGGCGCUGUUCCCCACAGCCAGCGCCGCCCGCCACGUCCCAGCUCUCGGCCAACGGAGCUGCGCGGCGGGUGACCUUUCCGAGCCCAGCGCGAUGACGGCUCCUUGCUCCCAGCCGGCGCAGCUUCCUGGACGCCGCCAGCUCGGGCUGGUGCCGUUCCCGCCGCCGCCGCCGCGGACGCCGCUGCUGUGGCUGCUGCUGCUGCUGCUGGCCGCCGUGGCGCCGGCGCGCGGCUGGGAGAGCGGAGACCUGGAGUUGUUUGACUUAGUGGAGGAGGUGCAGCUCAACUUCUACCAGUUCCUCGGGGUGCAGCAGGAUGCAUCAUCUGCAGACAUCAGAAAAGCAUAUCGUAAGCUUUCACUAACUUUACAUCCAGACAAGAAUAAAGAUGAAAAUGCAGAAACUCAGUUUAGACAAUUGGUGGCCAUUUAUGAAGUUUUAAAGGAUGAUGAACGAAGGCAGAGGUAUGAUGAUAUUCUGAUCAAUGGACUUCCAGAUUGGCGACAGCCUGUAUUCUACUACAGGCGGGUGAGAAAAAUGAGCAAUGCUGAGCUGGCAUUACUCUUGUUCAUUAUUCUCACAGUGGGUCAUUAUGCUGUGGUUUGGUCAAUCUACCUGGAAAAACAACUGGAUGAACUACUAAGUAGAAAAAAGAGAGAAAAGAAAAAAAAGACUGGCAGCAAGAGUGUGGAUGUAUCAAAACUCGGUGCUUCAGAAAAAAAUGAAAGAUUGCUGAUGAAACCACAGUGGCAUGAUUUGCUUCCAUGCAAACUGGGGAUUUGGUUUUGCCUUACACUAAAAGCAUUACCUCACCUCAUCCAGGAUGCUGGGCAGUUUUAUGCUAAAUAUAAAGAAACAAGAUUGAAGGAAAAGGAAGAUGCACUGACUAGAACUGAACUUGAAACACUUCAAAAACAGAAGAAAGUUAAAAAACCAAAACCUGAAUUUCCUGUAUACACACCUUUAGAAACUACAUAUAUUCAGUCUUAUGAUCAUGGAACUUCCAUAGAAGAAAUUGAGGAACAAAUGGAUGAUUGGUUGGAAAACAGGAACCGAACACAGAAAAAACAGGCACCUGAAUGGACAGAAGAGGACCUCAGCCAACUGACAAGAAGUAUGGUUAAGUUCCCAGGAGGGACUCCAGGUCGAUGGGAAAAGAUUGCCCACGAAUUGGGUCGAUCUGUGACAGAUGUGACAACCAAAGCCAAGCAACUGAAGGAUUCAGUGACCUGCUCCCCAGGAAUGGUUAGACUCUCCGAACUCAAAUCGACAGUUCAGAAUUCCAGGCCCAUCAAAACGGCCACCACCUUGCCCGAUGACAUGAUCACCCAGCGAGAGGACGCAGAGGGGGUGGCAGCGGAGGAGGAGCAGGAGGGAGACUCCGGUGAGCAGGAGACCGGGGCCACUGAUGCCCGGCCUCGGAGGCGGAAGCCAGCCAGGCUGCUGGAGGCUACAGCGAAGCCGGAGCCAGAGGAGAAGUCCAGAGCCAAGCGGCAGAAGGACUUUGACAUAGCAGAACAAAACGAGUCCAGCGACGAGGAGAGCCUGAGAAAAGAGAGAGCUCGGUCUGCAGAGGAGCCGUGGACUCAAAAUCAACAGAAACUUCUGGAACUGGCGUUGCAGCAGUACCCAAGGGGAUCCUCUGACCGCUGGGACAAAAUAGCCAGAUGUGUCCCGUCCAAGAGCAAGGAAGACUGUAUCGCUAGGUACAAGUUGCUGGUUGAACUGGUCCAAAAGAAAAAACAAGCUAAAAGCUGAAUAUUCUGGGAGAUGAUGUUCACCUUCAUUUUCCAAAAUGAAUAUCUUAAAAAUCUUAUGCAGAAAUUUGCAUUUUGUACCUCAAUAUUUCUACGUCAUGUGCCUUAGUAAAAAAAAAUAAUAAAUAAAUAAAAGAUGA

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-722.80 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -755.33
Frequency: 0.0000
Diversity: 527.93
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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