Sequence Details

BLAST PRIMER
Symbol
NM_024046.5
Sequence Length
2998 nt
GC Content
0.5740
GAUGCUGGAGGUUCGCUAGCCGAAGCGGCUGCAUCUGGCGCCGCGUCUGCCCCGCGUGCUCGGAGCGGAUUCUGCCCGCCGUCCCCGGAGCCCUCGGCGCCCCGCUGAGCCCGCGAUCACUUCCUCCCUGUGACCAACCGGCGCUGCAGGUUAGAGCCUGGCAAUGCCGUUUGGGUGUGUGACUCUGGGCGACAAGAAGAACUAUAACCAGCCAUCGGAGGUGACUGACAGAUAUGAUUUGGGACAGGUCAUCAAGACUGAGGAGUUUUGUGAAAUCUUCCGGGCCAAGGACAAGACGACAGGCAAGCUGCACACCUGCAAGAAGUUCCAGAAGCGGGACGGCCGCAAGGUGCGGAAAGCUGCCAAGAACGAGAUAGGCAUCCUCAAGAUGGUGAAGCAUCCCAACAUCCUACAGCUGGUGGAUGUGUUUGUGACCCGCAAGGAGUACUUUAUCUUCCUGGAGCUGGCCACGGGGAGGGAGGUGUUUGACUGGAUCCUGGACCAGGGCUACUACUCGGAGCGAGACACAAGCAACGUGGUACGGCAAGUCCUGGAGGCCGUGGCCUAUUUGCACUCACUCAAGAUCGUGCACAGGAAUCUCAAGCUGGAGAACCUGGUUUACUACAACCGGCUGAAGAACUCGAAGAUUGUCAUCAGUGACUUCCAUCUGGCUAAGCUAGAAAAUGGCCUCAUCAAGGAGCCCUGUGGGACCCCCGAGUAUCUGGCCCCAGAGGUGGUAGGCCGGCAGCGGUAUGGACGCCCUGUGGACUGCUGGGCCAUUGGAGUCAUCAUGUACAUCCUGCUUUCAGGCAAUCCACCUUUCUAUGAGGAGGUGGAAGAAGAUGAUUAUGAGAACCAUGAUAAGAAUCUCUUCCGCAAGAUCCUGGCUGGUGACUAUGAGUUUGACUCUCCAUAUUGGGAUGAUAUUUCGCAGGCAGCCAAAGACCUGGUCACAAGGCUGAUGGAGGUGGAGCAAGACCAGCGGAUCACUGCAGAAGAGGCCAUCUCCCAUGAGUGGAUUUCUGGCAAUGCUGCUUCUGAUAAGAACAUCAAGGAUGGUGUCUGUGCCCAGAUUGAAAAGAACUUUGCCAGGGCCAAGUGGAAGAAGGCUGUCCGAGUGACCACCCUCAUGAAACGGCUCCGGGCACCAGAGCAGUCCAGCACGGCUGCAGCCCAGUCGGCCUCAGCCACAGACACUGCCACCCCCGGGGCUGCAGGUGGGGCCACAGCUGCAGCUGCGAGUGGAGCUACCUCAGCCCCUGAGGGUGAUGCUGCUCGUGCUGCAAAGAGUGAUAAUGUGGCCCCCGCAGACCGUAGUGCCACCCCAGCCACAGAUGGAAGUGCCACCCCAGCCACUGAUGGCAGUGUCACCCCAGCCACCGAUGGAAGCAUCACUCCAGCCACUGAUGGGAGUGUCACCCCAGCCACUGACAGGAGCGCUACUCCAGCCACUGAUGGGAGAGCCACACCAGCCACAGAAGAGAGCACUGUGCCCACCACCCAAAGCAGUGCCAUGCUGGCCACCAAGGCAGCUGCCACCCCUGAGCCGGCUAUGGCCCAGCCGGACAGCACAGCCCCAGAGGGCGCCACAGGCCAGGCUCCACCCUCUAGUAAAGGGGAAGAGGCUGCUGGUUAUGCCCAGGAGUCUCAAAGGGAGGAGGCCAGCUGAGUAGGCAGCCUGGUGAGGGGGGGCAGGGGAUGGGCAGGAGGGUGGGAGAGUGGAUGAGGGGCUUCUCACUGUACAUAGAGUCACUGGCAUGAUGCCCUCGCUCCCCCAUGCCCCCACAUCCCAGUGGGGCAUAACUAGGGGUCACGGGAGAGCAGUCUCGUCUCCUGUGUGUAUGUGUGUGAGUGGUGGGCAGGCCAGUGGCAGGGCCGGCCCCAGCCCCUGCAUGGAUUCCUUGUGGCUUUUCUGUCUUUUGCUAGCUUCACCAGUUUCUGUUCCUUGUGGGAUGCUGCUCUAGGGAUACUCAGGGGGCUCCUGCUCUCCUUCCCCUUCCCUUCUUGCCUCACCAUUCCCCUAGGCAGGCCCUGCAGGUCCCACACUCUCCCAGGCCCUAAACUUGGGCGGCCUUGCCCUGAGAGCUGGUCCUCCAGCGAGGCCCUGUCAGCGGUCUUAGGCUCCUGCACAUGAAGGUGUGUGCCUGUGGUGUGUGGGCUGCUCUAGGAGCAGAUACAGGCUGGUAUAGAGGAUGCAGAAAGGUAGGGCAGUAUGUUUAAGUCCAGACUUGGCACAUGGCUAGGGAUACUGCUCACUAGCUGUGGAGGUCCUCAGGAGUGGAGAGAAUGAGUAGGAGGGCAGAAGCUUCCAUUUUUGUCCUUCCUAAGACCCUGUUAUUUGUGUUAUUUCCUGCCUUUCCGAGUCCUGCAGUGGGCUGCCCUGUACCCUGAACCUCAUGAGCCUCUAAGGGAAAGGAGGAACAAUUAGGACGUGGCAAUGAGACCUGGCAGGGCAGAGUACAAGCCCAGCACCCAGUGUCCCAGCCUUACUGGGUCCUUACCCUGGGCCAAACAGGGAGGGCUGAUACCUCCUUGCUCUUCCUAGAUGCCCACCUCCUACAAUCUCAGCCCACAAGUCCUCUCCACCCUAGGGGGCUUGCUGCAUGGCAAUAACUCAUAAUCUGAUUUGGAGGUUUGCCCUUUACAGGGGCAGAUUUUCUGCUCAGUUCAACAAUGAAAUGAAGAGGAACUCCCUCUUUCUACAGCUCACUUCUAUCAGAGGCCCAGGUGCCUCAGAGCCACAUUGAGUUGCUUUUUCUGGGAUGAGGAAGUAGGGUUAAACUCCCCAGUUUCCUGAGGGAGGCUCCUGACAGGUGCCCUUUGUCAGACCCUACCACAGCCUGGAUAGGCAGCCACAUUGGUCCUCGCCCUUGCUCGGCACUCCGUGGUGGUCCUGCCCUUCUCCCUGCAUGCCUGUGGGUCUGCUCUGGUGUGUGAAGGUCGGUGGGUUAACUGUGUGCCUACUGAACCUGGCAAAUAAACAUCACCCUGCAAAGCC

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Predictions for this specific transcript isoform.
Minimum Free Energy
-1204.60 kcal/mol
Ensemble Metrics
Free Energy: -1256.39
Frequency: 0.0000
Diversity: 890.33
Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((.(((((((.(((((...)))))))....((((.((.((((((.(((......))).))))))..))..))))((((((((((..(((((((...))))))).......((((.........))))((((.(((((.(((((((....)))).))).))))).))))........))))))).))).....)))))....)))))((((((((..((((.((((.((((....((((....(((.(((((((....))))))))))........((((..(((((.........((((.(((.(.(((((((..(..(((((......)))))..).)).))))).)...)))))))........(((((((((((((..(((((((((((((((((.((....(((((((((((((..((....((((((((((((((.((........((((.(((((((.(.((((....(((.....)))...)))).).((((((((.(((((((..((.........))..)).)))).)...))))))))..((((((((((...(.(((.((((((....((((((((((..((((......)))).)))((((......))))(((((.....(((......(((((((((((((((((((((((((.((((.(....((((((((((..(.(((((((.(((.............((((.......(((((((((((((.(.(((.((.(.(((.((((((((((((((((..(((((((.(((((.(((.(((.((((((((((((((((...((.(((.((((((((.........((((((.....)))))).....(((((((.(((.(((((..((((((........((((.((.((((((.(((.((.......)).))).(((((...(((...)))....))))))))))))).))))...)))))))))))..))).)))))))))))))))))))))))))))((((((((..((...((((...(((.(((((....)))))))).....))))......))....)))))))))))...)))))).))).))).)(((........)))))))...)))))))))).))..))))))))).)).)))).)))))).))))))))..))))).......))))))).))))))).).)))))))))))))))(((((.((((((((.....((((((...))))))......))))))))))))).............((((((..((.....))..).)))))...))))..))))))))))((.......)))))))))))))(((.(((((((........((((........))))........)))).))).)))((((..((.((.(.((((.....)))).).)).)).)))).)))......)))))((((.((((((.(((((.(((...((((..((..(((((..(((.(((.....)))..(((((.(((((..(((((((........(((...((((...((((....))))......((((...((((..(((((.....)))))..((((((.((((......)))).))))))....))))..)))).))))....))))))).)))..))))))))))((((((((..((.(.(((((.(((((.....(((((.(((((.((.((.....)))).)))...)).)))))))))).))))).))))).)))))))))..)))))..))..))))...)))...)))))))).))).)))))))))))....))))))))).).)))))).))))..))))))).)))).........))))))))))))).......)))....))..).))))))))...))))....)))))))))))((...(((((.....(((((((....)).)))))......)))))....)).))))))))..(((..((((...))))))).(((((((...(((((((((.......))))(((((.(((((((.((..((.((((....)))))))).)))).)))...)))))...((((((......))))))))).)).)))))))((((((...))))))((((......)))).)))))))).....(((.(((((((((.((((.(.(((...........)))))))).))))))))))))(((((((((((((((((((.((((((((......((((((((((((((......)))))).))))))))..........(((((((....(((((.((((((((((...(((((.((....)))))))...(((...))).....)))....))))))))))))....(((((.((((((...((....(((((((.((.(((..(((((((.((((((((.........)))))))).))..(((((.......))))).)))))..))))))))))))....))...)).)))).)))))...........))))))).))))))))))).)))))))((((....))))............((((...((((((((((((((...))))))))))))))...))))((((....))))...((((((.....))))))))))))))).....))))).(((((......)))))...(((((...((((.(((......(((.(((((..(((((((....((((((((....))).)))))....((((((((.....)))))))))))))))....((((....)))).((((...))))))))))))......))))))).))))).)))))))))...))))..)))).)))).))))..))))))))(((..((((((((((((.........)))))))).)))).))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{(((((,((({(((,{((({..,|||||||...,(((({{{{({{{((.{((||,{|,|||,||||,....|||})},(((({{(({{{.(((((((...)))))))..||{{,,((({{{{{{{{{|||,((((.(((((.(((((((....)))),})).))))).)))),,,.|,,.|||||||.}}}.....}}}}}....|||||||||({{({{{{,{,,{{,.,.,,,,{{((({.,,,((({(({{{(({{{{||||||||,...{{{(((,.{,,..||},.|||,.,,,((({.(((,(.({({(({..{..(((((......)))))..|.)),.)))),,|..}}}}}}}..,..,||{,,,|||,|||||,...}|||||.,,.|||||{(((((.{(.....}})))))),|||||{.,||}},}}|{||,|,,|,||||||||,.}}}|},}})))))))})))})}.}}}.,,|{,{{|{{..{(((((({.{{{({((..((.........))..)),))}}.},,.}}}}}}}}((((....))))...((((({(......)}..)))))))))}.}}||,.(((((((...,,((((......))))(((((..{.....,...{{(((((((((((((((((((((((((..(((,,....|(((((({{{..{,||{((((,(((.,....,....,,{||{,,,,..,(((((((((((((.(.(((.((.(.(((.((((((((((((((((..{((((((.(((((.{((.(((.((((({((({{(((((,,,({.{((.((((((((.........((((((.....)))))).....,((((((.(((.(((((..((((((........((((.((.((((((.{((.((.......)).))}.(((((...(((...)))....))))))))))))).))))..})))))))))))..))).))))))|))))))))))})})))))}}((((((((..((...((((...(({{(((((....)))))))).....))))......))....)))))))))))...)))))).})).)))..{{{.|......}})))))...))))))}))).))}.,)))))))},)).)))).)))))).))))))))..))))).,,,,,,||||,}}.}|}||||,}.||||||||||||||{(((((.((((((((.....((((((...))))))..,...)))))))))))))}...........,||||||,,,({,...|},.},))}}}...}))),,,)))))}}))||.......)))))))})))))))}))....}))))...{|((,,..)})}.)))))))...,},))}),)),}))}}||||||.||{.{,||||||,,.}}}}}}},.,||.|||||||||{,{{{{,{{{,,,,...,{,((({{{{,,,,,,,,,,....||}}}||{{,(((((((.{{..(((....)))..{{{{({((((|{{.||||,|.|{.||.,.||...{(((,.,.}))}|||}..)))}.)))}}..{({({{.....}))))..((((((,((((......)}||,}|||||..||||.}|,||||}}|||,(((((..((((((,(((({(((({((((((,(((,(((((((,((((({({({,..,((((((.{({.{{{,...,,,.(((((((((....(((((((((((((((((((((((((......))))))))).....)))).(((((((((.,......,)))))))))...........)))))).))))).))))))))),|||..}})))),|((((({...({{{((((,{.(((......},}....{{.{({.,{.{{{,.....,,,,,...})))).)))))..,)))))}.),,}))))}))))))))))))).))),}}))))))))}))}}}}}..}}}}}}.|{|{{|,,)))).,)}}}}...))))))))}||||,...,,,))}}|||||}|}}}||.,,({{((..,,)))))}|})|}}}}}})).)))}}}|}}))}}}{(((((...|||)}},))))}}))))})))))}}})})).|||{|{{{{{{{|||,,|{{..|||||,||{{...(((.(((((((((.((({,(.(((...........)))))))).))))))))))))(((((((((((((((((((.((((((((......((((((((((((({......})))))))))))))).,,,......{{(((((....{((((.((((((({{{,,,{{{{(.((,,,.}}}}))}.,,{{,...}},.,.,.}}}....)))))))))))}....(((((.((((((...{(....(((((((.((.(((..((((({(.((((((((.........)))))))).)}..(((((.......))))).)))))..))))))))))))....})...))})))).)))))...........))))))).))))))))))).)))))))((((....))))............((((...((((((((((((({...})))))))))))))...)))){(({....)))}..{((((((.....))))))))))))))).....,,.||.(((((......))))).}}(((((,,.((({{(((......(((.(((((..(((((((....((((((((....))).)))))....((((((((.....}))))))))))))))....((({....)))).|(({...))))))))))))..,...))))))).)))))}))})))).,))))}..})).,))))))..))))))))))))|||{,,{(((((((((((.........)))))))),,))),,},......}}})}})},,,......
Back